Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWH6

Psma8, Proteasome subunit alpha type-7-like, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma8Q9CWH6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Psma8Q9CWH6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Psma8Q9CWH6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Psma8Q9CWH6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Psma8Q9CWH6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Psma8Q9CWH6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Psma8Q9CWH6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Psma8Q9CWH6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Psma8Q9CWH6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Psma8Q9CWH6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Psma8Q9CWH6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Psma8Q9CWH6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Psma8Q9CWH6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Psma8Q9CWH6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Psma8Q9CWH6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Psma8Q9CWH6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Psma8Q9CWH6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
Psma8Q9CWH6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Psma8Q9CWH6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Psma8Q9CWH6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Psma8Q9CWH6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Psma8Q9CWH6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Psma8Q9CWH6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Psma8Q9CWH6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Psma8Q9CWH6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Psma8Q9CWH6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Psma8Q9CWH6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Psma8Q9CWH6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Psma8Q9CWH6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Psma8Q9CWH6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Psma8Q9CWH6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Psma8Q9CWH6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Psma8Q9CWH6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Psma8Q9CWH6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Psma8Q9CWH6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Psma8Q9CWH6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Psma8Q9CWH6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Psma8Q9CWH6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Psma8Q9CWH6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Psma8Q9CWH6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Psma8Q9CWH6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Psma8Q9CWH6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Psma8Q9CWH6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Psma8Q9CWH6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Psma8Q9CWH6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Psma8Q9CWH6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Psma8Q9CWH6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Psma8Q9CWH6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Psma8Q9CWH6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Psma8Q9CWH6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Psma8Q9CWH6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Psma8Q9CWH6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Psma8Q9CWH6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Psma8Q9CWH6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Psma8Q9CWH6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Psma8Q9CWH6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Psma8Q9CWH6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Psma8Q9CWH6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Psma8Q9CWH6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Psma8Q9CWH6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Psma8Q9CWH6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Psma8Q9CWH6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Psma8Q9CWH6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Psma8Q9CWH6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Psma8Q9CWH6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Psma8Q9CWH6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Psma8Q9CWH6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Psma8Q9CWH6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Psma8Q9CWH6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Psma8Q9CWH6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Psma8Q9CWH6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Psma8Q9CWH6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Psma8Q9CWH6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Psma8Q9CWH6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Psma8Q9CWH6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Psma8Q9CWH6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Psma8Q9CWH6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Psma8Q9CWH6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Psma8Q9CWH6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Psma8Q9CWH6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Psma8Q9CWH6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Psma8Q9CWH6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Psma8Q9CWH6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Psma8Q9CWH6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Psma8Q9CWH6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Psma8Q9CWH6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Psma8Q9CWH6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Psma8Q9CWH6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Psma8Q9CWH6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Psma8Q9CWH6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Psma8Q9CWH6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Psma8Q9CWH6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Psma8Q9CWH6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Psma8Q9CWH6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Psma8Q9CWH6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Psma8Q9CWH6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Psma8Q9CWH6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Psma8Q9CWH6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Psma8Q9CWH6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Psma8Q9CWH6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms