RNA–Protein interactions for RNA: YHR104W

GRE3, Transcript of Aldose reductase, yeast

Gene GRE3, Length 984 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GRE3	YHR104W	YDR541C	Q03049	344 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	MCP2	Q06567	569 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	RDR1	Q08904	546 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	RUP1	Q12242	671 aa		4.75	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	SCEI	P03882	235 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	YDR089W	P38966	869 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	PIB2	P53191	635 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	YNL143C	P53908	130 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	VTC3	Q02725	835 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	YMR111C	Q04461	462 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	POS5	Q06892	414 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	BUG1	Q12191	341 aa		4.74	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	PHO91	P27514	894 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	NIP1	P32497	812 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	RRN10	P38204	145 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	PHO90	P39535	881 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	YIL060W	P40519	144 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	IRC7	P43623	340 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	SOL4	P53315	255 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	PRM1	P53835	661 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	SSK1	Q07084	712 aa		4.73	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	ILV5	P06168	395 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	ALG1	P16661	449 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	RDS1	P25611	832 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	PCH2	P38126	564 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	YBL028C	P38202	106 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	RFC3	P38629	340 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	ELP2	P42935	788 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	YJR011C	P47086	261 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	EFM3	P47163	339 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	BUD32	P53323	261 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	HSP31	Q04432	237 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	YDL218W	Q07629	317 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	IRC10	Q08118	586 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.72	□□□□□ -1.65	not detected
GRE3	YHR104W	YLR111W	Q12528	110 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	TY1B-DR4	Q07793	1604 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GRE3	YHR104W	YPR089W	O13585	888 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	SEC63	P14906	663 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	GRR1	P24814	1151 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	ATP11	P32453	318 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	VPS41	P38959	992 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	VRG4	P40107	337 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	NMD5	P46970	1048 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	DSL1	P53847	754 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	RHO4	Q00246	291 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.71	□□□□□ -1.66	not detected
GRE3	YHR104W	RBA50	Q04418	439 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	MDM30	Q05930	598 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	SUC2	P00724	532 aa		4.7	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	ECM25	P32525	599 aa		4.7	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	PCA1	P38360	1216 aa		4.7	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	KEL1	P38853	1164 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	PCF11	P39081	626 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	SYG1	P40528	902 aa		4.7	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	HXT9	P40885	567 aa		4.7	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	YIP5	P53108	310 aa		4.7	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	YPL014W	Q02606	381 aa		4.7	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	CAC2	Q04199	468 aa		4.7	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	IPK1	Q06667	281 aa		4.7	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	NSE1	Q07913	336 aa		4.7	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	RRI1	Q12468	440 aa		4.7	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	ERG11	P10614	530 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	URE2	P23202	354 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	COQ3	P27680	312 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	RIB7	P33312	244 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	SOR1	P35497	357 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	HOT13	P36078	116 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	MRPL40	P36534	297 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	SPC97	P38863	823 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	VPS45	P38932	577 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	STN1	P38960	494 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	SAS2	P40963	338 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	BRO1	P48582	844 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	GPI1	P53306	609 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	ATP23	P53722	227 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	ORM2	Q06144	216 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	SOR2	Q07786	357 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	PFA4	Q12006	378 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GRE3	YHR104W	RRD2	Q12461	358 aa		4.69	□□□□□ -1.66

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