RNA–Protein interactions for RNA: YKR070W

YKR070W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeast

Gene YKR070W, Length 1,059 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKR070W	YKR070W	FIN1	Q03898	291 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	VPS74	Q06385	345 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	PHO92	Q06390	306 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	YDL121C	Q07541	149 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	RAD9	P14737	1309 aa		3.68	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	KRE5	P22023	1365 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	FOB1	O13329	566 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.67	□□□□□ -1.82	not detected
YKR070W	YKR070W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	AGA1	P32323	725 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	DUG2	P38149	878 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	SRO77	P38163	1010 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	TIF4631	P39935	952 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	YDR239C	Q03780	787 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	AYT1	Q12226	474 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	VPS13	Q07878	3144 aa		3.67	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	TUL1	P36096	758 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	YHR218W	P38899	603 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	ALG8	P40351	577 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	YJL132W	P47014	750 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	VPS75	P53853	264 aa		3.66	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	RAV1	P47104	1357 aa		3.65	□□□□□ -1.82
YKR070W	YKR070W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	COR1	P07256	457 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	OCA4	P25366	362 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	MSN2	P33748	704 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	RSM22	P36056	628 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	PMU1	P36069	295 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	YBR225W	P38321	900 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	MBB1	P39534	108 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	POP1	P41812	875 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	AIM22	P47051	409 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	BNA5	Q05979	453 aa		3.65	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	SUC2	P00724	532 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	ATR1	P13090	542 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	YCR022C	P25620	114 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	CST26	P38226	397 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	COS10	P52924	374 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	SNF2	P22082	1703 aa		3.64	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	PSK1	P31374	1356 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	YML133C	Q03099	1374 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	YLL067C	Q07888	1374 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	YLL066C	Q99208	1374 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	HEM2	P05373	342 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	ELO2	P25358	347 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	IMP2'	P32351	346 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	3.63	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	CBP4	P37267	147 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	PET130	P47065	347 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	MFB1	Q04922	465 aa		3.63	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	3.63	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	CUP1-1	P0CX80	61 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	CUP1-2	P0CX81	61 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	CBS2	P14905	389 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	PRD1	P25375	712 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	ERP2	P39704	215 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	3.62	□□□□□ -1.83	not detected
YKR070W	YKR070W	GWT1	P47026	490 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	3.62	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	WSC2	P53832	503 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	PDS5	Q04264	1277 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	3.62	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	MHP1	P43638	1398 aa		3.62	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	RPL31B	P0C2H9	113 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	MET8	P15807	274 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	YBR139W	P38109	508 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	IDP2	P41939	412 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	SUB1	P54000	292 aa	Known RBP	3.61	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	SEC39	Q12745	709 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	YDL007C-A	Q2V2Q0	85 aa		3.61	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	TOP1	P04786	769 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	3.6	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	3.6	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	MRE11	P32829	692 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	FRE2	P36033	711 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	YEL057C	P39983	233 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	HAT2	P39984	401 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	SPO22	P40511	975 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	MET28	P40573	187 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	URB2	P47108	1174 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	3.6	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	TWF1	P53250	332 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	RSA1	Q08932	381 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	YLL056C	Q12177	298 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	MED1	Q12321	566 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	CTF3	Q12748	733 aa		3.6	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.83
YKR070W	YKR070W	MUM2	P38236	366 aa		3.59	□□□□□ -1.83

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.1 ms