RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	GJA8	P48165	433 aa		28.51	■■■□□ 2.15
GPS1-223	ENST00000584229	TNFAIP2	Q03169	654 aa		28.51	■■■□□ 2.15
GPS1-223	ENST00000584229	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		28.51	■■■□□ 2.15
GPS1-223	ENST00000584229	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		28.51	■■■□□ 2.15
GPS1-223	ENST00000584229	BLID	Q8IZY5	108 aa		28.51	■■■□□ 2.15
GPS1-223	ENST00000584229	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		28.51	■■■□□ 2.15
GPS1-223	ENST00000584229	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		28.51	■■■□□ 2.15
GPS1-223	ENST00000584229	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		28.51	■■■□□ 2.15
GPS1-223	ENST00000584229	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	28.51	■■■□□ 2.15
GPS1-223	ENST00000584229	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	28.5	■■■□□ 2.15
GPS1-223	ENST00000584229	GUCY1B3	Q02153	619 aa		28.5	■■■□□ 2.15
GPS1-223	ENST00000584229	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		28.5	■■■□□ 2.15
GPS1-223	ENST00000584229	MCTP2	Q6DN12	878 aa		28.5	■■■□□ 2.15
GPS1-223	ENST00000584229	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	28.5	■■■□□ 2.15
GPS1-223	ENST00000584229	SCFD2	Q8WU76	684 aa		28.5	■■■□□ 2.15
GPS1-223	ENST00000584229	C8orf76	Q96K31	380 aa		28.5	■■■□□ 2.15
GPS1-223	ENST00000584229	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		28.5	■■■□□ 2.15
GPS1-223	ENST00000584229	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		28.5	■■■□□ 2.15
GPS1-223	ENST00000584229	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		28.5	■■■□□ 2.15
GPS1-223	ENST00000584229	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	28.49	■■■□□ 2.15
GPS1-223	ENST00000584229	GALNT17	Q6IS24	598 aa		28.49	■■■□□ 2.15
GPS1-223	ENST00000584229	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		28.49	■■■□□ 2.15
GPS1-223	ENST00000584229	KIF3A	Q9Y496	699 aa		28.49	■■■□□ 2.15
GPS1-223	ENST00000584229	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		28.49	■■■□□ 2.15
GPS1-223	ENST00000584229	ADCY6	O43306	1168 aa		28.48	■■■□□ 2.15
GPS1-223	ENST00000584229	TTLL4	Q14679	1199 aa		28.48	■■■□□ 2.15
GPS1-223	ENST00000584229	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		28.48	■■■□□ 2.15
GPS1-223	ENST00000584229	LHX8	Q68G74	356 aa		28.48	■■■□□ 2.15
GPS1-223	ENST00000584229	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		28.48	■■■□□ 2.15
GPS1-223	ENST00000584229	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		28.48	■■■□□ 2.15
GPS1-223	ENST00000584229	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	28.47	■■■□□ 2.15
GPS1-223	ENST00000584229	SMPD1	P17405	629 aa		28.47	■■■□□ 2.15
GPS1-223	ENST00000584229	GJB2	P29033	226 aa		28.47	■■■□□ 2.15
GPS1-223	ENST00000584229	KRT2	P35908	639 aa		28.47	■■■□□ 2.15
GPS1-223	ENST00000584229	ZNF76	P36508	570 aa		28.47	■■■□□ 2.15
GPS1-223	ENST00000584229	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	28.47	■■■□□ 2.15
GPS1-223	ENST00000584229	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	28.47	■■■□□ 2.15
GPS1-223	ENST00000584229	KRT40	Q6A162	431 aa		28.47	■■■□□ 2.15
GPS1-223	ENST00000584229	STAM2	O75886	525 aa		28.46	■■■□□ 2.15
GPS1-223	ENST00000584229	PGK1	P00558	417 aa		28.46	■■■□□ 2.15
GPS1-223	ENST00000584229	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		28.46	■■■□□ 2.15
GPS1-223	ENST00000584229	TLK2	Q86UE8	772 aa		28.46	■■■□□ 2.15
GPS1-223	ENST00000584229	SNX21	Q969T3	373 aa		28.46	■■■□□ 2.15
GPS1-223	ENST00000584229	SPC25	Q9HBM1	224 aa		28.46	■■■□□ 2.15
GPS1-223	ENST00000584229	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		28.46	■■■□□ 2.15
GPS1-223	ENST00000584229	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		28.45	■■■□□ 2.15
GPS1-223	ENST00000584229	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	28.45	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	PTGS1	P23219	599 aa		28.45	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	SREBF1	P36956	1147 aa		28.45	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	ARHGAP4	P98171	946 aa		28.45	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	28.45	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		28.45	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	NLRX1	Q86UT6	975 aa		28.45	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		28.45	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		28.44	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	28.44	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	MMP1	P03956	469 aa		28.44	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	28.44	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	NPY5R	Q15761	445 aa		28.44	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	LY6K	Q17RY6	165 aa		28.44	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		28.44	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	OXER1	Q8TDS5	423 aa		28.44	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	CRISPLD2	Q9H0B8	497 aa		28.44	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		28.44	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	BRCA2	P51587	3418 aa		28.44	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	KBTBD13	C9JR72	458 aa		28.43	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	SORBS3	O60504	671 aa		28.43	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	ARIH2	O95376	493 aa		28.43	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	28.43	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	28.43	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		28.43	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		28.43	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		28.43	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	COPS5	Q92905	334 aa		28.43	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	28.42	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	RGS20	O76081	388 aa		28.42	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	CUL4A	Q13619	759 aa		28.42	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	28.42	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	RNF180	Q86T96	592 aa		28.42	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	28.42	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	TBCK	Q8TEA7	893 aa		28.42	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	28.42	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	PKD2L1	Q9P0L9	805 aa		28.42	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	28.41	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	FIBP	O43427	364 aa		28.41	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	28.41	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	NR5A1	Q13285	461 aa		28.41	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	MTMR1	Q13613	665 aa		28.41	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	KCNV1	Q6PIU1	500 aa		28.41	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		28.41	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	28.41	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229		M0R2N6	131 aa		28.4	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	LRRC41	Q15345	812 aa		28.4	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	MYADML2	A6NDP7	307 aa		28.39	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	BTBD18	B2RXH4	712 aa		28.39	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229		H3BQV1	296 aa		28.39	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	GH1	P01241	217 aa		28.39	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	ITGB5	P18084	799 aa		28.39	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	28.39	■■■□□ 2.14
GPS1-223	ENST00000584229	BEX3	Q00994	111 aa		28.39	■■■□□ 2.14

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