RNA–Protein interactions for RNA: YCL057W

PRD1, Transcript of Zinc metalloendopeptidase, yeast

Gene PRD1, Length 2,139 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRD1	YCL057W	YOL159C	Q08300	171 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	PFA4	Q12006	378 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	INP53	Q12271	1107 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	GAL4	P04386	881 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	PEP5	P12868	1029 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	SNA3	P14359	133 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	CKA2	P19454	339 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	NUP1	P20676	1076 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	RPC37	P36121	282 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	END3	P39013	349 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	MRX6	P48564	524 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	HOP2	P53187	214 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	COS6	P53344	381 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	SHR3	Q02774	210 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	PPM1	Q04081	328 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.67	□□□□□ -1.66	not detected
PRD1	YCL057W	HIF1	Q12373	385 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	YPT6	Q99260	215 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	TOA1	P32773	286 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	MNN2	P38069	597 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	AGP2	P38090	596 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	DRN1	P53255	507 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	TIM10	P87108	93 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	OSH6	Q02201	448 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	RIM13	Q03792	727 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	DON1	Q05610	365 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	RUP1	Q12242	671 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	PMD1	P32634	1753 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	HEM15	P16622	393 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	CLB2	P24869	491 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	POL4	P25615	582 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	CCT6	P39079	546 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	BUR6	P40096	142 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	DOT5	P40553	215 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	YFH7	P43591	353 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	IRC6	P43615	237 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	YGR016W	P53209	190 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	PGA2	P53903	129 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	ASI1	P54074	624 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	RPM2	Q02773	1202 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	ACL4	Q03771	387 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	KRE28	Q04431	385 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	YLR297W	Q05899	129 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	NDL1	Q06568	189 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	YLR049C	Q12110	428 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	FIG2	P25653	1609 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	GCN4	P03069	281 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	SNF3	P10870	884 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	YAK1	P14680	807 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	CNA1	P23287	553 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	MRE11	P32829	692 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	AST1	P35183	429 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	MMS21	P38632	267 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	JEM1	P40358	645 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	TAF6	P53040	516 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	SHE10	P53075	577 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	USE1	P53146	245 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	PFA5	Q03289	374 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	FRE3	Q08905	711 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	RRD2	Q12461	358 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PRD1	YCL057W	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	RAP1	P11938	827 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	NAT1	P12945	854 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	MRPL25	P23369	157 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	VMA16	P23968	213 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	ADH7	P25377	361 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	GAA1	P39012	614 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	RGI2	P40188	164 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	GLO1	P50107	326 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	SUE1	Q06524	206 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	YEH1	Q07804	573 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	NSE1	Q07913	336 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	RCN2	Q12044	265 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	ATO2	P32907	282 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	RIB7	P33312	244 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	CFD1	P40558	293 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	RMD8	P43620	662 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	FMP33	P46998	180 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	SRB7	P47822	140 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	RBL2	P48606	106 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	YTP1	P53584	459 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	YML037C	Q03703	340 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	SWF1	Q04629	336 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	MFB1	Q04922	465 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PRD1	YCL057W	INH1	P01097	85 aa		4.64	□□□□□ -1.67

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