RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306121.7

SNX7-201, Transcript of sorting nexin 7, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX7, Length 1,734 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7-201ENST00000306121 CEP55Q53EZ4 464 aa23.66■■□□□ 1.38
SNX7-201ENST00000306121 DDX12PQ92771 950 aa23.66■■□□□ 1.38
SNX7-201ENST00000306121 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
SNX7-201ENST00000306121 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
SNX7-201ENST00000306121 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa23.65■■□□□ 1.38
SNX7-201ENST00000306121 VWA5AO00534 786 aa23.65■■□□□ 1.38
SNX7-201ENST00000306121 FCER1AP12319 257 aa23.65■■□□□ 1.38
SNX7-201ENST00000306121 RPA1P27694 616 aa23.65■■□□□ 1.38
SNX7-201ENST00000306121 HMGCS2P54868 508 aa23.65■■□□□ 1.38
SNX7-201ENST00000306121 UBXN2AP68543 259 aa23.65■■□□□ 1.38
SNX7-201ENST00000306121 C9orf131Q5VYM1 1079 aa23.65■■□□□ 1.38
SNX7-201ENST00000306121 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
SNX7-201ENST00000306121 DYMQ7RTS9 669 aa23.65■■□□□ 1.38
SNX7-201ENST00000306121 CATSPER3Q86XQ3 398 aa23.65■■□□□ 1.38
SNX7-201ENST00000306121 SLC5A5Q92911 643 aa23.65■■□□□ 1.38
SNX7-201ENST00000306121 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
SNX7-201ENST00000306121 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP23.65■■□□□ 1.38
SNX7-201ENST00000306121 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
SNX7-201ENST00000306121 E9PMD0 336 aa23.64■■□□□ 1.38
SNX7-201ENST00000306121 USP2O75604 605 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
SNX7-201ENST00000306121 PLA2G4BP0C869 781 aa23.64■■□□□ 1.38
SNX7-201ENST00000306121 SKILP12757 684 aa23.64■■□□□ 1.38
SNX7-201ENST00000306121 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP23.64■■□□□ 1.38
SNX7-201ENST00000306121 SETQ01105 290 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
SNX7-201ENST00000306121 KIAA0895Q8NCT3 520 aa23.64■■□□□ 1.38
SNX7-201ENST00000306121 ATG4CQ96DT6 458 aa23.64■■□□□ 1.38
SNX7-201ENST00000306121 COL20A1Q9P218 1284 aa23.64■■□□□ 1.38
SNX7-201ENST00000306121 WDR90Q96KV7 1748 aa23.64■■□□□ 1.38
SNX7-201ENST00000306121 TRIM49BA6NDI0 452 aa23.64■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 LRRC10BA6NIK2 292 aa23.64■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 MEIS1O00470 390 aa23.64■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa23.64■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 PMS1P54277 932 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 EHHADHQ08426 723 aa23.64■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 MUM1L1Q5H9M0 696 aa23.64■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 TTI2Q6NXR4 508 aa23.64■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 DNAJC19Q96DA6 116 aa23.64■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa23.64■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 POTEFA5A3E0 1075 aa23.63■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 PSMD10O75832 226 aa23.63■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 POTEIP0CG38 1075 aa23.63■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 CCNE1P24864 410 aa23.63■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 FILIP1LQ4L180 1135 aa23.63■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 TCP11X2Q5H9J9 407 aa23.63■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa23.63■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 POTEGQ6S5H5 508 aa23.63■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 POTEEQ6S8J3 1075 aa23.63■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 P2RX5Q93086 422 aa23.63■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 HOMER2Q9NSB8 354 aa23.63■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 UTRNP46939 3433 aa23.63■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 BICDL2A1A5D9 508 aa23.62■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 KCNJ18B7U540 433 aa23.62■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 PSMD2Q13200 908 aa23.62■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 PPP2R5CQ13362 524 aa23.62■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 KCNJ12Q14500 433 aa23.62■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 KRT31Q15323 416 aa23.62■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 LRCH2Q5VUJ6 765 aa23.62■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 OTOP1Q7RTM1 612 aa23.62■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 SULF1Q8IWU6 871 aa23.62■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa23.62■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 HPS3Q969F9 1004 aa23.62■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 THAP9Q9H5L6 903 aa23.62■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 TMOD4Q9NZQ9 345 aa23.62■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa23.62■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 FRMPD4Q14CM0 1322 aa23.62■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 OTOFQ9HC10 1997 aa23.62■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP23.62■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 IDEP14735 1019 aa23.62■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 SLC12A3P55017 1021 aa23.62■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 PRKG1Q13976 671 aa23.62■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 PTPN21Q16825 1174 aa23.62■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 KCTD17Q8N5Z5 321 aa23.62■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 REPS2Q8NFH8 660 aa23.62■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 WNK4Q96J92 1243 aa23.62■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 TRIM47Q96LD4 638 aa23.62■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 MXRA8Q9BRK3 442 aa23.62■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 SLC39A2Q9NP94 309 aa23.62■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 EML1O00423 815 aa23.61■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 DSG3P32926 999 aa23.61■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 OAZ1P54368 228 aa23.61■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 MAP3K9P80192 1104 aa23.61■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 KRT26Q7Z3Y9 468 aa23.61■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 GPBP1Q86WP2 473 aa23.61■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 IRF2BP1Q8IU81 584 aa23.61■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 TRERF1Q96PN7 1200 aa23.61■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa23.61■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 ADM5C9JUS6 153 aa23.6■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 TEX33O43247 280 aa23.6■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 ARP10275 920 aa23.6■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 BCRP11274 1271 aa23.6■■□□□ 1.37
SNX7-201ENST00000306121 CYP11B2P19099 503 aa23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms