RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 POTEDQ86YR6 584 aa31.48■■■□□ 2.63
GIPC1-201ENST00000345425 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP31.48■■■□□ 2.63
GIPC1-201ENST00000345425 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP31.48■■■□□ 2.63
GIPC1-201ENST00000345425 PTPN22Q9Y2R2 807 aa31.48■■■□□ 2.63
GIPC1-201ENST00000345425 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa31.48■■■□□ 2.63
GIPC1-201ENST00000345425 LAD1O00515 517 aa31.47■■■□□ 2.63
GIPC1-201ENST00000345425 HMGCRP04035 888 aa31.47■■■□□ 2.63
GIPC1-201ENST00000345425 ELNP15502 786 aa31.47■■■□□ 2.63
GIPC1-201ENST00000345425 NCLP19338 710 aaKnown RBP31.47■■■□□ 2.63
GIPC1-201ENST00000345425 ICAM3P32942 547 aa31.47■■■□□ 2.63
GIPC1-201ENST00000345425 NASPP49321 788 aaPredicted RBP31.47■■■□□ 2.63
GIPC1-201ENST00000345425 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP31.47■■■□□ 2.63
GIPC1-201ENST00000345425 KATNBL1Q9H079 304 aa31.47■■■□□ 2.63
GIPC1-201ENST00000345425 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP31.47■■■□□ 2.63
GIPC1-201ENST00000345425 TBX3O15119 743 aa31.46■■■□□ 2.63
GIPC1-201ENST00000345425 CALCRLQ16602 461 aa31.46■■■□□ 2.63
GIPC1-201ENST00000345425 SCFD2Q8WU76 684 aa31.46■■■□□ 2.63
GIPC1-201ENST00000345425 MRVI1Q9Y6F6 885 aa31.46■■■□□ 2.63
GIPC1-201ENST00000345425 TGFB3P10600 412 aa31.45■■■□□ 2.63
GIPC1-201ENST00000345425 PTGDRQ13258 359 aa31.45■■■□□ 2.63
GIPC1-201ENST00000345425 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa31.45■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 MARCH6O60337 910 aa31.45■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 BAG4O95429 457 aaKnown RBP31.45■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 YEATS4O95619 227 aa31.45■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 ARP10275 920 aa31.45■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF577Q9BSK1 485 aa31.45■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 KCNMB3Q9NPA1 279 aa31.45■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 MSH4O15457 936 aa31.44■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 OR52Z1P0C646 297 aa31.44■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 GRK4P32298 578 aa31.44■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 TTLL4Q14679 1199 aa31.44■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 STK38Q15208 465 aa31.44■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 TAPT1Q6NXT6 567 aa31.44■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 SLFN12Q8IYM2 578 aa31.44■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 ETNPPLQ8TBG4 499 aa31.44■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 FAM20AQ96MK3 541 aa31.44■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP31.43■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP31.43■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM60Q9H2L4 133 aa31.43■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP31.43■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP31.43■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP31.43■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 SEMA3FQ13275 785 aa31.43■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 SLC39A14Q15043 492 aa31.43■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 PTPAQ15257 358 aa31.43■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 C4orf32Q8N8J7 132 aa31.43■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 LINC00301Q8NCQ3 95 aa31.43■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 TCHHQ07283 1943 aa31.42■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP31.42■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP31.42■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa31.42■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 MTMR9Q96QG7 549 aa31.42■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 SENP7Q9BQF6 1050 aa31.42■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 PDGFCQ9NRA1 345 aa31.42■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP31.42■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 CYBAP13498 195 aa31.41■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 PRPHP41219 470 aa31.41■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP31.41■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 IQSEC1Q6DN90 963 aa31.41■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 CHAMP1Q96JM3 812 aa31.41■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 PRDM10Q9NQV6 1147 aa31.41■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP31.4■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC144BQ3MJ40 725 aa31.4■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP31.4■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 HAS1Q92839 578 aa31.4■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 SLC5A5Q92911 643 aa31.4■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 TBC1D22BQ9NU19 505 aa31.4■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 TXNP10599 105 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC62Q6P9F0 684 aa31.4■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 KCNG4Q8TDN1 519 aa31.4■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 SPATA32Q96LK8 384 aa31.4■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 RIT2Q99578 217 aa31.4■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP31.4■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 SPTLC2O15270 562 aa31.39■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 ADCYAP1R1P41586 468 aa31.39■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 NEDD9Q14511 834 aa31.39■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 SDF4Q9BRK5 362 aa31.39■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 PKD2L1Q9P0L9 805 aa31.39■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 RCOR1Q9UKL0 485 aa31.39■■■□□ 2.62
GIPC1-201ENST00000345425 ATP9AO75110 1047 aa31.38■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 KCNA2P16389 499 aa31.38■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP31.38■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 TRIM32Q13049 653 aa31.38■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa31.38■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 LRCH2Q5VUJ6 765 aa31.38■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP31.38■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 FAM184BQ9ULE4 1060 aa31.38■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 NFASCO94856 1347 aa31.38■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP31.38■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 GAS7O60861 476 aa31.38■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 PPP6R2O75170 966 aa31.38■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 ARIH2O95376 493 aa31.38■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 INHAP05111 366 aa31.38■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 TXKP42681 527 aa31.38■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 LY6KQ17RY6 165 aa31.38■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa31.38■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 CLEC17AQ6ZS10 378 aa31.38■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 PCDHA12Q9UN75 941 aa31.38■■■□□ 2.61
GIPC1-201ENST00000345425 AKR1A1P14550 325 aa31.37■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms