RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373793.3

GGTA1P-201, Transcript of glycoprotein, alpha-galactosyltransferase 1 pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GGTA1P, Length 1,544 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTA1P-201ENST00000373793 NEMFO60524 1076 aa30.06■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 UIMC1Q96RL1 719 aa30.06■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 USP28Q96RU2 1077 aa30.06■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 MRVI1Q9Y6F6 885 aa30.06■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 SEMA3FQ13275 785 aa30.05■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 SCFD2Q8WU76 684 aa30.05■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 CHAMP1Q96JM3 812 aa30.05■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 CDHR1Q96JP9 859 aa30.05■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 NRBP1Q9UHY1 535 aa30.05■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 CLIC4Q9Y696 253 aa30.05■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa30.04■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 MAFGO15525 162 aa30.04■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 INHAP05111 366 aa30.04■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 CYBAP13498 195 aa30.04■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 ICAM3P32942 547 aa30.04■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 ANO1Q5XXA6 986 aa30.04■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 SH3TC2Q8TF17 1288 aa30.04■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 PKD2L1Q9P0L9 805 aa30.04■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 MSH4O15457 936 aa30.03■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 ADCYAP1R1P41586 468 aa30.03■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 TTLL4Q14679 1199 aa30.03■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 CALCRLQ16602 461 aa30.03■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 CCDC144BQ3MJ40 725 aa30.03■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 TRPV1Q8NER1 839 aa30.03■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 TMEM60Q9H2L4 133 aa30.03■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 PTGDRQ13258 359 aa30.02■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa30.02■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 KCNV1Q6PIU1 500 aa30.02■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 ZNF577Q9BSK1 485 aa30.02■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 DOCK5Q9H7D0 1870 aa30.02■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 MARCH6O60337 910 aa30.01■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 ARIH2O95376 493 aa30.01■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 TXNP10599 105 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 TGFB3P10600 412 aa30.01■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 NCLP19338 710 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa30.01■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 ATL3Q6DD88 541 aa30.01■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 KCNMB3Q9NPA1 279 aa30.01■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 POLR3EQ9NVU0 708 aa30.01■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 CEP131Q9UPN4 1083 aa30.01■■■□□ 2.4
GGTA1P-201ENST00000373793 ATP9AO75110 1047 aa30.01■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 CNGA1P29973 690 aa30.01■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 LY6KQ17RY6 165 aa30.01■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 ETNPPLQ8TBG4 499 aa30.01■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 GJA10Q969M2 543 aa30.01■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 CFAP45Q9UL16 551 aa30.01■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 KRT85P78386 507 aa30■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 SP2Q02086 613 aa30■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 IQSEC1Q6DN90 963 aa30■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 CCDC62Q6P9F0 684 aa30■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 C4orf32Q8N8J7 132 aa30■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 HAS1Q92839 578 aa30■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 TBX3O15119 743 aa29.99■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 BMP15O95972 392 aa29.99■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 OR52Z1P0C646 297 aa29.99■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 TMEM63BQ5T3F8 832 aa29.99■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 FAM184BQ9ULE4 1060 aa29.99■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 BAG4O95429 457 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 KCNA2P16389 499 aa29.98■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 SMPD1P17405 629 aa29.98■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 NASPP49321 788 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 TNFAIP2Q03169 654 aa29.98■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 PTPAQ15257 358 aa29.98■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 SLC5A5Q92911 643 aa29.98■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 FAM20AQ96MK3 541 aa29.98■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 MTMR9Q96QG7 549 aa29.98■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 LAD1O00515 517 aa29.97■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 AKR1A1P14550 325 aa29.97■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 STK38Q15208 465 aa29.97■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 SLFN12Q8IYM2 578 aa29.97■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 SENP7Q9BQF6 1050 aa29.97■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 SEPT4O43236 478 aa29.96■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 ADCY6O43306 1168 aa29.96■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 SORBS3O60504 671 aa29.96■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 TXKP42681 527 aa29.96■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 DUSP28Q4G0W2 176 aa29.96■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP29.96■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 LRCH2Q5VUJ6 765 aa29.96■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 COPS5Q92905 334 aa29.96■■■□□ 2.39
GGTA1P-201ENST00000373793 SDF4Q9BRK5 362 aa29.96■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms