RNA–Protein interactions for RNA: YHR122W

CIA2, Transcript of Component of cytosolic iron-sulfur protein assembly (CIA) machinery, yeast

Gene CIA2, Length 696 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CIA2	YHR122W	PET130	P47065	347 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	CPR7	P47103	393 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	NNF2	P53253	936 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	VPS9	P54787	451 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	AIM32	Q04689	311 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	PRM6	Q04705	352 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	YLR345W	Q06137	509 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	ARO10	Q06408	635 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	INP53	Q12271	1107 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	CHS1	P08004	1131 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	APE1	P14904	514 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	CDC42	P19073	191 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	STE50	P25344	346 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	YCR051W	P25631	222 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	IME2	P32581	645 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	PKP1	P40530	394 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	YFR020W	P43600	232 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	FAR3	P46671	204 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	TWF1	P53250	332 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	YGR127W	P53275	312 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.82	□□□□□ -1.64	not detected
CIA2	YHR122W	YNL058C	P53947	316 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	BOP3	P53958	396 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	ADA2	Q02336	434 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	YOR389W	Q08912	624 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	RRD2	Q12461	358 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	PET111	P08468	800 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	PMA2	P19657	947 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	APN1	P22936	367 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	CLB1	P24868	471 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	DAL2	P25335	343 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	FRE1	P32791	686 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	NIP100	P33420	868 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	YBR144C	P34215	104 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	COY1	P34237	679 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	MUP3	P38734	546 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	ZIM17	P42844	174 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	PTR3	P43606	678 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	COS5	P47187	383 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	EFM6	P53970	246 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	GYL1	Q04322	720 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	YLR297W	Q05899	129 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	TAF10	Q12030	206 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	RLM1	Q12224	676 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	GIS3	Q12418	502 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	PEX34	P25584	144 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	GAC1	P28006	793 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	TOA1	P32773	286 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	MRE11	P32829	692 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	MDL1	P33310	695 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	YKL097C	P34245	136 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	SHE3	P38272	425 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	ICS2	P38284	255 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	CTM1	P38818	585 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	EXO1	P39875	702 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	SDS3	P40505	327 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	TDA10	P42938	290 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	YJR054W	P47114	497 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	SLG1	P54867	378 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	HER2	Q03557	464 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	GIS1	Q03833	894 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	PPM1	Q04081	328 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	CYK3	Q07533	885 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	GPM2	Q12008	311 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	ATG9	Q12142	997 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	AFI1	Q99222	893 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	BI2	P03873	423 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	MRP13	P12686	339 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	AAD3	P25612	363 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	IMG1	P25626	169 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	GSH1	P32477	678 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	GYP6	P32806	458 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	TKL2	P33315	681 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	ELO1	P39540	310 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CIA2	YHR122W	GDI1	P39958	451 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64

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