Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWH6

Psma8, Proteasome subunit alpha type-7-like, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma8Q9CWH6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,41■■■■□ 3,26
Psma8Q9CWH6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34,11■■■■□ 3,05
Psma8Q9CWH6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,94■■■■□ 3,02
Psma8Q9CWH6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,48■■■□□ 2,95
Psma8Q9CWH6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33,4■■■□□ 2,94
Psma8Q9CWH6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33,36■■■□□ 2,93
Psma8Q9CWH6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,94■■■□□ 2,86
Psma8Q9CWH6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,16■■■□□ 2,74
Psma8Q9CWH6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,06■■■□□ 2,72
Psma8Q9CWH6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,79■■■□□ 2,68
Psma8Q9CWH6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,69■■■□□ 2,66
Psma8Q9CWH6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,65■■■□□ 2,66
Psma8Q9CWH6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,48■■■□□ 2,63
Psma8Q9CWH6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,47■■■□□ 2,63
Psma8Q9CWH6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,36■■■□□ 2,61
Psma8Q9CWH6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,3■■■□□ 2,6
Psma8Q9CWH6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31,11■■■□□ 2,57
Psma8Q9CWH6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30,98■■■□□ 2,55
Psma8Q9CWH6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC30,87■■■□□ 2,53
Psma8Q9CWH6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,67■■■□□ 2,5
Psma8Q9CWH6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,66■■■□□ 2,5
Psma8Q9CWH6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Psma8Q9CWH6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Psma8Q9CWH6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,4■■■□□ 2,46
Psma8Q9CWH6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Psma8Q9CWH6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Psma8Q9CWH6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC30,27■■■□□ 2,44
Psma8Q9CWH6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Psma8Q9CWH6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30,17■■■□□ 2,42
Psma8Q9CWH6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30,1■■■□□ 2,41
Psma8Q9CWH6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30,08■■■□□ 2,41
Psma8Q9CWH6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Psma8Q9CWH6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Psma8Q9CWH6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,9■■■□□ 2,38
Psma8Q9CWH6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Psma8Q9CWH6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Psma8Q9CWH6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC29,82■■■□□ 2,36
Psma8Q9CWH6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC29,81■■■□□ 2,36
Psma8Q9CWH6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Psma8Q9CWH6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC29,8■■■□□ 2,36
Psma8Q9CWH6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Psma8Q9CWH6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29,74■■■□□ 2,35
Psma8Q9CWH6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
Psma8Q9CWH6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Psma8Q9CWH6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Psma8Q9CWH6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Psma8Q9CWH6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,57■■■□□ 2,32
Psma8Q9CWH6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Psma8Q9CWH6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Psma8Q9CWH6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Psma8Q9CWH6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC29,3■■■□□ 2,28
Psma8Q9CWH6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC29,29■■■□□ 2,28
Psma8Q9CWH6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,17■■■□□ 2,26
Psma8Q9CWH6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Psma8Q9CWH6 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Psma8Q9CWH6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Psma8Q9CWH6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,23
Psma8Q9CWH6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,93■■■□□ 2,22
Psma8Q9CWH6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Psma8Q9CWH6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Psma8Q9CWH6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Psma8Q9CWH6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28,87■■■□□ 2,21
Psma8Q9CWH6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
Psma8Q9CWH6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
Psma8Q9CWH6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
Psma8Q9CWH6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
Psma8Q9CWH6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28,75■■■□□ 2,19
Psma8Q9CWH6 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
Psma8Q9CWH6 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28,73■■■□□ 2,19
Psma8Q9CWH6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Psma8Q9CWH6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC28,62■■■□□ 2,17
Psma8Q9CWH6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28,6■■■□□ 2,17
Psma8Q9CWH6 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,55■■■□□ 2,16
Psma8Q9CWH6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Psma8Q9CWH6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Psma8Q9CWH6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Psma8Q9CWH6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Psma8Q9CWH6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
Psma8Q9CWH6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Psma8Q9CWH6 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Psma8Q9CWH6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Psma8Q9CWH6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Psma8Q9CWH6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Psma8Q9CWH6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,11
Psma8Q9CWH6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,2■■■□□ 2,1
Psma8Q9CWH6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Psma8Q9CWH6 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Psma8Q9CWH6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Psma8Q9CWH6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Psma8Q9CWH6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Psma8Q9CWH6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Psma8Q9CWH6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Psma8Q9CWH6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Psma8Q9CWH6 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2,07
Psma8Q9CWH6 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Psma8Q9CWH6 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27,99■■■□□ 2,07
Psma8Q9CWH6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27,94■■■□□ 2,06
Psma8Q9CWH6 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Psma8Q9CWH6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Psma8Q9CWH6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,7 ms