RNA–Protein interactions for RNA: YJL036W

SNX4, Transcript of Sorting nexin, yeastyeast

Gene SNX4, Length 1,272 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNX4YJL036W MEP1P40260 492 aa3.38□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W POP1P41812 875 aa3.38□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W FET5P43561 622 aa3.38□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W EPL1P43572 832 aa3.38□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W RPS0BP46654 252 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W ECM27P47144 725 aa3.38□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W NCS2P53923 493 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W RPL15BP54780 204 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W DBP9Q06218 594 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W MCP2Q06567 569 aa3.38□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W SNA4Q07549 140 aa3.38□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W YDL218WQ07629 317 aa3.38□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W YPT1P01123 206 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W RAD52P06778 471 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W PEP5P12868 1029 aa3.37□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W AIM17P23180 465 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W YEL043WP32618 956 aa3.37□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W REC114P32841 428 aa3.37□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W PFF1P38244 976 aa3.37□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W LAG1P38703 411 aa3.37□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W KEL1P38853 1164 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W VHS2P40463 436 aa3.37□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W MDV1P47025 714 aa3.37□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W BUD32P53323 261 aa3.37□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W YPL014WQ02606 381 aa3.37□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W ARP10Q04549 284 aa3.37□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W SPH1Q06160 661 aa3.37□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W PML1Q07930 204 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W PSY3Q12318 242 aa3.37□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W CAR1P00812 333 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W RIP1P08067 215 aa3.36□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W ATP10P18496 279 aa3.36□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W SGV1P23293 657 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W RHB1P25378 209 aa3.36□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W KRE2P27809 442 aa3.36□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W MSN2P33748 704 aa3.36□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W YER130CP39959 443 aa3.36□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W YIL089WP40500 205 aa3.36□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W CHS6P40955 746 aa3.36□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W CUE3P53137 624 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W PKP2P53170 491 aa3.36□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W SOL4P53315 255 aa3.36□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W YNR068CP53754 272 aa3.36□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W EAF7P53911 425 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W KTR5P53966 522 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W CTL1Q03220 320 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W VTI1Q04338 217 aa3.36□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W SSK1Q07084 712 aa3.36□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W YOR365CQ08844 703 aa3.36□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W NDD1Q08887 554 aa3.36□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W RRI1Q12468 440 aa3.36□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W MES1P00958 751 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W PMR1P13586 950 aa3.35□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W DAP2P18962 818 aa3.35□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W CNA1P23287 553 aa3.35□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W SNC1P31109 117 aa3.35□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W SIN4P32259 974 aa3.35□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W RIM1P32445 135 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W MRPL4P36517 319 aa3.35□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W ASC1P38011 319 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W DUG2P38149 878 aa3.35□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W EFM2P38347 419 aa3.35□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W MLH1P38920 769 aa3.35□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W VPS41P38959 992 aa3.35□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W SYG1P40528 902 aa3.35□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W HXT9P40885 567 aa3.35□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W TFG2P41896 400 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W VPS25P47142 202 aa3.35□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W YJR154WP47181 346 aa3.35□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W TOM22P49334 152 aa3.35□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W DRN1P53255 507 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W YNL234WP53857 426 aa3.35□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W PDR16P53860 351 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W AQR1P53943 586 aa3.35□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W SMA1Q02651 245 aa3.35□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W PRP3Q03338 469 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W RPN9Q04062 393 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W ATX2Q12067 313 aa3.35□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W BAR1P12630 587 aa3.34□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W SPC110P32380 944 aa3.34□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W ATP11P32453 318 aa3.34□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W PHO90P39535 881 aa3.34□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W YMR147WP40218 223 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W NAS2P40555 220 aa3.34□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W YIR016WP40572 265 aa3.34□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W MDM30Q05930 598 aa3.34□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W UBX3Q12229 455 aa3.34□□□□□ -1.87
SNX4YJL036W SCEIP03882 235 aa3.33□□□□□ -1.88
SNX4YJL036W GAL4P04386 881 aa3.33□□□□□ -1.88
SNX4YJL036W ARO3P14843 370 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SNX4YJL036W PRP21P32524 280 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
SNX4YJL036W RRN10P38204 145 aa3.33□□□□□ -1.88
SNX4YJL036W OLA1P38219 394 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SNX4YJL036W RRF1P38771 230 aa3.33□□□□□ -1.88
SNX4YJL036W PCL7P40186 285 aa3.33□□□□□ -1.88
SNX4YJL036W SHE4P51534 789 aa3.33□□□□□ -1.88
SNX4YJL036W PIB2P53191 635 aa3.33□□□□□ -1.88
SNX4YJL036W DSL1P53847 754 aa3.33□□□□□ -1.88
SNX4YJL036W RHO4Q00246 291 aa3.33□□□□□ -1.88
SNX4YJL036W VTC3Q02725 835 aa3.33□□□□□ -1.88
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