RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557500.2

TVP23BP1-201, Transcript of TVP23B pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TVP23BP1, Length 617 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BP1-201ENST00000557500 C7orf31Q8N865 590 aa4.91□□□□□ -1.62
TVP23BP1-201ENST00000557500 RGS22Q8NE09 1264 aa4.91□□□□□ -1.62
TVP23BP1-201ENST00000557500 DNERQ8NFT8 737 aa4.91□□□□□ -1.62
TVP23BP1-201ENST00000557500 AFG1LQ8WV93 481 aa4.91□□□□□ -1.62
TVP23BP1-201ENST00000557500 PGBD1Q96JS3 809 aa4.91□□□□□ -1.62
TVP23BP1-201ENST00000557500 SPATA33Q96N06 139 aa4.91□□□□□ -1.62
TVP23BP1-201ENST00000557500 ALG1Q9BT22 464 aa4.91□□□□□ -1.62
TVP23BP1-201ENST00000557500 RIOX1Q9H6W3 641 aa4.91□□□□□ -1.62
TVP23BP1-201ENST00000557500 PXMP2Q9NR77 195 aa4.91□□□□□ -1.62
TVP23BP1-201ENST00000557500 POLR3EQ9NVU0 708 aa4.91□□□□□ -1.62
TVP23BP1-201ENST00000557500 COL20A1Q9P218 1284 aa4.91□□□□□ -1.62
TVP23BP1-201ENST00000557500 PHF24Q9UPV7 400 aa4.91□□□□□ -1.62
TVP23BP1-201ENST00000557500 ZBBXA8MT70 800 aa4.9□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 ADCY6O43306 1168 aa4.9□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 CYTH3O43739 400 aa4.9□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 ADAMTS4O75173 837 aa4.9□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 GGPS1O95749 300 aa4.9□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 ZNF286BP0CG31 522 aa4.9□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 NEK4P51957 841 aa4.9□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 CCL23P55773 120 aa4.9□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 GJA9P57773 515 aa4.9□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 ITGA7Q13683 1181 aa4.9□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 PGM5Q15124 567 aa4.9□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 DUSP28Q4G0W2 176 aa4.9□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 WWC2Q6AWC2 1192 aa4.9□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 TAPT1Q6NXT6 567 aa4.9□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 CYFIP1Q7L576 1253 aa4.9□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 RETREG2Q8NC44 543 aa4.9□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 IL31RAQ8NI17 732 aa4.9□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 BADQ92934 168 aa4.9□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 FGD4Q96M96 766 aa4.9□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 IWS1Q96ST2 819 aa4.9□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 MAP3K14Q99558 947 aa4.9□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 PDCD2LQ9BRP1 358 aa4.9□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 MTA3Q9BTC8 594 aa4.9□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 SPZ1Q9BXG8 430 aa4.9□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 USP26Q9BXU7 913 aa4.9□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP4.9□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 TRPV6Q9H1D0 765 aa4.9□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 C6orf50Q9HD87 102 aa4.9□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 TMEM260Q9NX78 707 aa4.9□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 LAMB1P07942 1786 aa4.9□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 ASTN1O14525 1302 aa4.9□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 PTPRFP10586 1907 aa4.89□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 MYH8P13535 1937 aa4.89□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 ARVCFO00192 962 aa4.89□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 BACH1O14867 736 aa4.89□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP4.89□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 CABYRO75952 493 aa4.89□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 CDKL5O76039 1030 aa4.89□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 ARIH2O95376 493 aa4.89□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 ACRP10323 421 aa4.89□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 CYP2C9P11712 490 aa4.89□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 COL6A1P12109 1028 aa4.89□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 SCG2P13521 617 aa4.89□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 XBP1P17861 261 aa4.89□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 CDC27P30260 824 aa4.89□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 CYP2C18P33260 490 aa4.89□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 HSD17B4P51659 736 aa4.89□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 IGBP1P78318 339 aa4.89□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 FPGSQ05932 587 aa4.89□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 MTMR1Q13613 665 aa4.89□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 LAMC2Q13753 1193 aa4.89□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 TRIM29Q14134 588 aa4.89□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 ANKRD1Q15327 319 aa4.89□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 DGKDQ16760 1214 aa4.89□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 SLC35G1Q2M3R5 365 aa4.89□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 NBPF20Q3BBV1 942 aa4.89□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa4.89□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 DEFB128Q7Z7B8 93 aa4.89□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa4.89□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 SGMS1Q86VZ5 419 aa4.89□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 CKAP2LQ8IYA6 745 aa4.89□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 TMEM199Q8N511 208 aa4.89□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 NECAB1Q8N987 351 aa4.89□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 BICD2Q8TD16 824 aa4.89□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 KCNV2Q8TDN2 545 aa4.89□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 GLG1Q92896 1179 aa4.89□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 FAM161BQ96MY7 647 aa4.89□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 SDF4Q9BRK5 362 aa4.89□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 HIPK3Q9H422 1215 aa4.89□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa4.89□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 VPS54Q9P1Q0 977 aa4.89□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 PCDHA6Q9UN73 950 aa4.89□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 SAMM50Q9Y512 469 aa4.89□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa4.89□□□□□ -1.63
TVP23BP1-201ENST00000557500 ELP1O95163 1332 aa4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms