RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 GMLQ99445 158 aa4.97□□□□□ -1.61
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PTPRC-201ENST00000348564 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 USO1O60763 962 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
PTPRC-201ENST00000348564 KINO60870 393 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
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PTPRC-201ENST00000348564 ZNF354CQ86Y25 554 aa4.97□□□□□ -1.61
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PTPRC-201ENST00000348564 NECTIN1Q15223 517 aa4.96□□□□□ -1.62
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PTPRC-201ENST00000348564 CES5AQ6NT32 575 aa4.96□□□□□ -1.62
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PTPRC-201ENST00000348564 SBK1Q52WX2 424 aa4.96□□□□□ -1.62
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PTPRC-201ENST00000348564 KANK3Q6NY19 840 aa4.96□□□□□ -1.62
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