RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, human

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
POLR1A-204	ENST00000424089	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	11.27	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	USP11	P51784	963 aa		11.27	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	ATP2B2	Q01814	1243 aa		11.27	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	SPAG1	Q07617	926 aa		11.27	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	AP3B2	Q13367	1082 aa		11.27	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	MOGS	Q13724	837 aa		11.27	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	CCDC144B	Q3MJ40	725 aa		11.27	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		11.27	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		11.27	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		11.27	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		11.27	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		11.27	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	IGSF22	Q8N9C0	903 aa		11.27	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	ANKLE1	Q8NAG6	615 aa		11.27	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		11.27	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		11.27	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	CALML4	Q96GE6	196 aa		11.27	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	NAP1L5	Q96NT1	182 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	MTMR9	Q96QG7	549 aa		11.27	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	TMEM60	Q9H2L4	133 aa		11.27	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	CPVL	Q9H3G5	476 aa		11.27	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		11.27	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	KBTBD4	Q9NVX7	518 aa		11.27	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	PNMA3	Q9UL41	463 aa		11.27	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		11.27	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		11.27	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	PTPRF	P10586	1907 aa		11.27	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	DOCK1	Q14185	1865 aa		11.26	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089		F5H6K3	240 aa		11.26	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	CCP110	O43303	1012 aa		11.26	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	RPN1	P04843	607 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	SKIL	P12757	684 aa		11.26	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	11.26	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	KLRC3	Q07444	240 aa		11.26	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	STIM1	Q13586	685 aa		11.26	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	CUL4B	Q13620	913 aa		11.26	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	SEPT2	Q15019	361 aa		11.26	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		11.26	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		11.26	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	CABP7	Q86V35	215 aa		11.26	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		11.26	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	VSTM4	Q8IW00	320 aa		11.26	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		11.26	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	GDF15	Q99988	308 aa		11.26	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	AMN	Q9BXJ7	453 aa		11.26	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	11.26	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	SH2D4A	Q9H788	454 aa		11.26	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	11.26	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		11.26	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	STK17A	Q9UEE5	414 aa		11.26	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	RWDD2A	Q9UIY3	292 aa		11.26	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		11.26	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	STK24	Q9Y6E0	443 aa		11.26	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		11.25	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	PPP1R3G	B7ZBB8	358 aa		11.25	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	USP17L10	C9JJH3	530 aa		11.25	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	PLA2G6	O60733	806 aa		11.25	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	BMP3	P12645	472 aa		11.25	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	ATP1A3	P13637	1013 aa		11.25	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	PTPRA	P18433	802 aa		11.25	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	CALCRL	Q16602	461 aa		11.25	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		11.25	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		11.25	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	COBLL1	Q53SF7	1204 aa		11.25	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	TTBK2	Q6IQ55	1244 aa		11.25	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	TMC6	Q7Z403	805 aa		11.25	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		11.25	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	C7orf25	Q9BPX7	421 aa		11.25	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		11.25	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	GINM1	Q9NU53	330 aa		11.25	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		11.25	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	LAMA3	Q16787	3333 aa		11.24	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		11.24	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	LRRC10B	A6NIK2	292 aa		11.24	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	RHOBTB3	O94955	611 aa		11.24	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	HMGCR	P04035	888 aa		11.24	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	CYP3A7	P24462	503 aa		11.24	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	MAP3K10	Q02779	954 aa		11.24	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	LRMP	Q12912	555 aa		11.24	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		11.24	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	NAALADL2	Q58DX5	795 aa		11.24	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		11.24	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		11.24	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	KCTD1	Q719H9	257 aa		11.24	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		11.24	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		11.24	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	TDH	Q8IZJ6	230 aa		11.24	□□□□□ -0.61
POLR1A-204	ENST00000424089	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		11.24	□□□□□ -0.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms