RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558831.5

USP3-AS1-201, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3-AS1, Length 1,784 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-201ENST00000558831 PFASO15067 1338 aa19.5■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 CYP3A4P08684 503 aa19.49■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 PRR16Q569H4 304 aa19.49■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 WDR78Q5VTH9 848 aa19.49■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 MOXD1Q6UVY6 613 aa19.49■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 EPSTI1Q96J88 318 aa19.49■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 PANK2Q9BZ23 570 aa19.49■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 HPSEQ9Y251 543 aa19.49■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa19.49■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 CYP3A7P24462 503 aa19.49■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 TECP42680 631 aa19.49■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMEM266Q2M3C6 531 aa19.49■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 USP49Q70CQ1 688 aa19.49■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 TAAR1Q96RJ0 339 aa19.49■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 CLSTN2Q9H4D0 955 aa19.49■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 CYP39A1Q9NYL5 469 aa19.49■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 TLR2O60603 784 aa19.48■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 MAP2K2P36507 400 aa19.48■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 PDILTQ8N807 584 aa19.48■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 MTMR9Q96QG7 549 aa19.48■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 UIMC1Q96RL1 719 aa19.48■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 SDF4Q9BRK5 362 aa19.48■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 CPA4Q9UI42 421 aa19.48■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 ADGRA2Q96PE1 1338 aa19.48■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa19.47■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM86B1E9PN63 330 aa19.47■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 CA12O43570 354 aa19.47■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM86B2P0C5J1 330 aa19.47■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 CIITAP33076 1130 aa19.47■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 TXLNAP40222 546 aa19.47■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 VEGFBP49765 207 aa19.47■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP19.47■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 BCRP11274 1271 aa19.47■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 HTRA3P83110 453 aa19.47■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 CRHR2Q13324 411 aa19.47■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 KCTD2Q14681 263 aa19.47■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 GSE1Q14687 1217 aa19.47■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 Q4G0T1 1027 aa19.47■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 ARHGEF16Q5VV41 709 aa19.47■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 MBOAT7Q96N66 472 aa19.47■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 RMDN3Q96TC7 470 aa19.47■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 PORCNQ9H237 461 aa19.47■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 EFCC1Q9HA90 598 aa19.47■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 FCER1AP12319 257 aa19.46■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 CDC25AP30304 524 aa19.46■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 RASSF8Q8NHQ8 419 aa19.46■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 CYP2W1Q8TAV3 490 aa19.46■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 GJA10Q969M2 543 aa19.46■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 MMP19Q99542 508 aa19.46■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 RAB34Q9BZG1 259 aa19.46■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa19.46■□□□□ 0.71
USP3-AS1-201ENST00000558831 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP19.45■□□□□ 0.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 MAPK4P31152 587 aa19.45■□□□□ 0.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 UBA7P41226 1012 aa19.45■□□□□ 0.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 C17orf99Q6UX52 265 aa19.45■□□□□ 0.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 CKAP2LQ8IYA6 745 aa19.45■□□□□ 0.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLFN12Q8IYM2 578 aa19.45■□□□□ 0.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 CNNM3Q8NE01 707 aa19.45■□□□□ 0.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 HAS1Q92839 578 aa19.45■□□□□ 0.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 AK8Q96MA6 479 aa19.45■□□□□ 0.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 PXMP2Q9NR77 195 aa19.45■□□□□ 0.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 PCDHA12Q9UN75 941 aa19.45■□□□□ 0.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 RPTORQ8N122 1335 aa19.45■□□□□ 0.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 PP2D1A8MPX8 630 aa19.44■□□□□ 0.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 POTEB2H3BUK9 544 aa19.44■□□□□ 0.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 CTAGE5O15320 804 aa19.44■□□□□ 0.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 PGM5Q15124 567 aa19.44■□□□□ 0.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 PLA2G4DQ86XP0 818 aa19.44■□□□□ 0.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP19.44■□□□□ 0.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 TIGD1Q96MW7 591 aa19.44■□□□□ 0.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 KCNMB3Q9NPA1 279 aa19.44■□□□□ 0.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 LRWD1Q9UFC0 647 aa19.44■□□□□ 0.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 STRNO43815 780 aa19.44■□□□□ 0.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP19.44■□□□□ 0.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF445P59923 1031 aa19.44■□□□□ 0.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP19.44■□□□□ 0.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 LONRF3Q496Y0 759 aa19.44■□□□□ 0.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 CEP55Q53EZ4 464 aa19.44■□□□□ 0.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 DNERQ8NFT8 737 aa19.44■□□□□ 0.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 DHX58Q96C10 678 aa19.44■□□□□ 0.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa19.44■□□□□ 0.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 TBX3O15119 743 aa19.43■□□□□ 0.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 PCNX4Q63HM2 1172 aa19.43■□□□□ 0.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 KRBA2Q6ZNG9 492 aa19.43■□□□□ 0.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 IGSF22Q8N9C0 903 aa19.43■□□□□ 0.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 IL31RAQ8NI17 732 aa19.43■□□□□ 0.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 LENG9Q96B70 501 aa19.43■□□□□ 0.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 MXRA8Q9BRK3 442 aa19.43■□□□□ 0.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 PDCD2LQ9BRP1 358 aa19.43■□□□□ 0.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP19.43■□□□□ 0.7
USP3-AS1-201ENST00000558831 SERTAD1Q9UHV2 236 aa19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.8 ms