RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321358.11

YBX1-201, Transcript of Y-box binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene YBX1, Length 1,514 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX1-201ENST00000321358 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.43
YBX1-201ENST00000321358 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.43
YBX1-201ENST00000321358 CALCRLQ16602 461 aa23.95■■□□□ 1.43
YBX1-201ENST00000321358 ZNF577Q9BSK1 485 aa23.95■■□□□ 1.43
YBX1-201ENST00000321358 POLR3EQ9NVU0 708 aa23.95■■□□□ 1.43
YBX1-201ENST00000321358 DOCK3Q8IZD9 2030 aa23.95■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 TBX3O15119 743 aa23.94■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 SLC37A4O43826 429 aa23.94■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 RGS20O76081 388 aa23.94■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 IGHA2P01877 340 aa23.94■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 PTGDRQ13258 359 aa23.94■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa23.94■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa23.94■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 IQSEC1Q6DN90 963 aa23.94■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 SLFN12Q8IYM2 578 aa23.94■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 FAM20AQ96MK3 541 aa23.94■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 USP28Q96RU2 1077 aa23.94■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa23.94■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 WNT7AO00755 349 aa23.94■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 ARP10275 920 aa23.94■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 TXNP10599 105 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 STK38Q15208 465 aa23.94■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 TAPT1Q6NXT6 567 aa23.94■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 POTEDQ86YR6 584 aa23.94■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 FAM184BQ9ULE4 1060 aa23.94■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 CLIC4Q9Y696 253 aa23.94■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa23.94■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa23.93■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 CNGA1P29973 690 aa23.93■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 NEDD9Q14511 834 aa23.93■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 CCDC144BQ3MJ40 725 aa23.93■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 LENG9Q96B70 501 aa23.93■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 SENP7Q9BQF6 1050 aa23.93■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 SDF4Q9BRK5 362 aa23.93■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 KATNBL1Q9H079 304 aa23.93■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 PDGFCQ9NRA1 345 aa23.93■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 TBC1D22BQ9NU19 505 aa23.93■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 MSH4O15457 936 aa23.92■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 INHAP05111 366 aa23.92■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 OR52Z1P0C646 297 aa23.92■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 PKD2L1Q9P0L9 805 aa23.92■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 YEATS4O95619 227 aa23.91■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 CYBAP13498 195 aa23.91■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 AKR1A1P14550 325 aa23.91■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 NASPP49321 788 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 TNFAIP2Q03169 654 aa23.91■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP23.91■■□□□ 1.423e-11■□□□□ 8.4
YBX1-201ENST00000321358 KCNMB3Q9NPA1 279 aa23.91■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP23.9■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 GAS7O60861 476 aa23.9■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 CAPN15O75808 1086 aa23.9■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 ADCYAP1R1P41586 468 aa23.9■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 TRIM32Q13049 653 aa23.9■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 SLC39A14Q15043 492 aa23.9■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 TMEM266Q2M3C6 531 aa23.9■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 LRCH2Q5VUJ6 765 aa23.9■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 ETNPPLQ8TBG4 499 aa23.9■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 RIT2Q99578 217 aa23.9■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 PCDHA12Q9UN75 941 aa23.9■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 TXKP42681 527 aa23.89■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 SEMA3FQ13275 785 aa23.89■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 LY6KQ17RY6 165 aa23.89■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 CCDC62Q6P9F0 684 aa23.89■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 DTHD1Q6ZMT9 781 aa23.89■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 KCNG4Q8TDN1 519 aa23.89■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 SH3TC2Q8TF17 1288 aa23.89■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 SPATA32Q96LK8 384 aa23.89■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 MTMR9Q96QG7 549 aa23.89■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 UIMC1Q96RL1 719 aa23.89■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 TMEM60Q9H2L4 133 aa23.89■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 MLXIPQ9HAP2 919 aa23.89■■□□□ 1.42
YBX1-201ENST00000321358 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa23.89■■□□□ 1.41
YBX1-201ENST00000321358 LCTP09848 1927 aa23.89■■□□□ 1.41
YBX1-201ENST00000321358 SEPT4O43236 478 aa23.89■■□□□ 1.41
YBX1-201ENST00000321358 PRPHP41219 470 aa23.89■■□□□ 1.41
YBX1-201ENST00000321358 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa23.89■■□□□ 1.41
YBX1-201ENST00000321358 DUSP28Q4G0W2 176 aa23.89■■□□□ 1.41
YBX1-201ENST00000321358 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa23.89■■□□□ 1.41
YBX1-201ENST00000321358 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.41
YBX1-201ENST00000321358 C4orf32Q8N8J7 132 aa23.89■■□□□ 1.41
YBX1-201ENST00000321358 LINC00301Q8NCQ3 95 aa23.89■■□□□ 1.41
YBX1-201ENST00000321358 SLC5A5Q92911 643 aa23.89■■□□□ 1.41
YBX1-201ENST00000321358 TEKT3Q9BXF9 490 aa23.89■■□□□ 1.41
YBX1-201ENST00000321358 RAB34Q9BZG1 259 aa23.89■■□□□ 1.41
YBX1-201ENST00000321358 SPTLC2O15270 562 aa23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms