RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625245.2

SMN1-211, Transcript of survival of motor neuron 1, telomeric, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene SMN1, Length 885 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1-211ENST00000625245 NUCB1Q02818 461 aa22.13■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 CCDC155Q8N6L0 562 aa22.13■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa22.13■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 IWS1Q96ST2 819 aa22.13■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 MAF1Q9H063 256 aa22.13■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 JMJD4Q9H9V9 463 aa22.13■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 CTNNA3Q9UI47 895 aa22.13■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 CHD7Q9P2D1 2997 aa22.12■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 KIF28PB7ZC32 967 aa22.12■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 CFBP00751 764 aa22.12■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 UBAC1Q9BSL1 405 aa22.12■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.12■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 KRT23Q9C075 422 aa22.12■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 HERC6Q8IVU3 1022 aa22.11■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 CAGE1Q8TC20 777 aa22.11■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 ARNTL2Q8WYA1 636 aa22.11■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 KAT2BQ92831 832 aa22.11■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 ALG1Q9BT22 464 aa22.11■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 NR3C2P08235 984 aa22.1■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 KCNJ6P48051 423 aa22.1■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 DGKDQ16760 1214 aa22.1■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 STAG2Q8N3U4 1231 aa22.1■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 AFAP1L1Q8TED9 768 aa22.1■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 MRVI1Q9Y6F6 885 aa22.1■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 NCOR1O75376 2440 aa22.09■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 TAP1Q03518 808 aa22.09■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 SESTD1Q86VW0 696 aa22.09■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 C7orf31Q8N865 590 aa22.09■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 AMNQ9BXJ7 453 aa22.09■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 CNNM2Q9H8M5 875 aa22.09■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 PXMP2Q9NR77 195 aa22.09■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 HDAC6Q9UBN7 1215 aa22.09■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 MTCH2Q9Y6C9 303 aa22.09■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 EPOPA6NHQ4 379 aa22.08■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 TLL1O43897 1013 aa22.08■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 BAIAP3O94812 1187 aa22.08■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 ARHGEF15O94989 841 aa22.08■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 SELPP16109 830 aa22.08■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 PSEN2P49810 448 aa22.08■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 TFF2Q03403 129 aa22.08■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 LAMC2Q13753 1193 aa22.08■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 LRRC8DQ7L1W4 858 aa22.08■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 CTAGE1Q96RT6 745 aa22.08■■□□□ 1.13
SMN1-211ENST00000625245 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SMN1-211ENST00000625245 KLRF2D3W0D1 207 aa22.07■■□□□ 1.12
SMN1-211ENST00000625245 SORBS3O60504 671 aa22.07■■□□□ 1.12
SMN1-211ENST00000625245 ZNF286BP0CG31 522 aa22.07■■□□□ 1.12
SMN1-211ENST00000625245 KRT40Q6A162 431 aa22.07■■□□□ 1.12
SMN1-211ENST00000625245 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.07■■□□□ 1.12
SMN1-211ENST00000625245 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SMN1-211ENST00000625245 ZBED2Q9BTP6 218 aa22.07■■□□□ 1.12
SMN1-211ENST00000625245 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa22.07■■□□□ 1.12
SMN1-211ENST00000625245 PTPRSQ13332 1948 aa22.07■■□□□ 1.12
SMN1-211ENST00000625245 MFSD10Q14728 455 aa22.06■■□□□ 1.12
SMN1-211ENST00000625245 KIAA0753Q2KHM9 967 aa22.06■■□□□ 1.12
SMN1-211ENST00000625245 AAK1Q2M2I8 961 aa22.06■■□□□ 1.12
SMN1-211ENST00000625245 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SMN1-211ENST00000625245 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SMN1-211ENST00000625245 KATNAL1Q9BW62 490 aa22.06■■□□□ 1.12
SMN1-211ENST00000625245 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa22.06■■□□□ 1.12
SMN1-211ENST00000625245 OPLAHO14841 1288 aa22.05■■□□□ 1.12
SMN1-211ENST00000625245 CKBP12277 381 aa22.05■■□□□ 1.12
SMN1-211ENST00000625245 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SMN1-211ENST00000625245 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SMN1-211ENST00000625245 HSD17B4P51659 736 aa22.05■■□□□ 1.12
SMN1-211ENST00000625245 WDR5P61964 334 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SMN1-211ENST00000625245 GPNMBQ14956 572 aa22.05■■□□□ 1.12
SMN1-211ENST00000625245 CYB5R4Q7L1T6 521 aa22.05■■□□□ 1.12
SMN1-211ENST00000625245 PPTC7Q8NI37 304 aa22.05■■□□□ 1.12
SMN1-211ENST00000625245 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SMN1-211ENST00000625245 ZBTB5O15062 677 aa22.04■■□□□ 1.12
SMN1-211ENST00000625245 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SMN1-211ENST00000625245 BMP1P13497 986 aa22.04■■□□□ 1.12
SMN1-211ENST00000625245 COL9A1P20849 921 aa22.04■■□□□ 1.12
SMN1-211ENST00000625245 SEC23AQ15436 765 aa22.04■■□□□ 1.12
SMN1-211ENST00000625245 CNKSR3Q6P9H4 555 aa22.04■■□□□ 1.12
SMN1-211ENST00000625245 HOMER1Q86YM7 354 aa22.04■■□□□ 1.12
SMN1-211ENST00000625245 PDCD2LQ9BRP1 358 aa22.04■■□□□ 1.12
SMN1-211ENST00000625245 IL25Q9H293 177 aa22.04■■□□□ 1.12
SMN1-211ENST00000625245 MAD2L2Q9UI95 211 aa22.04■■□□□ 1.12
SMN1-211ENST00000625245 NBNO60934 754 aa22.03■■□□□ 1.12
SMN1-211ENST00000625245 PARNO95453 639 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SMN1-211ENST00000625245 KCNQ1P51787 676 aa22.03■■□□□ 1.12
SMN1-211ENST00000625245 DEFB103AP81534 67 aa22.03■■□□□ 1.12
SMN1-211ENST00000625245 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SMN1-211ENST00000625245 TRDNQ13061 729 aa22.03■■□□□ 1.12
SMN1-211ENST00000625245 SPRED2Q7Z698 418 aa22.03■■□□□ 1.12
SMN1-211ENST00000625245 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SMN1-211ENST00000625245 SPATA33Q96N06 139 aa22.03■■□□□ 1.12
SMN1-211ENST00000625245 LCHNA4D1U4 455 aa22.02■■□□□ 1.12
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