RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 RBL2Q08999 1139 aa22.72■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 GPNMBQ14956 572 aa22.72■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 HSDL1Q3SXM5 330 aa22.72■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 CATIPQ7Z7H3 387 aa22.72■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 MAP4K1Q92918 833 aa22.72■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 SPATA33Q96N06 139 aa22.72■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 KIF28PB7ZC32 967 aa22.71■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 TGFB3P10600 412 aa22.71■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 CKBP12277 381 aa22.71■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 KCNJ6P48051 423 aa22.71■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 SP2Q02086 613 aa22.71■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 MICALL1Q8N3F8 863 aa22.71■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa22.71■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 CERS4Q9HA82 394 aa22.71■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.23
CXCL3-201ENST00000296026 RFXAPO00287 272 aa22.7■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 PARNO95453 639 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 PTK7Q13308 1070 aa22.7■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.7■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP22.7■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 ASB2Q96Q27 587 aa22.7■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 NBNO60934 754 aa22.69■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 WDR5P61964 334 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 TAP1Q03518 808 aa22.69■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 CNKSR3Q6P9H4 555 aa22.69■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 MLXIPQ9HAP2 919 aa22.69■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 PTPRSQ13332 1948 aa22.69■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 ARHGEF15O94989 841 aa22.68■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 CXCL10P02778 98 aa22.68■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 WNT8BQ93098 351 aa22.68■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 C16orf70Q9BSU1 422 aa22.68■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 CHD7Q9P2D1 2997 aa22.68■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 VCANP13611 3396 aa22.67■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 EPOPA6NHQ4 379 aa22.67■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 TLL1O43897 1013 aa22.67■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 HIC1Q14526 733 aa22.67■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF618Q5T7W0 954 aa22.67■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF654Q8IZM8 581 aa22.67■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 ARNTL2Q8WYA1 636 aa22.67■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 MYL10Q9BUA6 226 aa22.67■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 LY9Q9HBG7 655 aa22.67■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 FRMPD4Q14CM0 1322 aa22.66■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 DEFB103AP81534 67 aa22.66■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 TCTN1Q2MV58 587 aa22.66■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 GNPTABQ3T906 1256 aa22.66■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 TRAF7Q6Q0C0 670 aa22.66■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 MAP3K14Q99558 947 aa22.66■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 ZBED2Q9BTP6 218 aa22.66■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 SPZ1Q9BXG8 430 aa22.66■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 BCAS3Q9H6U6 928 aa22.66■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 MTCH2Q9Y6C9 303 aa22.66■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa22.65■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 H3BRB1 525 aa22.65■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 TNFRSF10AO00220 468 aa22.65■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 STAM2O75886 525 aa22.65■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 DDAH1O94760 285 aa22.65■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 KIF5BP33176 963 aa22.65■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 CASC1Q6TDU7 716 aa22.65■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 RTEL1Q9NZ71 1219 aa22.65■■□□□ 1.22
CXCL3-201ENST00000296026 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa22.64■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 NOP56O00567 594 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 PRC1O43663 620 aa22.64■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 LGALS2P05162 132 aa22.64■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 ICAM3P32942 547 aa22.64■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 IKBKEQ14164 716 aa22.64■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 MBTPS1Q14703 1052 aa22.64■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 SERINC5Q86VE9 423 aa22.64■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa22.64■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa22.64■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 MTA3Q9BTC8 594 aa22.64■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 C17orf102A2RUQ5 167 aa22.63■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 LCHNA4D1U4 455 aa22.63■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa22.63■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 SMARCA1P28370 1054 aa22.63■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 NEDD9Q14511 834 aa22.63■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 KRT40Q6A162 431 aa22.63■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.63■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 NFXL1Q6ZNB6 911 aa22.63■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 CYFIP1Q7L576 1253 aa22.63■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 SPRED2Q7Z698 418 aa22.63■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 IL27Q8NEV9 243 aa22.63■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 CUL5Q93034 780 aa22.63■■□□□ 1.21
CXCL3-201ENST00000296026 ATP6V0A1Q93050 837 aa22.63■■□□□ 1.21
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