RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536144.1

MRE11-206, Transcript of MRE11 homolog, double strand break repair nuclease, human

TSL 3

Gene MRE11, Length 619 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRE11-206	ENST00000536144	LYPD8	Q6UX82	237 aa		10.44	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	RGS22	Q8NE09	1264 aa		10.44	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	BRF1	Q92994	677 aa		10.44	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		10.44	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	RNF146	Q9NTX7	359 aa		10.44	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		10.44	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	PFAS	O15067	1338 aa		10.43	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	PARP14	Q460N5	1801 aa		10.43	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		10.43	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		10.43	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		10.43	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	ELN	P15502	786 aa		10.43	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	UBXN2A	P68543	259 aa		10.43	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	TRIM32	Q13049	653 aa		10.43	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	LAPTM4A	Q15012	233 aa		10.43	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		10.43	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		10.43	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	MICU3	Q86XE3	530 aa		10.43	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	FBXO11	Q86XK2	927 aa		10.43	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		10.43	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		10.43	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		10.43	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		10.43	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	TRIB2	Q92519	343 aa		10.43	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	DDX11	Q96FC9	970 aa		10.43	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	AMN	Q9BXJ7	453 aa		10.43	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		10.43	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		10.43	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	ABCB11	O95342	1321 aa		10.42	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	TNFRSF10A	O00220	468 aa		10.42	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	INHA	P05111	366 aa		10.42	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	PGK2	P07205	417 aa		10.42	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	RXRA	P19793	462 aa		10.42	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	RBM25	P49756	843 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	APOBR	Q0VD83	1088 aa		10.42	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	KCNH2	Q12809	1159 aa		10.42	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	CCL14	Q16627	93 aa		10.42	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	RTN1	Q16799	776 aa		10.42	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		10.42	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		10.42	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		10.42	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	MAMDC4	Q6UXC1	1216 aa		10.42	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		10.42	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		10.42	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		10.42	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	MAML3	Q96JK9	1138 aa		10.42	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	PIGS	Q96S52	555 aa		10.42	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	A1CF	Q9NQ94	594 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		10.42	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	NID2	Q14112	1375 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	RPTOR	Q8N122	1335 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	NFIB	O00712	420 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	PPP1R11	O60927	126 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	CAPN2	P17655	700 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	10.41	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	ANKRD1	Q15327	319 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	CCDC144CP	Q8IYA2	1237 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	TINF2	Q9BSI4	451 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		10.41	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	MGAM	O43451	1857 aa		10.4	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		10.4	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	CCL5	P13501	91 aa		10.4	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	CDC27	P30260	824 aa		10.4	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	NEK4	P51957	841 aa		10.4	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	GHRHR	Q02643	423 aa		10.4	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	MTFR1	Q15390	333 aa		10.4	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	USH1G	Q495M9	461 aa		10.4	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	NSMF	Q6X4W1	530 aa		10.4	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144		Q6ZNB5	142 aa		10.4	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		10.4	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	HOMER1	Q86YM7	354 aa		10.4	□□□□□ -0.74
MRE11-206	ENST00000536144	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		10.4	□□□□□ -0.74

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