RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328839.3

PPP4R4-202, Transcript of protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP4R4, Length 876 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4-202ENST00000328839 RGS20O76081 388 aa29.04■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 ARHGEF15O94989 841 aa29.04■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 GGPS1O95749 300 aa29.04■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 POLR2MP0CAP2 368 aa29.04■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 WDR5P61964 334 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 TAP1Q03518 808 aa29.04■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 TRAF1Q13077 416 aa29.04■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 WTAPQ15007 396 aa29.04■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 SART3Q15020 963 aaKnown RBP29.04■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 ZBED2Q9BTP6 218 aa29.04■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 SENP2Q9HC62 589 aa29.04■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 PARNO95453 639 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 CHMLP26374 656 aa29.03■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 CCND2P30279 289 aa29.03■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 GPNMBQ14956 572 aa29.03■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 SLC35G1Q2M3R5 365 aa29.03■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 MYSM1Q5VVJ2 828 aa29.03■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 CNKSR3Q6P9H4 555 aa29.03■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP29.03■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 VSIG10LQ86VR7 867 aa29.03■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 SAMD3Q8N6K7 520 aa29.03■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 RIOX1Q9H6W3 641 aa29.03■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 MTCH2Q9Y6C9 303 aa29.03■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 DOCK5Q9H7D0 1870 aa29.02■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 HAS3O00219 553 aa29.02■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 NBNO60934 754 aa29.02■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 RBL2Q08999 1139 aa29.02■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 PTK7Q13308 1070 aa29.02■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 HSDL1Q3SXM5 330 aa29.02■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 NCOA7Q8NI08 942 aa29.02■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 PIBF1Q8WXW3 757 aa29.02■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 TRANK1O15050 2925 aa29.02■■■□□ 2.24
PPP4R4-202ENST00000328839 E7EWF7 191 aa29.01■■■□□ 2.23
PPP4R4-202ENST00000328839 PPFIA4O75335 1185 aa29.01■■■□□ 2.23
PPP4R4-202ENST00000328839 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
PPP4R4-202ENST00000328839 DEFB103AP81534 67 aa29.01■■■□□ 2.23
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
PPP4R4-202ENST00000328839 KRT40Q6A162 431 aa29.01■■■□□ 2.23
PPP4R4-202ENST00000328839 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP29.01■■■□□ 2.23
PPP4R4-202ENST00000328839 MLXIPQ9HAP2 919 aa29.01■■■□□ 2.23
PPP4R4-202ENST00000328839 TAF6LQ9Y6J9 622 aa29.01■■■□□ 2.23
PPP4R4-202ENST00000328839 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa29■■■□□ 2.23
PPP4R4-202ENST00000328839 CYTH3O43739 400 aa29■■■□□ 2.23
PPP4R4-202ENST00000328839 SP2Q02086 613 aa29■■■□□ 2.23
