RNA–Protein interactions for RNA: YDR416W

SYF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene SYF1, Length 2,580 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYF1	YDR416W	EKI1	Q03764	534 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	RRG8	Q06109	277 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	VAM3	Q12241	283 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	CDC23	P16522	626 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	PMI40	P29952	429 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	HIR2	P32480	875 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	BUD2	P33314	1104 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	ARA1	P38115	344 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	RPP1	P38786	293 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	YRB2	P40517	327 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	ASN2	P49090	572 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	YGR126W	P53274	230 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	NRG1	Q03125	231 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	RSN1	Q03516	953 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	APC4	Q04601	652 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.07	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	OTU1	P43558	301 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	UBX6	P47049	396 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	MSY1	P48527	492 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	YGR127W	P53275	312 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	COQ6	P53318	479 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	YDR541C	Q03049	344 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	CAB5	Q03941	241 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	GTO3	Q04806	366 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	YPR078C	Q06813	372 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	CRT10	Q08226	957 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	RTC1	Q08281	1341 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	RAS1	P01119	309 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	SPS4	P09937	338 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	CHS2	P14180	963 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	DAL81	P21657	970 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	ELO2	P25358	347 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	IMG1	P25626	169 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	STV1	P37296	890 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	YHR045W	P38775	560 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	VOA1	P53262	265 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	TPO1	Q07824	586 aa		4.06	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	PMR1	P13586	950 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	ALG1	P16661	449 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	GID7	P25569	745 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	ADY2	P25613	283 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	MRPL7	P36519	292 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	RCY1	P39531	840 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	ELO1	P39540	310 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	AIM22	P47051	409 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	MRPS35	P53292	345 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	OCA2	P53949	197 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	RRN11	Q04712	507 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	IPK1	Q06667	281 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	INP53	Q12271	1107 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	APC2	Q12440	853 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	RRD2	Q12461	358 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	PUT2	P07275	575 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	PET111	P08468	800 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	RAD14	P28519	371 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	HES1	P35843	434 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	NUP133	P36161	1157 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	BAP3	P41815	604 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	GPN3	Q06543	272 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	ATG9	Q12142	997 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	YOR012W	Q12351	137 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	TRM11	Q12463	433 aa		4.05	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	COX1	P00401	534 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	ARG4	P04076	463 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	PEP5	P12868	1029 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	BEM1	P29366	551 aa		4.04	□□□□□ -1.76
SYF1	YDR416W	CDC5	P32562	705 aa		4.04	□□□□□ -1.76

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