RNA–Protein interactions for RNA: YOL093W

TRM10, Transcript of tRNA methyltransferase, yeast

Gene TRM10, Length 882 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRM10	YOL093W	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	RMD8	P43620	662 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	MAD3	P47074	515 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	NNF2	P53253	936 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	YNR061C	P53747	219 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	ARP4	P80428	489 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	YMR102C	Q03177	834 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	ARG7	Q04728	441 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	RSC3	Q06639	885 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	VAM6	Q07468	1049 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	APC9	Q12107	265 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	SRN2	Q99176	213 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	SAS5	Q99314	248 aa		4.78	□□□□□ -1.64
TRM10	YOL093W	MDM35	O60200	86 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	SUC2	P00724	532 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	COS2	P0CX12	379 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	COS3	P0CX13	379 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	PMR1	P13586	950 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	ARG1	P22768	420 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	DCG1	P32460	244 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	GMH1	P36125	273 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	CTP1	P38152	299 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	IML3	P38265	245 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	ARP1	P38696	384 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	ARN1	P38731	627 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	CYC2	P38909	366 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	SIT1	P39980	628 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	COA1	P40452	197 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	COS4	P43542	379 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	FRE4	P53746	719 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	BCP1	Q06338	283 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	RMD5	Q12508	421 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.77	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	PHO3	P24031	467 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	CLB3	P24870	427 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	ATP7	P30902	174 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	MRPL9	P31334	269 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	SFP1	P32432	683 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.76	□□□□□ -1.65	not detected
TRM10	YOL093W	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	NUP120	P35729	1037 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	UBA4	P38820	440 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	YDR089W	P38966	869 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	GIM4	P40005	111 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	EMP65	P40085	556 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	YJL070C	P40361	888 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	FKH2	P41813	862 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	ILM1	P47155	203 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	AQR1	P53943	586 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	EMI1	Q04406	187 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	ENT4	Q07872	247 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	UAF30	Q08747	228 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	ATG29	Q12092	213 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	NSL1	Q12143	216 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	YDR034W-B	Q6Q5X2	51 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	MEX67	Q99257	599 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	MET8	P15807	274 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	VPS34	P22543	875 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	RAD14	P28519	371 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	ZIP1	P31111	875 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	ATP11	P32453	318 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	PHO11	P35842	467 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	YCR087C-A	P37263	153 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	PHO12	P38693	467 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	YHR020W	P38708	688 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	YEN1	P40028	759 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	ALG5	P40350	334 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	YJR149W	P47177	404 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	SMA1	Q02651	245 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TRM10	YOL093W	YPL113C	Q02961	396 aa		4.75	□□□□□ -1.65

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