RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000004201.7

Col5a3-201, Transcript of Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Col5a3, Length 6,119 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gm45194A0A140LJG2 572 aa15.62■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Cfap221A9Q751 836 aa15.62■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Dennd2cQ6P9P8 914 aa15.62■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 TxlngQ8BHN1 524 aa15.62■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Fndc3aQ8BX90 1198 aa15.62■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Polr2bQ8CFI7 1174 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Pls3Q99K51 630 aa15.62■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Psmg1Q9JK23 289 aa15.62■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Syt2P46097 422 aa15.62■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Patl1Q3TC46 770 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 DbnlQ62418 436 aa15.62■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Arhgap30Q640N3 1101 aa15.62■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Nlrp4aQ8BU40 982 aa15.62■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gm43738A0A0G2JEA5 862 aa15.62■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Pfdn4Q3UWL8 134 aa15.62■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 LnpkQ7TQ95 425 aa15.62■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 L3mbtl3Q8BLB7 883 aa15.62■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ccdc65Q8VHI7 493 aa15.62■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Nsmce1Q9D720 266 aa15.62■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Lrch1P62046 709 aa15.62■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Pde6aP27664 859 aa15.62■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Lrrc41Q8K1C9 807 aa15.62■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Cacnb1Q8R3Z5 597 aa15.62■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gpaa1Q9WTK3 621 aa15.62■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Panx2Q6IMP4 677 aa15.61■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Cep70Q6IQY5 616 aa15.61■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Erp44Q9D1Q6 406 aa15.61■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Tspan17Q9D7W4 270 aa15.61■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 EsrraO08580 422 aa15.61■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Eepd1Q3TGW2 569 aa15.61■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Serpinb3dQ6UKZ0 387 aa15.61■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ccdc103Q9D9P2 237 aa15.61■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 P4hbP09103 509 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gnl1P36916 607 aa15.61■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Nr2f2P43135 414 aa15.61■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ppp1r1bQ60829 194 aa15.61■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 ThrspQ62264 150 aa15.61■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Tbc1d30Q69ZT9 766 aa15.61■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Cog4Q8R1U1 785 aa15.61■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Suclg2Q9Z2I8 433 aa15.61■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Rasgrf2P70392 1189 aa15.61■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Parp3Q3ULW8 533 aa15.61■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ushbp1Q8R370 680 aa15.61■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Dnajc3Q91YW3 504 aa15.61■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Psma8Q9CWH6 250 aa15.61■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Krt24A1L317 512 aa15.61■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Pde8bE9Q4S1 865 aa15.61■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Il7P10168 154 aa15.61■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gna14P30677 355 aa15.61■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Wdr91Q7TMQ7 748 aa15.61■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Bsdc1Q80Y55 427 aa15.61■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Creb3l3Q91XE9 479 aa15.61■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Rmdn1Q9DCV4 305 aa15.61■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Pde4aO89084 844 aa15.6■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Fam47cQ14BE7 430 aa15.6■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 C87499Q3UX49 493 aa15.6■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 SmtnQ921U8 923 aa15.6■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Exoc7O35250 697 aa15.6■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Dnajb6O54946 365 aa15.6■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gpr182P43142 395 aa15.6■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ppme1Q8BVQ5 386 aa15.6■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Trmt112Q9DCG9 125 aa15.6■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Hyou1Q9JKR6 999 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Morf4l2Q9R0Q4 288 aa15.6■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 SphkapQ6NSW3 1687 aa15.6■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Klhl41A2AUC9 606 aa15.6■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Trim38Q5SZ99 471 aa15.6■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Tshz2Q68FE9 1030 aa15.6■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ints9Q8K114 658 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gm21962L7N280 338 aa15.6■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 VdrP48281 422 aa15.6■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Arhgef9Q3UTH8 516 aa15.6■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Zfp113Q8C689 439 aa15.6■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Cul1Q9WTX6 776 aa15.6■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Gm4841E9QAA8 417 aa15.6■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 DnttP09838 530 aa15.6■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Dynll1P63168 89 aa15.6■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Thumpd3P97770 505 aa15.6■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Actn1Q7TPR4 892 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Pcdhb12Q91Y07 789 aa15.6■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Afg3l1Q920A7 789 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Znf335A2A5K6 1337 aa15.59■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Cacna2d1O08532 1103 aa15.59■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ap1m1P35585 423 aa15.59■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Cep126Q0VBV7 1103 aa15.59■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Mettl17Q3U2U7 461 aa15.59■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Prmt9Q3U3W5 846 aa15.59■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Kctd1Q5M956 257 aa15.59■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Trmt44Q9D2Q2 713 aa15.59■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 PigbQ9JJQ0 542 aa15.59■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 EcsitQ9QZH6 435 aa15.59■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Mroh8E9PYI4 1049 aa15.59■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Kpna2P52293 529 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Agap2Q3UHD9 1186 aa15.59■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Adcy9P51830 1353 aa15.59■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ndc80Q9D0F1 642 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Foxp4Q9DBY0 795 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Aox2Q5SGK3 1345 aa15.59■□□□□ 0.09
Col5a3-201ENSMUST00000004201 Ccnyl1D3YUJ3 367 aa15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10.8 ms