RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568388.5

SPNS1-210, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 759 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-210ENST00000568388 FGD4Q96M96 766 aa21.27■■□□□ 1
SPNS1-210ENST00000568388 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa21.27■■□□□ 1
SPNS1-210ENST00000568388 ASTN1O14525 1302 aa21.27■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 MCM3APO60318 1980 aa21.27■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 GPR25O00155 361 aa21.26■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 COBLO75128 1261 aa21.26■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 STAM2O75886 525 aa21.26■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 EDNRBP24530 442 aa21.26■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 FCGRTP55899 365 aa21.26■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 Q4G0T1 1027 aa21.26■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 NIPA1Q7RTP0 329 aa21.26■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 C4orf32Q8N8J7 132 aa21.26■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 MORC4Q8TE76 937 aa21.26■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP21.26■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 SLC5A4Q9NY91 659 aa21.26■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 GJD2Q9UKL4 321 aa21.26■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 LRRC37A2A6NM11 1700 aa21.25■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 LAD1O00515 517 aa21.25■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 TDP2O95551 362 aa21.25■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 HOXC6P09630 235 aa21.25■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 NCLP19338 710 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 CTGFP29279 349 aa21.25■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 CCND2P30279 289 aa21.25■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 MCM7P33993 719 aa21.25■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 UBXN2AP68543 259 aa21.25■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 MAP2K5Q13163 448 aa21.25■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 KIF22Q14807 665 aa21.25■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 IL31RAQ8NI17 732 aa21.25■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP21.25■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 NUDT12Q9BQG2 462 aa21.25■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa21.25■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa21.24■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 ASB14A6NK59 587 aa21.24■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 FAM86B1E9PN63 330 aa21.24■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 MEIS1O00470 390 aa21.24■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 PPP6R2O75170 966 aa21.24■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 FAM86B2P0C5J1 330 aa21.24■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 ZNF76P36508 570 aa21.24■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 PSMC4P43686 418 aa21.24■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 PTGDRQ13258 359 aa21.24■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 STK38Q15208 465 aa21.24■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa21.24■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 CEP55Q53EZ4 464 aa21.24■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 DPP9Q86TI2 863 aa21.24■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 TMEM87AQ8NBN3 555 aa21.24■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 KCNG4Q8TDN1 519 aa21.24■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 SOCS4Q8WXH5 440 aa21.24■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 SPATA32Q96LK8 384 aa21.24■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 MXRA8Q9BRK3 442 aa21.24■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa21.24■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 ELP1O95163 1332 aa21.24■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 TBX3O15119 743 aa21.23■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 SPTLC2O15270 562 aa21.23■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 NEMFO60524 1076 aa21.23■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 STXBP2Q15833 593 aa21.23■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa21.23■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 LENG9Q96B70 501 aa21.23■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 TRIM47Q96LD4 638 aa21.23■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 JADE2Q9NQC1 790 aa21.23■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 MAFGO15525 162 aa21.22■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 FIBPO43427 364 aa21.22■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 SLC37A4O43826 429 aa21.22■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 PRPHP41219 470 aa21.22■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 RGS2P41220 211 aa21.22■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 MTMR9Q96QG7 549 aa21.22■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 FKTNO75072 461 aa21.21■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 GNRH1P01148 92 aa21.21■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 ITGB5P18084 799 aa21.21■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 SETQ01105 290 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 PRR16Q569H4 304 aa21.21■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 PLA2G4DQ86XP0 818 aa21.21■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 NPLOC4Q8TAT6 608 aa21.21■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 CYP2W1Q8TAV3 490 aa21.21■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 GPRASP2Q96D09 838 aa21.21■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 MAML3Q96JK9 1138 aa21.21■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa21.21■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 TMEM60Q9H2L4 133 aa21.21■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 KCNMB3Q9NPA1 279 aa21.21■□□□□ 0.99
SPNS1-210ENST00000568388 GOLGA6L22H0YM25 854 aa21.2■□□□□ 0.98
SPNS1-210ENST00000568388 OR52Z1P0C646 297 aa21.2■□□□□ 0.98
SPNS1-210ENST00000568388 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
SPNS1-210ENST00000568388 PDE4DQ08499 809 aa21.2■□□□□ 0.98
SPNS1-210ENST00000568388 ARHGEF6Q15052 776 aa21.2■□□□□ 0.98
SPNS1-210ENST00000568388 CALCRLQ16602 461 aa21.2■□□□□ 0.98
SPNS1-210ENST00000568388 NLRX1Q86UT6 975 aa21.2■□□□□ 0.98
SPNS1-210ENST00000568388 POTEDQ86YR6 584 aa21.2■□□□□ 0.98
SPNS1-210ENST00000568388 FERMT2Q96AC1 680 aa21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms