RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)P

tW(CCA)P, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)P, Length 72 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)PtW(CCA)P NPR1P22211 790 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P AMD2P22580 549 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P PHO87P25360 923 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P YCR102CP25608 368 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P TAH1P25638 111 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P YMC1P32331 307 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P PET127P32606 800 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P YEL043WP32618 956 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P YME1P32795 747 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P HES1P35843 434 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P VPS21P36017 210 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P AUR1P36107 401 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P SHU2P38957 223 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P YDR089WP38966 869 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P VPS52P39904 641 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P SMX2P40204 77 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P COA1P40452 197 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P SEC24P40482 926 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P AXL1P40851 1208 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P COS4P43542 379 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P FAR3P46671 204 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P GCD14P46959 383 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P OCA1P50946 238 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P MAL11P53048 616 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P SDT1P53078 280 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P IBD2P53892 351 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P YNL140CP53910 189 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P LSM3P57743 89 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P REC102Q02721 264 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P SHR3Q02774 210 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P FDC1Q03034 503 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P USA1Q03714 838 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P SWF1Q04629 336 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P RQC1Q05468 723 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P PDR8Q06149 701 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P YDL218WQ07629 317 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P ENT4Q07872 247 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P NBA1Q08229 501 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P SLF1Q12034 447 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P NUR1Q12066 484 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P YLR049CQ12110 428 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P HUA2Q12134 243 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P WTM2Q12206 467 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P SLP1Q12232 587 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P Q0010Q9ZZX9 128 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P HFA1P32874 2273 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P TRA1P38811 3744 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P TRP3P00937 484 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P AI1P03875 834 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P AI3P03877 415 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P SPT3P06844 337 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P ILV2P07342 687 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P NMT1P14743 455 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P RPO26P20435 155 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P PRI2P20457 528 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P APN1P22936 367 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P MEF1P25039 761 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P ADH7P25377 361 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P SPS22P25380 463 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P YCL042WP25572 119 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P YJU2P28320 278 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P HEM3P28789 327 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P NUD1P32336 851 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P DCG1P32460 244 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P MKK2P32491 506 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P YSC84P32793 468 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P COX13P32799 129 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P ORC2P32833 620 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P ATO2P32907 282 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P LHS1P36016 881 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P VRP1P37370 817 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P YBR139WP38109 508 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P MCM7P38132 845 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P COS111P38308 924 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P YHR112CP38716 378 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P ATG7P38862 630 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P REV7P38927 245 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P SEC31P38968 1273 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P SCS2P40075 244 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P MET18P40469 1032 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P TED1P40533 473 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P FKH2P41813 862 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P MEP2P41948 499 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P PRM10P42946 383 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P IRC6P43615 237 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P YJR154WP47181 346 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P RAD17P48581 401 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P HSV2P50079 448 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P TEL2P53038 688 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P LCL3P53153 274 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P YGR053CP53234 283 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P YGR250CP53316 781 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P MAL13P53338 473 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P IST1P53843 298 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P ERG13P54839 491 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P YLR352WQ06479 807 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P YPR174CQ06616 221 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P MCH5Q08777 521 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P GPB1Q08886 897 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)PtW(CCA)P YOR376WQ08900 122 aa2.47□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19 ms