RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCDC62Q6P9F0 684 aa8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 RGS22Q8NE09 1264 aa8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 NCOA7Q8NI08 942 aa8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 HERVK_113Q902F9 699 aa8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 ALG1Q9BT22 464 aa8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 MSRAQ9UJ68 235 aa8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
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CCNDBP1-212ENST00000567690 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa8.33□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa8.32□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 RXRAP19793 462 aa8.32□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 HSD17B4P51659 736 aa8.32□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 PGM5Q15124 567 aa8.32□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 RAB30Q15771 203 aa8.32□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 PTGISQ16647 500 aa8.32□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 CATIPQ7Z7H3 387 aa8.32□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 KAT2BQ92831 832 aa8.32□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP8.32□□□□□ -1.085e-6■□□□□ 9.8
CCNDBP1-212ENST00000567690 VWCEQ96DN2 955 aa8.32□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 PDCD2LQ9BRP1 358 aa8.32□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa8.32□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP8.32□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRDM6Q9NQX0 595 aa8.32□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 PPP4R2Q9NY27 417 aa8.32□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa8.32□□□□□ -1.08
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CCNDBP1-212ENST00000567690 PRC1O43663 620 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 CYTH3O43739 400 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 KPNA6O60684 536 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 RGS20O76081 388 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 GGPS1O95749 300 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 POLR2MP0CAP2 368 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 IGFBP4P22692 258 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCND2P30279 289 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 PSEN2P49810 448 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 TROAPQ12815 778 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 PPP2R2DQ66LE6 453 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 NFRKBQ6P4R8 1299 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 CASC1Q6TDU7 716 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 NFXL1Q6ZNB6 911 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
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CCNDBP1-212ENST00000567690 C7orf31Q8N865 590 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 RETREG2Q8NC44 543 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 MAP4K1Q92918 833 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 MTMR8Q96EF0 704 aa8.31□□□□□ -1.08
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CCNDBP1-212ENST00000567690 IWS1Q96ST2 819 aa8.31□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 ANP32EQ9BTT0 268 aa8.31□□□□□ -1.08
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CCNDBP1-212ENST00000567690 COL6A3P12111 3177 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa8.3□□□□□ -1.08
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CCNDBP1-212ENST00000567690 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 PLEKHA8P1O95397 391 aa8.3□□□□□ -1.08
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CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 SP4Q02446 784 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 MFSD10Q14728 455 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 DGKDQ16760 1214 aa8.3□□□□□ -1.08
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CCNDBP1-212ENST00000567690 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCDC155Q8N6L0 562 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 CTAGE1Q96RT6 745 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
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CCNDBP1-212ENST00000567690 RIOX1Q9H6W3 641 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 CERS4Q9HA82 394 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 LY9Q9HBG7 655 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 HDAC6Q9UBN7 1215 aa8.3□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 MYH7BA7E2Y1 1941 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCDC69A6NI79 296 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 PITPNM1O00562 1244 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 DDAH1O94760 285 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 ARHGEF15O94989 841 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 CA3P07451 260 aa8.29□□□□□ -1.08
CCNDBP1-212ENST00000567690 PFKMP08237 780 aa8.29□□□□□ -1.08
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