RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421510.5

EHD1-204, Transcript of EH domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene EHD1, Length 1,015 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1-204ENST00000421510 SMARCA1P28370 1054 aa23.55■■□□□ 1.36
EHD1-204ENST00000421510 RABGGTBP53611 331 aa23.55■■□□□ 1.36
EHD1-204ENST00000421510 KIAA0753Q2KHM9 967 aa23.55■■□□□ 1.36
EHD1-204ENST00000421510 HSDL1Q3SXM5 330 aa23.55■■□□□ 1.36
EHD1-204ENST00000421510 C7orf31Q8N865 590 aa23.55■■□□□ 1.36
EHD1-204ENST00000421510 CAGE1Q8TC20 777 aa23.55■■□□□ 1.36
EHD1-204ENST00000421510 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
EHD1-204ENST00000421510 PRDM12Q9H4Q4 367 aa23.55■■□□□ 1.36
EHD1-204ENST00000421510 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
EHD1-204ENST00000421510 GBF1Q92538 1859 aa23.55■■□□□ 1.36
EHD1-204ENST00000421510 TGFB3P10600 412 aa23.54■■□□□ 1.36
EHD1-204ENST00000421510 ACTN1P12814 892 aa23.54■■□□□ 1.36
EHD1-204ENST00000421510 LIFRP42702 1097 aa23.54■■□□□ 1.36
EHD1-204ENST00000421510 GNAQP50148 359 aa23.54■■□□□ 1.36
EHD1-204ENST00000421510 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa23.54■■□□□ 1.36
EHD1-204ENST00000421510 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
EHD1-204ENST00000421510 AFAP1L1Q8TED9 768 aa23.54■■□□□ 1.36
EHD1-204ENST00000421510 LRRC2Q9BYS8 371 aa23.54■■□□□ 1.36
EHD1-204ENST00000421510 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP23.54■■□□□ 1.36
EHD1-204ENST00000421510 SLC28A3Q9HAS3 691 aa23.54■■□□□ 1.36
EHD1-204ENST00000421510 PPFIA4O75335 1185 aa23.53■■□□□ 1.36
EHD1-204ENST00000421510 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
EHD1-204ENST00000421510 GNPTABQ3T906 1256 aa23.53■■□□□ 1.36
EHD1-204ENST00000421510 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
EHD1-204ENST00000421510 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
EHD1-204ENST00000421510 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa23.53■■□□□ 1.36
EHD1-204ENST00000421510 CALM1P0DP23 149 aa23.52■■□□□ 1.36
EHD1-204ENST00000421510 CALM2P0DP24 149 aa23.52■■□□□ 1.36
EHD1-204ENST00000421510 CALM3P0DP25 149 aa23.52■■□□□ 1.36
EHD1-204ENST00000421510 MYOGP15173 224 aa23.52■■□□□ 1.36
EHD1-204ENST00000421510 RBL2Q08999 1139 aa23.52■■□□□ 1.36
EHD1-204ENST00000421510 USP17L6PQ6QN14 398 aa23.52■■□□□ 1.36
EHD1-204ENST00000421510 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa23.52■■□□□ 1.36
EHD1-204ENST00000421510 CUL5Q93034 780 aa23.52■■□□□ 1.36
EHD1-204ENST00000421510 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
EHD1-204ENST00000421510 MLXIPQ9HAP2 919 aa23.52■■□□□ 1.36
EHD1-204ENST00000421510 SLC12A7Q9Y666 1083 aa23.52■■□□□ 1.36
EHD1-204ENST00000421510 MYH7BA7E2Y1 1941 aa23.51■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 PIK3CDO00329 1044 aa23.51■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 STAM2O75886 525 aa23.51■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 SELPP16109 830 aa23.51■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 LRRC8DQ7L1W4 858 aa23.51■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 USP38Q8NB14 1042 aa23.51■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 BCAS3Q9H6U6 928 aa23.51■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 MEIS2O14770 477 aa23.5■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 ICAM3P32942 547 aa23.5■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 SEMA3FQ13275 785 aa23.5■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 RNF20Q5VTR2 975 aa23.5■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 PPP2R2DQ66LE6 453 aa23.5■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 SLC9A7Q96T83 725 aa23.5■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 C16orf70Q9BSU1 422 aa23.5■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 RTEL1Q9NZ71 1219 aa23.5■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 EYSQ5T1H1 3165 aa23.49■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 UNC80Q8N2C7 3258 aa23.49■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa23.49■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 FIBPO43427 364 aa23.49■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 CKBP12277 381 aa23.49■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 PTK7Q13308 1070 aa23.49■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 ADGRE1Q14246 886 aa23.49■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 GPNMBQ14956 572 aa23.49■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 PCNX4Q63HM2 1172 aa23.49■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 TMTC3Q6ZXV5 915 aa23.49■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 SGMS1Q86VZ5 419 aa23.49■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 MICU3Q86XE3 530 aa23.49■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa23.48■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 BAIAP3O94812 1187 aa23.48■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 HIC1Q14526 733 aa23.48■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 FANCBQ8NB91 859 aa23.48■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 WNT8BQ93098 351 aa23.48■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 NOP56O00567 594 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 CDC45O75419 566 aa23.47■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 LGALS2P05162 132 aa23.47■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 NEDD9Q14511 834 aa23.47■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 XRRA1Q6P2D8 792 aa23.47■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 METTL7BQ6UX53 244 aa23.47■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 CYFIP1Q7L576 1253 aa23.47■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 CCDC82Q8N4S0 544 aa23.47■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa23.47■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 NEK1Q96PY6 1258 aa23.47■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 PSTPIP2Q9H939 334 aa23.47■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 CHD9Q3L8U1 2897 aa23.46■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 A0A0C4DFX4 3053 aa23.46■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 H3BRB1 525 aa23.46■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 NBNO60934 754 aa23.46■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 PARNO95453 639 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 CA3P07451 260 aa23.46■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 TRAF7Q6Q0C0 670 aa23.46■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 HERC6Q8IVU3 1022 aa23.46■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 TCEANC2Q96MN5 208 aa23.46■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 TET1Q8NFU7 2136 aa23.45■■□□□ 1.35
EHD1-204ENST00000421510 CXCL10P02778 98 aa23.45■■□□□ 1.34
EHD1-204ENST00000421510 IGFBP4P22692 258 aa23.45■■□□□ 1.34
EHD1-204ENST00000421510 KCNJ6P48051 423 aa23.45■■□□□ 1.34
EHD1-204ENST00000421510 UBE2SQ16763 222 aa23.45■■□□□ 1.34
EHD1-204ENST00000421510 ZNF618Q5T7W0 954 aa23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.7 ms