RNA–Protein interactions for RNA: YNL077W

APJ1, Transcript of Chaperone with a role in SUMO-mediated protein degradation, yeast

Gene APJ1, Length 1,587 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
APJ1	YNL077W	RPS1A	P33442	255 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
APJ1	YNL077W	GIC1	P38785	314 aa		4.97	□□□□□ -1.61
APJ1	YNL077W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
APJ1	YNL077W	YJR149W	P47177	404 aa		4.97	□□□□□ -1.61
APJ1	YNL077W	SPT20	P50875	604 aa		4.97	□□□□□ -1.61
APJ1	YNL077W	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
APJ1	YNL077W	YPL109C	Q02981	657 aa		4.97	□□□□□ -1.61
APJ1	YNL077W	ROT1	Q03691	256 aa		4.97	□□□□□ -1.61
APJ1	YNL077W	TRM82	Q03774	444 aa		4.97	□□□□□ -1.61
APJ1	YNL077W	FMN1	Q03778	218 aa		4.97	□□□□□ -1.61
APJ1	YNL077W	RAD34	Q06665	692 aa		4.97	□□□□□ -1.61
APJ1	YNL077W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
APJ1	YNL077W	YDR056C	Q12025	205 aa		4.97	□□□□□ -1.61
APJ1	YNL077W	YLR049C	Q12110	428 aa		4.97	□□□□□ -1.61
APJ1	YNL077W	COS2	P0CX12	379 aa		4.96	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	COS3	P0CX13	379 aa		4.96	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	RED1	P14291	827 aa		4.96	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	PPH21	P23594	369 aa		4.96	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	COX13	P32799	129 aa		4.96	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	RFC3	P38629	340 aa		4.96	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	INM1	P38710	295 aa		4.96	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	MET18	P40469	1032 aa		4.96	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	FKH2	P41813	862 aa		4.96	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	GCD10	P41814	478 aa		4.96	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	ZIM17	P42844	174 aa		4.96	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	COS4	P43542	379 aa		4.96	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	YJR030C	P47101	745 aa		4.96	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	MDM34	P53083	459 aa		4.96	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	GLO2	Q05584	274 aa		4.96	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	NBA1	Q08229	501 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	PNS1	Q12412	539 aa		4.96	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	TOA1	P32773	286 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	MRPL37	P36532	105 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	MUM2	P38236	366 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	ATG14	P38270	344 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	ELO1	P39540	310 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	SSU1	P41930	458 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	YFR020W	P43600	232 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	YGL176C	P46945	554 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	CIS3	P47001	227 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	COS12	P53053	380 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	SGF73	P53165	657 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	YNL260C	P53846	198 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	VHS1	Q03785	461 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	FAR10	Q06001	478 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	YDL121C	Q07541	149 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	THI73	Q07904	523 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	YEH2	Q07950	538 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	ESA1	Q08649	445 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	PFA4	Q12006	378 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	ATG29	Q12092	213 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	YPR011C	Q12251	326 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	ATG34	Q12292	412 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	GPR1	Q12361	961 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	SRN2	Q99176	213 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	CAN1	P04817	590 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	ARG1	P22768	420 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	RAD14	P28519	371 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	MLS1	P30952	554 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	PTC1	P35182	281 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	PIM1	P36775	1133 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	ARN1	P38731	627 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	YAL037W	P39728	267 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	FRT2	P39734	528 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	YEN1	P40028	759 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	NDE1	P40215	560 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	YPS6	P40583	537 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	SUN4	P53616	420 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	RGT2	Q12300	763 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	SUL2	Q12325	893 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	MHT1	Q12525	324 aa		4.95	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	MDM35	O60200	86 aa		4.94	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
APJ1	YNL077W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 33 ms