RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317991.9

GRAMD1A-201, Transcript of GRAM domain containing 1A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GRAMD1A, Length 2,695 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1A-201ENST00000317991 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 DAGLBQ8NCG7 672 aa24.58■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 VCPKMTQ9H867 229 aa24.58■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 TSKSQ9UJT2 592 aa24.58■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 ITGB4P16144 1822 aa24.57■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 PPP1R2P41236 205 aa24.57■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 KLC4Q9NSK0 619 aa24.57■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa24.57■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 NOL4O94818 638 aa24.57■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 ADAMTS2O95450 1211 aa24.57■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 DDR1Q08345 913 aa24.57■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC40Q4G0X9 1142 aa24.57■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 DNAAF5Q86Y56 855 aa24.57■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP24.57■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 RNF14Q9UBS8 474 aa24.57■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 TMOD1P28289 359 aa24.56■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 ERVK-9P63128 1117 aa24.56■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 NAB2Q15742 525 aa24.56■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa24.56■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 MEI1Q5TIA1 1274 aa24.56■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 CALML4Q96GE6 196 aa24.56■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 TMBIM4Q9HC24 238 aa24.56■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 BCL9O00512 1426 aa24.56■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 A0A0G2JS52 829 aa24.56■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 ATP6V1AP38606 617 aa24.56■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 NAPAP54920 295 aa24.56■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM83BQ5T0W9 1011 aa24.56■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 WHAMMQ8TF30 809 aa24.56■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 CYFIP2Q96F07 1278 aa24.56■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 A0A087X0T9 212 aa24.55■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa24.55■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM228BP0C875 321 aa24.55■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 COBLL1Q53SF7 1204 aa24.55■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 C6orf89Q6UWU4 347 aa24.55■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa24.55■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa24.55■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa24.55■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 STX8Q9UNK0 236 aa24.55■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 HSD17B3P37058 310 aa24.55■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP24.55■■□□□ 1.523e-9■■■□□ 17.9
GRAMD1A-201ENST00000317991 QPCTQ16769 361 aa24.55■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 KIAA0753Q2KHM9 967 aa24.55■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 SFMBT2Q5VUG0 894 aa24.55■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 UNC13DQ70J99 1090 aa24.55■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 DGKHQ86XP1 1220 aa24.55■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC44A5Q8NCS7 719 aa24.55■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 PNMA5Q96PV4 448 aa24.55■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP24.55■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa24.54■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 ECHS1P30084 290 aa24.54■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 UBE4AQ14139 1066 aa24.54■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 USP38Q8NB14 1042 aa24.54■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 TBCKQ8TEA7 893 aa24.54■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 NUDT12Q9BQG2 462 aa24.54■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 SLC40A1Q9NP59 571 aa24.54■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 SMCO2A6NFE2 343 aa24.54■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 RASSF9O75901 435 aa24.54■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 SMTNP53814 917 aa24.54■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 GRID2IPA4D2P6 1211 aa24.53■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 NEUROG2Q9H2A3 272 aa24.53■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 VAT1LQ9HCJ6 419 aa24.53■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 MINPP1Q9UNW1 487 aa24.53■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 KCNK3O14649 394 aa24.53■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 CAMTA2O94983 1202 aa24.53■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 SERPING1P05155 500 aa24.53■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 GALNT17Q6IS24 598 aa24.53■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 NEK8Q86SG6 692 aa24.53■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 TMEM260Q9NX78 707 aa24.53■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP24.52■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 SBK1Q52WX2 424 aa24.52■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 KCNK18Q7Z418 384 aa24.52■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZMYND12Q9H0C1 365 aa24.52■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa24.52■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 GOLGA6L10A6NI86 522 aa24.52■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 H0YGN5 161 aa24.52■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 CCDC172P0C7W6 258 aa24.52■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 MYZAPP0CAP1 466 aa24.52■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 FLT3P36888 993 aa24.52■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 RAPGEF1Q13905 1077 aa24.52■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 PPP4R3AQ6IN85 833 aa24.52■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 AP1M1Q9BXS5 423 aa24.52■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 OSBPL7Q9BZF2 842 aa24.52■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 MKNK2Q9HBH9 465 aa24.52■■□□□ 1.52
GRAMD1A-201ENST00000317991 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms