RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589825.5

EFTUD2-215, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 600 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-215ENST00000589825 ARIH2O95376 493 aa18.55■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 TIMP1P01033 207 aa18.55■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 RTN1Q16799 776 aa18.55■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 FAM47CQ5HY64 1035 aa18.55■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 CCDC62Q6P9F0 684 aa18.55■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 TMTC3Q6ZXV5 915 aa18.55■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa18.54■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 GOLGA8AA7E2F4 631 aa18.54■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 GOLGA8BA8MQT2 603 aa18.54■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 CASTP20810 708 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 CHMP4BP1P59074 171 aa18.54■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 GNPTABQ3T906 1256 aa18.54■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 VSIG10LQ86VR7 867 aa18.54■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 TMEM199Q8N511 208 aa18.54■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 SLC43A3Q8NBI5 491 aa18.54■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 LRCH3Q96II8 777 aa18.54■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa18.54■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 PSTPIP2Q9H939 334 aa18.54■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 TBX21Q9UL17 535 aa18.54■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 SNX14Q9Y5W7 946 aa18.54■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa18.53■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 ITGB8P26012 769 aa18.53■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 LAMC2Q13753 1193 aa18.53■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 MFSD5Q6N075 450 aa18.53■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa18.53■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 AFG1LQ8WV93 481 aa18.53■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 KCNB2Q92953 911 aa18.53■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 BRPF3Q9ULD4 1205 aa18.53■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa18.52■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa18.52■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 STAM2O75886 525 aa18.52■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 CD4P01730 458 aa18.52■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 MMP3P08254 477 aa18.52■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 TGFB3P10600 412 aa18.52■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 ARHGAP1Q07960 439 aa18.52■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP18.52■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 SHHQ15465 462 aa18.52■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 DGKDQ16760 1214 aa18.52■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 USP17L6PQ6QN14 398 aa18.52■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 Q6ZUG5 572 aa18.52■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 HIPK3Q9H422 1215 aa18.52■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 MYH7BA7E2Y1 1941 aa18.52■□□□□ 0.56
EFTUD2-215ENST00000589825 GRIN2DO15399 1336 aa18.51■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 SPDYE3A6NKU9 549 aa18.51■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 PIK3CDO00329 1044 aa18.51■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 CPA1P15085 419 aa18.51■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP18.51■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 RCAN1P53805 252 aa18.51■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 NBPF20Q3BBV1 942 aa18.51■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 GPR153Q6NV75 609 aa18.51■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 IL31RAQ8NI17 732 aa18.51■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 TRPV6Q9H1D0 765 aa18.51■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 EHMT1Q9H9B1 1298 aa18.51■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 MLXIPQ9HAP2 919 aa18.51■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 NOD1Q9Y239 953 aa18.51■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 B4GALT4O60513 344 aa18.5■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 RPS6KB1P23443 525 aa18.5■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 APOBRQ0VD83 1088 aa18.5■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 C9orf50Q5SZB4 431 aa18.5■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 XRRA1Q6P2D8 792 aa18.5■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 NFRKBQ6P4R8 1299 aa18.5■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 BRF1Q92994 677 aa18.5■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 MEIS2O14770 477 aa18.49■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 GGPS1O95749 300 aa18.49■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 NAPAP54920 295 aa18.49■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 NLRX1Q86UT6 975 aa18.49■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 PPTC7Q8NI37 304 aa18.49■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP18.49■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 SPATA33Q96N06 139 aa18.49■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 KATNAL1Q9BW62 490 aa18.49■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 RTEL1Q9NZ71 1219 aa18.49■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 V9GY48 417 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa18.49■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 hCG_1984214I3L0E3 225 aa18.48■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 SORBS3O60504 671 aa18.48■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 RGS20O76081 388 aa18.48■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 CSF2RAP15509 400 aa18.48■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 CYP2C18P33260 490 aa18.48■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 NEDD9Q14511 834 aa18.48■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 PCNX4Q63HM2 1172 aa18.48■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa18.48■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 FRMPD4Q14CM0 1322 aa18.48■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 NOP56O00567 594 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 FIBPO43427 364 aa18.47■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 PPFIA4O75335 1185 aa18.47■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
EFTUD2-215ENST00000589825 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms