RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	KCNQ1	P51787	676 aa		20.53	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	PTPN11	Q06124	597 aa	Predicted RBP	20.53	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	PGM5	Q15124	567 aa		20.53	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM47C	Q5HY64	1035 aa		20.53	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	TMTC2	Q8N394	836 aa		20.53	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	RETREG2	Q8NC44	543 aa		20.53	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	AFG1L	Q8WV93	481 aa		20.53	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	CERS4	Q9HA82	394 aa		20.53	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		20.53	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	KIF28P	B7ZC32	967 aa		20.52	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	20.52	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	PITPNM1	O00562	1244 aa		20.52	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	IQCF3	P0C7M6	154 aa		20.52	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	POLR2M	P0CAP2	368 aa		20.52	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	PLA2G5	P39877	138 aa		20.52	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	LIFR	P42702	1097 aa		20.52	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		20.52	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	TET1	Q8NFU7	2136 aa		20.52	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM122A	Q96E09	287 aa		20.52	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	MYL10	Q9BUA6	226 aa		20.52	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	COG5	Q9UP83	839 aa		20.52	■□□□□ 0.88
MRPL28-203	ENST00000429738	EPOP	A6NHQ4	379 aa		20.51	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	KIF5B	P33176	963 aa		20.51	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	HERC6	Q8IVU3	1022 aa		20.51	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	IL31RA	Q8NI17	732 aa		20.51	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	20.51	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	20.51	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		20.51	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	FRMPD4	Q14CM0	1322 aa		20.51	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		20.5	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	TAP1	Q03518	808 aa		20.5	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	BFSP2	Q13515	415 aa		20.5	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	SESTD1	Q86VW0	696 aa		20.5	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		20.5	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	KAT2B	Q92831	832 aa		20.5	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		20.5	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	20.5	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	20.49	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	20.49	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	GNAQ	P50148	359 aa		20.49	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	LAMC2	Q13753	1193 aa		20.49	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	KRT40	Q6A162	431 aa		20.49	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		20.49	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		20.49	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	20.49	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	PPTC7	Q8NI37	304 aa		20.49	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		20.49	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		20.48	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	CCDC69	A6NI79	296 aa		20.48	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	TLL1	O43897	1013 aa		20.48	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		20.48	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	TGFB3	P10600	412 aa		20.48	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	20.48	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	DGKD	Q16760	1214 aa		20.48	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		20.48	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		20.48	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	20.48	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	NOD1	Q9Y239	953 aa		20.48	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	BAIAP3	O94812	1187 aa		20.47	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	ARHGEF15	O94989	841 aa		20.47	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	CALM1	P0DP23	149 aa		20.47	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	CALM2	P0DP24	149 aa		20.47	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	CALM3	P0DP25	149 aa		20.47	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	CCND2	P30279	289 aa		20.47	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	SP2	Q02086	613 aa		20.47	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		20.47	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	RNF20	Q5VTR2	975 aa		20.47	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		20.47	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		20.47	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	HLA-C	Q95604	372 aa		20.47	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		20.47	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		20.47	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	HAS3	O00219	553 aa		20.46	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	PIK3CD	O00329	1044 aa		20.46	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	MEIS2	O14770	477 aa		20.46	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	CDC45	O75419	566 aa		20.46	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	F2	P00734	622 aa		20.46	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	RXRA	P19793	462 aa		20.46	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	UBA1	P22314	1058 aa	Known RBP	20.46	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	20.46	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	GRB10	Q13322	594 aa		20.46	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	20.46	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	20.46	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	20.46	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	EPHX3	Q9H6B9	360 aa		20.46	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		20.46	■□□□□ 0.87
MRPL28-203	ENST00000429738	STAM2	O75886	525 aa		20.45	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	KCNJ6	P48051	423 aa		20.45	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	20.45	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	PTGIS	Q16647	500 aa		20.45	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		20.45	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	20.45	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	20.45	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	CAGE1	Q8TC20	777 aa		20.45	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		20.45	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	20.45	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	20.45	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	NEK1	Q96PY6	1258 aa		20.45	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	SEC63	Q9UGP8	760 aa	Known RBP	20.45	■□□□□ 0.86
MRPL28-203	ENST00000429738	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		20.44	■□□□□ 0.86

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