PPP4R4-202ENST00000328839 TFF2Q03403 129 aa29■■■□□ 2.23
PPP4R4-202ENST00000328839 CXCL10P02778 98 aa28.99■■■□□ 2.23
PPP4R4-202ENST00000328839 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
PPP4R4-202ENST00000328839 ZNF618Q5T7W0 954 aa28.99■■■□□ 2.23
PPP4R4-202ENST00000328839 SPRED2Q7Z698 418 aa28.99■■■□□ 2.23
PPP4R4-202ENST00000328839 CATIPQ7Z7H3 387 aa28.99■■■□□ 2.23
PPP4R4-202ENST00000328839 WNT8BQ93098 351 aa28.99■■■□□ 2.23
PPP4R4-202ENST00000328839 MUC3AQ02505 3323 aa28.99■■■□□ 2.23
PPP4R4-202ENST00000328839 LCHNA4D1U4 455 aa28.98■■■□□ 2.23
PPP4R4-202ENST00000328839 TGFB3P10600 412 aa28.98■■■□□ 2.23
PPP4R4-202ENST00000328839 TROAPQ12815 778 aa28.98■■■□□ 2.23
PPP4R4-202ENST00000328839 TCTN1Q2MV58 587 aa28.98■■■□□ 2.23
PPP4R4-202ENST00000328839 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa28.97■■■□□ 2.23
PPP4R4-202ENST00000328839 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa28.97■■■□□ 2.23
PPP4R4-202ENST00000328839 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
PPP4R4-202ENST00000328839 IKBKEQ14164 716 aa28.97■■■□□ 2.23
PPP4R4-202ENST00000328839 AAK1Q2M2I8 961 aa28.97■■■□□ 2.23
PPP4R4-202ENST00000328839 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
PPP4R4-202ENST00000328839 NOP56O00567 594 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
PPP4R4-202ENST00000328839 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
PPP4R4-202ENST00000328839 GRB10Q13322 594 aa28.96■■■□□ 2.23
PPP4R4-202ENST00000328839 HIC1Q14526 733 aa28.96■■■□□ 2.23
PPP4R4-202ENST00000328839 GNPTABQ3T906 1256 aa28.96■■■□□ 2.23
PPP4R4-202ENST00000328839 FAM117BQ6P1L5 589 aa28.96■■■□□ 2.23
PPP4R4-202ENST00000328839 C16orf70Q9BSU1 422 aa28.96■■■□□ 2.23
PPP4R4-202ENST00000328839 SGSM2O43147 1006 aa28.95■■■□□ 2.22
PPP4R4-202ENST00000328839 THPOP40225 353 aa28.95■■■□□ 2.22
PPP4R4-202ENST00000328839 MTUS1Q9ULD2 1270 aa28.95■■■□□ 2.22
PPP4R4-202ENST00000328839 MICAL3Q7RTP6 2002 aa28.94■■■□□ 2.22
PPP4R4-202ENST00000328839 C17orf102A2RUQ5 167 aa28.94■■■□□ 2.22
PPP4R4-202ENST00000328839 H3BRB1 525 aa28.94■■■□□ 2.22
PPP4R4-202ENST00000328839 EFCAB14O75071 495 aa28.94■■■□□ 2.22
PPP4R4-202ENST00000328839 KCNQ1P51787 676 aa28.94■■■□□ 2.22
PPP4R4-202ENST00000328839 ANTXR2P58335 489 aa28.94■■■□□ 2.22
PPP4R4-202ENST00000328839 MBTPS1Q14703 1052 aa28.94■■■□□ 2.22
PPP4R4-202ENST00000328839 TRAF7Q6Q0C0 670 aa28.94■■■□□ 2.22
PPP4R4-202ENST00000328839 GDPD5Q8WTR4 605 aa28.94■■■□□ 2.22
PPP4R4-202ENST00000328839 ATP6V0A1Q93050 837 aa28.94■■■□□ 2.22
PPP4R4-202ENST00000328839 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
PPP4R4-202ENST00000328839 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
PPP4R4-202ENST00000328839 BCAS3Q9H6U6 928 aa28.94■■■□□ 2.22
PPP4R4-202ENST00000328839 SIP14410 1827 aa28.94■■■□□ 2.22
PPP4R4-202ENST00000328839 XIRP2A4UGR9 3374 aa28.93■■■□□ 2.22
PPP4R4-202ENST00000328839 LGR5O75473 907 aa28.93■■■□□ 2.22
PPP4R4-202ENST00000328839 GJB5O95377 273 aa28.93■■■□□ 2.22
PPP4R4-202ENST00000328839 LGALS2P05162 132 aa28.93■■■□□ 2.22
PPP4R4-202ENST00000328839 SERINC5Q86VE9 423 aa28.93■■■□□ 2.22
PPP4R4-202ENST00000328839 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP28.93■■■□□ 2.22
PPP4R4-202ENST00000328839 RAD9AQ99638 391 aa28.93■■■□□ 2.22
PPP4R4-202ENST00000328839 MYL10Q9BUA6 226 aa28.93■■■□□ 2.22
PPP4R4-202ENST00000328839 RTEL1Q9NZ71 1219 aa28.93■■■□□ 2.22
PPP4R4-202ENST00000328839 EMSYQ7Z589 1322 aa28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.1 ms