RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225603.8

CBX1-201, Transcript of chromobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CBX1, Length 2,232 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-201ENST00000225603 TMEM266Q2M3C6 531 aa20.31■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 VSIG10LQ86VR7 867 aa20.31■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 SLFN12Q8IYM2 578 aa20.31■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 LRRC15Q8TF66 581 aa20.31■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 PLIN2Q99541 437 aa20.31■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 NUDT12Q9BQG2 462 aa20.31■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 CCSER1Q9C0I3 900 aa20.31■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 MAF1Q9H063 256 aa20.31■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 LRWD1Q9UFC0 647 aa20.31■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 PFASO15067 1338 aa20.31■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 PGK2P07205 417 aa20.31■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 UBA7P41226 1012 aa20.31■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 PDIA5Q14554 519 aa20.31■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 E2F4Q16254 413 aa20.31■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 WDR78Q5VTH9 848 aa20.31■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 CNNM3Q8NE01 707 aa20.31■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 MORF4L1Q9UBU8 362 aa20.31■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 SPIRE1Q08AE8 756 aa20.3■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 ANO6Q4KMQ2 910 aa20.3■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 CYP4F22Q6NT55 531 aa20.3■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP20.3■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 CABP7Q86V35 215 aa20.3■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 IFNL1Q8IU54 200 aa20.3■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 FAM20AQ96MK3 541 aa20.3■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 MROH8Q9H579 483 aa20.3■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 SOWAHBA6NEL2 793 aa20.3■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 POTEB2H3BUK9 544 aa20.3■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 AP5Z1O43299 807 aa20.3■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 COPB2P35606 906 aa20.3■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 SASS6Q6UVJ0 657 aa20.3■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa20.3■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 FAM133AQ8N9E0 248 aa20.3■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 SHCBP1Q8NEM2 672 aa20.3■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 SLC5A5Q92911 643 aa20.3■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 HHIPL1Q96JK4 782 aa20.3■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 JADE2Q9NQC1 790 aa20.3■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 KCNH7Q9NS40 1196 aa20.3■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 VAV3Q9UKW4 847 aa20.3■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 CCND2P30279 289 aa20.29■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 MMP19Q99542 508 aa20.29■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 PKD2L1Q9P0L9 805 aa20.29■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 CPA4Q9UI42 421 aa20.29■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 ADGRA2Q96PE1 1338 aa20.29■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 CTAGE5O15320 804 aa20.29■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 TXLNAP40222 546 aa20.29■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 NAALADL2Q58DX5 795 aa20.29■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 FGD4Q96M96 766 aa20.29■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 PSMD10O75832 226 aa20.28■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 RGS20O76081 388 aa20.28■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 SETQ01105 290 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 PNOCQ13519 176 aa20.28■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 NIPA1Q7RTP0 329 aa20.28■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 ZNF577Q9BSK1 485 aa20.28■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 RAB34Q9BZG1 259 aa20.28■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 CBX8Q9HC52 389 aa20.28■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 DISC1Q9NRI5 854 aa20.28■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa20.27■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 A0A087WWV3 80 aa20.27■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 SLFN14P0C7P3 912 aa20.27■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 BCRP11274 1271 aa20.27■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 CCNA1P78396 465 aa20.27■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 PLCB2Q00722 1185 aa20.27■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 KCTD2Q14681 263 aa20.27■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 ECM1Q16610 540 aa20.27■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 PDXDC2PQ6P474 469 aa20.27■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 DNERQ8NFT8 737 aa20.27■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 PNMA5Q96PV4 448 aa20.27■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 PRR29P0C7W0 189 aa20.27■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 FCER1AP12319 257 aa20.27■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 PLCG1P19174 1290 aa20.27■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 INHBEP58166 350 aa20.27■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 GRB10Q13322 594 aa20.27■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 MTMR1Q13613 665 aa20.27■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 FAM110CQ1W6H9 321 aa20.27■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 LRCH2Q5VUJ6 765 aa20.27■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 XRRA1Q6P2D8 792 aa20.27■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 OTOP1Q7RTM1 612 aa20.27■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 LUZP1Q86V48 1076 aa20.27■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 IQUBQ8NA54 791 aa20.27■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
CBX1-201ENST00000225603 EML1O00423 815 aa20.26■□□□□ 0.83
CBX1-201ENST00000225603 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
CBX1-201ENST00000225603 RRAGBQ5VZM2 374 aa20.26■□□□□ 0.83
CBX1-201ENST00000225603 NCAPH2Q6IBW4 605 aa20.26■□□□□ 0.83
CBX1-201ENST00000225603 RASSF8Q8NHQ8 419 aa20.26■□□□□ 0.83
CBX1-201ENST00000225603 SNX29Q8TEQ0 813 aa20.26■□□□□ 0.83
CBX1-201ENST00000225603 STAMQ92783 540 aa20.26■□□□□ 0.83
CBX1-201ENST00000225603 PAGE5Q96GU1 130 aa20.26■□□□□ 0.83
CBX1-201ENST00000225603 MTRQ99707 1265 aa20.26■□□□□ 0.83
CBX1-201ENST00000225603 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
CBX1-201ENST00000225603 ATP9AO75110 1047 aa20.26■□□□□ 0.83
CBX1-201ENST00000225603 OFD1O75665 1012 aa20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms