RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)M

tW(CCA)M, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)M, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)MtW(CCA)M NPR1P22211 790 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M AMD2P22580 549 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M PHO87P25360 923 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M YCR102CP25608 368 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M TAH1P25638 111 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M YMC1P32331 307 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M PET127P32606 800 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M YEL043WP32618 956 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M YME1P32795 747 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M HES1P35843 434 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M VPS21P36017 210 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M AUR1P36107 401 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M SHU2P38957 223 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M YDR089WP38966 869 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M VPS52P39904 641 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M SMX2P40204 77 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M COA1P40452 197 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M SEC24P40482 926 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M AXL1P40851 1208 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M COS4P43542 379 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M FAR3P46671 204 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M GCD14P46959 383 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M OCA1P50946 238 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M MAL11P53048 616 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M SDT1P53078 280 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M IBD2P53892 351 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M YNL140CP53910 189 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M LSM3P57743 89 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M REC102Q02721 264 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M SHR3Q02774 210 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M FDC1Q03034 503 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M USA1Q03714 838 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M SWF1Q04629 336 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M RQC1Q05468 723 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M PDR8Q06149 701 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M YDL218WQ07629 317 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M ENT4Q07872 247 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M NBA1Q08229 501 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M SLF1Q12034 447 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M NUR1Q12066 484 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M YLR049CQ12110 428 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M HUA2Q12134 243 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M WTM2Q12206 467 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M SLP1Q12232 587 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M Q0010Q9ZZX9 128 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M HFA1P32874 2273 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M TRA1P38811 3744 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M TRP3P00937 484 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M AI1P03875 834 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M AI3P03877 415 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M SPT3P06844 337 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M ILV2P07342 687 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M NMT1P14743 455 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M RPO26P20435 155 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M PRI2P20457 528 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M APN1P22936 367 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M MEF1P25039 761 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M ADH7P25377 361 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M SPS22P25380 463 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M YCL042WP25572 119 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M YJU2P28320 278 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M HEM3P28789 327 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M NUD1P32336 851 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M DCG1P32460 244 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M MKK2P32491 506 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M YSC84P32793 468 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M COX13P32799 129 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M ORC2P32833 620 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M ATO2P32907 282 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M LHS1P36016 881 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M VRP1P37370 817 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M YBR139WP38109 508 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M MCM7P38132 845 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M COS111P38308 924 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M YHR112CP38716 378 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M ATG7P38862 630 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M REV7P38927 245 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M SEC31P38968 1273 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M SCS2P40075 244 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M MET18P40469 1032 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M TED1P40533 473 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M FKH2P41813 862 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M MEP2P41948 499 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M PRM10P42946 383 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M IRC6P43615 237 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M YJR154WP47181 346 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M RAD17P48581 401 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M HSV2P50079 448 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M TEL2P53038 688 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M LCL3P53153 274 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M YGR053CP53234 283 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M YGR250CP53316 781 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M MAL13P53338 473 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M IST1P53843 298 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M ERG13P54839 491 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M YLR352WQ06479 807 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M YPR174CQ06616 221 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M MCH5Q08777 521 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M GPB1Q08886 897 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)MtW(CCA)M YOR376WQ08900 122 aa2.47□□□□□ -2.01
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