RNA–Protein interactions for RNA: YGR169C

PUS6, Transcript of tRNA:pseudouridine synthase, yeast

Gene PUS6, Length 1,215 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PUS6	YGR169C	HOG1	P32485	435 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	YKL100C	P34248	587 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	EFM1	P38732	585 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	YHR045W	P38775	560 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	PZF1	P39933	429 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	YEL073C	P39974	107 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	PHO23	P50947	330 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	CLD1	P53264	445 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	BIO4	P53630	237 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	YMR209C	Q03648	457 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	CSN9	Q03981	162 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	ASM4	Q05166	528 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	THI73	Q07904	523 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	ICT1	Q12385	394 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	LAS17	Q12446	633 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	SEN1	Q00416	2231 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	MDM35	O60200	86 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	HEM2	P05373	342 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	VPS34	P22543	875 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	YSR3	P23501	404 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	PPH21	P23594	369 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	CLB1	P24868	471 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	PHA2	P32452	334 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	PTM1	P32857	523 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	MUP3	P38734	546 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	YPS6	P40583	537 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	FET5	P43561	622 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	TEL2	P53038	688 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	MPS2	P53159	387 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	SUN4	P53616	420 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	RCF2	P53721	224 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	FAR8	Q05040	523 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	SFH1	Q06168	426 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	CRN1	Q06440	651 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	GUP2	Q08929	609 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	UBX3	Q12229	455 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	MDY2	Q12285	212 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	NCA2	Q12374	616 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	YAR066W	P0CX18	203 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	YHR214W	P0CX19	203 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	MET8	P15807	274 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	YCR051W	P25631	222 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	DCG1	P32460	244 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	UTH1	P36135	365 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	PIM1	P36775	1133 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	RIM2	P38127	377 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	ERV46	P39727	415 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	YAL037W	P39728	267 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	SSU1	P41930	458 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	PFA3	P42836	336 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	ZIM17	P42844	174 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	FAR3	P46671	204 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	ASI2	P53895	289 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	YMR155W	Q03795	547 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	YML096W	Q04489	525 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	BCH1	Q05029	724 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PUS6	YGR169C	HMG1	P12683	1054 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	ATP11	P32453	318 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	SKT5	P34226	696 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	ASK1	P35734	292 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	MRPL37	P36532	105 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	PHO89	P38361	574 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	UBA4	P38820	440 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	LTP1	P40347	161 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	AXL1	P40851	1208 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	GAT1	P43574	510 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	CIS3	P47001	227 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	GOT1	Q03554	138 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	TAF12	Q03761	539 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	TRM12	Q04235	462 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	BNA5	Q05979	453 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PUS6	YGR169C	SEC10	Q06245	871 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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