RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)J

tW(CCA)J, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)J, Length 72 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)JtW(CCA)J NPR1P22211 790 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J AMD2P22580 549 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J PHO87P25360 923 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J YCR102CP25608 368 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J TAH1P25638 111 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J YMC1P32331 307 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J PET127P32606 800 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J YEL043WP32618 956 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J YME1P32795 747 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J HES1P35843 434 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J VPS21P36017 210 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J AUR1P36107 401 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J SHU2P38957 223 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J YDR089WP38966 869 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J VPS52P39904 641 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J SMX2P40204 77 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J COA1P40452 197 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J SEC24P40482 926 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J AXL1P40851 1208 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J COS4P43542 379 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J FAR3P46671 204 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J GCD14P46959 383 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J OCA1P50946 238 aaPredicted RBP2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J MAL11P53048 616 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J SDT1P53078 280 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J IBD2P53892 351 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J YNL140CP53910 189 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J LSM3P57743 89 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J REC102Q02721 264 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J SHR3Q02774 210 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J FDC1Q03034 503 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J USA1Q03714 838 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J SWF1Q04629 336 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J RQC1Q05468 723 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J PDR8Q06149 701 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J YDL218WQ07629 317 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J ENT4Q07872 247 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J NBA1Q08229 501 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J SLF1Q12034 447 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J NUR1Q12066 484 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J YLR049CQ12110 428 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J HUA2Q12134 243 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J WTM2Q12206 467 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J SLP1Q12232 587 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J Q0010Q9ZZX9 128 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J HFA1P32874 2273 aa2.48□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J TRA1P38811 3744 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J TRP3P00937 484 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J AI1P03875 834 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J AI3P03877 415 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J SPT3P06844 337 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J ILV2P07342 687 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J NMT1P14743 455 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J RPO26P20435 155 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J PRI2P20457 528 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J APN1P22936 367 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J MEF1P25039 761 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J ADH7P25377 361 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J SPS22P25380 463 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J YCL042WP25572 119 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J YJU2P28320 278 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J HEM3P28789 327 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J NUD1P32336 851 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J DCG1P32460 244 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J MKK2P32491 506 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J YSC84P32793 468 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J COX13P32799 129 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J ORC2P32833 620 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J ATO2P32907 282 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J LHS1P36016 881 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J VRP1P37370 817 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J YBR139WP38109 508 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J MCM7P38132 845 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J COS111P38308 924 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J YHR112CP38716 378 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J ATG7P38862 630 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J REV7P38927 245 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J SEC31P38968 1273 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J SCS2P40075 244 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J MET18P40469 1032 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J TED1P40533 473 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J FKH2P41813 862 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J MEP2P41948 499 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J PRM10P42946 383 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J IRC6P43615 237 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J YJR154WP47181 346 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J RAD17P48581 401 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J HSV2P50079 448 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J TEL2P53038 688 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J LCL3P53153 274 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J YGR053CP53234 283 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J YGR250CP53316 781 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J MAL13P53338 473 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J IST1P53843 298 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J ERG13P54839 491 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J YLR352WQ06479 807 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J YPR174CQ06616 221 aaPredicted RBP2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J MCH5Q08777 521 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J GPB1Q08886 897 aa2.47□□□□□ -2.01
tW(CCA)JtW(CCA)J YOR376WQ08900 122 aa2.47□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.1 ms