RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639525.1

SPIN3-223, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 5 BASIC

Gene SPIN3, Length 3,958 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-223	ENST00000639525	USP14	P54578	494 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SPIN3-223	ENST00000639525	E2F4	Q16254	413 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SPIN3-223	ENST00000639525	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SPIN3-223	ENST00000639525	JCAD	Q9P266	1359 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SPIN3-223	ENST00000639525	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SPIN3-223	ENST00000639525	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	12.97	□□□□□ -0.33
SPIN3-223	ENST00000639525	C12orf60	Q5U649	245 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SPIN3-223	ENST00000639525	COG1	Q8WTW3	980 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SPIN3-223	ENST00000639525	MED15	Q96RN5	788 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SPIN3-223	ENST00000639525	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SPIN3-223	ENST00000639525	VEZT	Q9HBM0	779 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SPIN3-223	ENST00000639525	BARHL2	Q9NY43	387 aa		12.97	□□□□□ -0.33
SPIN3-223	ENST00000639525	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
SPIN3-223	ENST00000639525	STAT3	P40763	770 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SPIN3-223	ENST00000639525	TMEM139	Q8IV31	216 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SPIN3-223	ENST00000639525	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SPIN3-223	ENST00000639525	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SPIN3-223	ENST00000639525	GDF11	O95390	407 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SPIN3-223	ENST00000639525	NEFH	P12036	1026 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SPIN3-223	ENST00000639525	CCDC174	Q6PII3	467 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SPIN3-223	ENST00000639525	RPGRIP1	Q96KN7	1286 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SPIN3-223	ENST00000639525	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SPIN3-223	ENST00000639525	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SPIN3-223	ENST00000639525	BACH1	O14867	736 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SPIN3-223	ENST00000639525	PALM	O75781	387 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SPIN3-223	ENST00000639525	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
SPIN3-223	ENST00000639525	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
SPIN3-223	ENST00000639525	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	12.96	□□□□□ -0.33
SPIN3-223	ENST00000639525	PAK2	Q13177	524 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SPIN3-223	ENST00000639525	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
SPIN3-223	ENST00000639525	KRT71	Q3SY84	523 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SPIN3-223	ENST00000639525	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		12.96	□□□□□ -0.33
SPIN3-223	ENST00000639525	RSRC2	Q7L4I2	434 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.33
SPIN3-223	ENST00000639525	CACNA1F	O60840	1977 aa		12.96	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	POTEB3	A0JP26	581 aa		12.96	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	POTEC	B2RU33	542 aa		12.96	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	KRIT1	O00522	736 aa		12.96	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	12.96	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	PPP1R2	P41236	205 aa		12.96	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		12.96	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	POTEB	Q6S5H4	581 aa		12.96	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	CCDC114	Q96M63	670 aa		12.96	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	12.96	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		12.96	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	ADAMTS3	O15072	1205 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	LRRN2	O75325	713 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	APBA1	Q02410	837 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	MYMK	A6NI61	221 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	CTNNA1	P35221	906 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	CPXCR1	Q8N123	301 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	L1RE1	Q9UN81	338 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	COL4A3BP	Q9Y5P4	624 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	TMEM132A	Q24JP5	1023 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	MSL1	Q68DK7	614 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	PDXDC2P	Q6P474	469 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	SPATA4	Q8NEY3	305 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	MRRF	Q96E11	262 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	AK8	Q96MA6	479 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	SCLT1	Q96NL6	688 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	MXD3	Q9BW11	206 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	CDCA7	Q9BWT1	371 aa	Predicted RBP	12.95	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		12.95	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	12.95	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	USP17L10	C9JJH3	530 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	ORC4	O43929	436 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	12.94	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	TNFAIP3	P21580	790 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	PLCD4	Q9BRC7	762 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	SLURP2	P0DP57	97 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	GRM4	Q14833	912 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	GALNT17	Q6IS24	598 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	RETREG2	Q8NC44	543 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	FANCG	O15287	622 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	EXOC3	O60645	756 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	KRT14	P02533	472 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	VPS41	P49754	854 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	CETN1	Q12798	172 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	NNT	Q13423	1086 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	12.94	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		12.94	□□□□□ -0.34
SPIN3-223	ENST00000639525	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		12.94	□□□□□ -0.34

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