RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376303.6

SYP-202, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 2

Gene SYP, Length 858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-202ENST00000376303 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa20.36■□□□□ 0.85
SYP-202ENST00000376303 TMEM87BQ96K49 555 aa20.36■□□□□ 0.85
SYP-202ENST00000376303 SPATA33Q96N06 139 aa20.36■□□□□ 0.85
SYP-202ENST00000376303 SLC9A7Q96T83 725 aa20.36■□□□□ 0.85
SYP-202ENST00000376303 ALG1Q9BT22 464 aa20.36■□□□□ 0.85
SYP-202ENST00000376303 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
SYP-202ENST00000376303 HDAC6Q9UBN7 1215 aa20.36■□□□□ 0.85
SYP-202ENST00000376303 PRC1O43663 620 aa20.35■□□□□ 0.85
SYP-202ENST00000376303 STAM2O75886 525 aa20.35■□□□□ 0.85
SYP-202ENST00000376303 ZNF286BP0CG31 522 aa20.35■□□□□ 0.85
SYP-202ENST00000376303 PPP2R2DQ66LE6 453 aa20.35■□□□□ 0.85
SYP-202ENST00000376303 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
SYP-202ENST00000376303 LZTS2Q9BRK4 669 aa20.35■□□□□ 0.85
SYP-202ENST00000376303 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa20.35■□□□□ 0.85
SYP-202ENST00000376303 FRMPD4Q14CM0 1322 aa20.34■□□□□ 0.85
SYP-202ENST00000376303 BAIAP3O94812 1187 aa20.34■□□□□ 0.85
SYP-202ENST00000376303 SELPP16109 830 aa20.34■□□□□ 0.85
SYP-202ENST00000376303 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SYP-202ENST00000376303 GNAQP50148 359 aa20.34■□□□□ 0.85
SYP-202ENST00000376303 SP2Q02086 613 aa20.34■□□□□ 0.85
SYP-202ENST00000376303 GNPTABQ3T906 1256 aa20.34■□□□□ 0.85
SYP-202ENST00000376303 USP38Q8NB14 1042 aa20.34■□□□□ 0.85
SYP-202ENST00000376303 PIBF1Q8WXW3 757 aa20.34■□□□□ 0.85
SYP-202ENST00000376303 MLXIPQ9HAP2 919 aa20.34■□□□□ 0.85
SYP-202ENST00000376303 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
SYP-202ENST00000376303 DOCK5Q9H7D0 1870 aa20.34■□□□□ 0.85
SYP-202ENST00000376303 KAT6AQ92794 2004 aa20.33■□□□□ 0.85
SYP-202ENST00000376303 CCDC69A6NI79 296 aa20.33■□□□□ 0.85
SYP-202ENST00000376303 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SYP-202ENST00000376303 SLC27A2O14975 620 aa20.33■□□□□ 0.85
SYP-202ENST00000376303 MYOGP15173 224 aa20.33■□□□□ 0.85
SYP-202ENST00000376303 LIFRP42702 1097 aa20.33■□□□□ 0.85
SYP-202ENST00000376303 PTK7Q13308 1070 aa20.33■□□□□ 0.85
SYP-202ENST00000376303 ADGRE1Q14246 886 aa20.33■□□□□ 0.85
SYP-202ENST00000376303 NFXL1Q6ZNB6 911 aa20.33■□□□□ 0.85
SYP-202ENST00000376303 LRRC8DQ7L1W4 858 aa20.33■□□□□ 0.85
SYP-202ENST00000376303 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SYP-202ENST00000376303 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SYP-202ENST00000376303 MYL10Q9BUA6 226 aa20.33■□□□□ 0.85
SYP-202ENST00000376303 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 PTPRSQ13332 1948 aa20.32■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 SORBS3O60504 671 aa20.32■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 CALM1P0DP23 149 aa20.32■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 CALM2P0DP24 149 aa20.32■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 CALM3P0DP25 149 aa20.32■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 CKBP12277 381 aa20.32■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 IGFBP4P22692 258 aa20.32■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 ICAM3P32942 547 aa20.32■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 NECTIN1Q15223 517 aa20.32■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 CREB3L3Q68CJ9 461 aa20.32■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 CUL5Q93034 780 aa20.32■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 C16orf70Q9BSU1 422 aa20.32■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 KIF28PB7ZC32 967 aa20.31■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 PIK3CDO00329 1044 aa20.31■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 NEDD9Q14511 834 aa20.31■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 GPNMBQ14956 572 aa20.31■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa20.31■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 PPM1EQ8WY54 764 aa20.31■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 ANO2Q9NQ90 1003 aa20.31■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 TTC28Q96AY4 2481 aa20.3■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa20.3■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 FIBPO43427 364 aa20.3■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 CXCL10P02778 98 aa20.3■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 CA3P07451 260 aa20.3■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 KCNJ6P48051 423 aa20.3■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 BMP2KLQ5H9B9 411 aa20.3■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 XRRA1Q6P2D8 792 aa20.3■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 CNKSR3Q6P9H4 555 aa20.3■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 USP17L6PQ6QN14 398 aa20.3■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 HERC6Q8IVU3 1022 aa20.3■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 TRANK1O15050 2925 aa20.29■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 H3BRB1 525 aa20.29■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 NOP56O00567 594 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 MEIS2O14770 477 aa20.29■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 PLEKHA8P1O95397 391 aa20.29■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 PCNX4Q63HM2 1172 aa20.29■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 METTL7BQ6UX53 244 aa20.29■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 USP26Q9BXU7 913 aa20.29■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 RTEL1Q9NZ71 1219 aa20.29■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 SLC12A7Q9Y666 1083 aa20.29■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 NBNO60934 754 aa20.28■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 LGALS2P05162 132 aa20.28■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 TJAP1Q5JTD0 557 aa20.28■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 RNF20Q5VTR2 975 aa20.28■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 CYFIP1Q7L576 1253 aa20.28■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 SENP7Q9BQF6 1050 aa20.28■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 BCAS3Q9H6U6 928 aa20.28■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa20.27■□□□□ 0.84
SYP-202ENST00000376303 C17orf102A2RUQ5 167 aa20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.4 ms