RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531461.5

ACER3-211, Transcript of alkaline ceramidase 3, humanhuman

TSL 2

Gene ACER3, Length 1,292 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3-211ENST00000531461 MAD2L2Q9UI95 211 aa27.95■■■□□ 2.06
ACER3-211ENST00000531461 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
ACER3-211ENST00000531461 ZBTB5O15062 677 aa27.94■■■□□ 2.06
ACER3-211ENST00000531461 NR3C2P08235 984 aa27.94■■■□□ 2.06
ACER3-211ENST00000531461 CASTP20810 708 aaKnown RBP27.94■■■□□ 2.06
ACER3-211ENST00000531461 PDE4AP27815 886 aa27.94■■■□□ 2.06
ACER3-211ENST00000531461 RABGGTBP53611 331 aa27.94■■■□□ 2.06
ACER3-211ENST00000531461 CYB5R4Q7L1T6 521 aa27.94■■■□□ 2.06
ACER3-211ENST00000531461 DEFB128Q7Z7B8 93 aa27.94■■■□□ 2.06
ACER3-211ENST00000531461 CAGE1Q8TC20 777 aa27.94■■■□□ 2.06
ACER3-211ENST00000531461 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa27.94■■■□□ 2.06
ACER3-211ENST00000531461 KAT2BQ92831 832 aa27.94■■■□□ 2.06
ACER3-211ENST00000531461 CFBP00751 764 aa27.93■■■□□ 2.06
ACER3-211ENST00000531461 TRDNQ13061 729 aa27.93■■■□□ 2.06
ACER3-211ENST00000531461 DGKDQ16760 1214 aa27.93■■■□□ 2.06
ACER3-211ENST00000531461 PPP2R2DQ66LE6 453 aa27.93■■■□□ 2.06
ACER3-211ENST00000531461 STOX1Q6ZVD7 989 aa27.93■■■□□ 2.06
ACER3-211ENST00000531461 CTAGE1Q96RT6 745 aa27.93■■■□□ 2.06
ACER3-211ENST00000531461 SLC9A7Q96T83 725 aa27.93■■■□□ 2.06
ACER3-211ENST00000531461 NOD1Q9Y239 953 aa27.93■■■□□ 2.06
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ACER3-211ENST00000531461 RBL2Q08999 1139 aa27.92■■■□□ 2.06
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ACER3-211ENST00000531461 PTGISQ16647 500 aa27.92■■■□□ 2.06
ACER3-211ENST00000531461 CCDC155Q8N6L0 562 aa27.92■■■□□ 2.06
ACER3-211ENST00000531461 AFAP1L1Q8TED9 768 aa27.92■■■□□ 2.06
ACER3-211ENST00000531461 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
ACER3-211ENST00000531461 RUFY2Q8WXA3 655 aa27.92■■■□□ 2.06
ACER3-211ENST00000531461 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
ACER3-211ENST00000531461 TRANK1O15050 2925 aa27.91■■■□□ 2.06
ACER3-211ENST00000531461 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP27.91■■■□□ 2.06
ACER3-211ENST00000531461 LAMC2Q13753 1193 aa27.91■■■□□ 2.06
ACER3-211ENST00000531461 PPTC7Q8NI37 304 aa27.91■■■□□ 2.06
ACER3-211ENST00000531461 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa27.91■■■□□ 2.06
ACER3-211ENST00000531461 PDCD2LQ9BRP1 358 aa27.91■■■□□ 2.06
ACER3-211ENST00000531461 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa27.91■■■□□ 2.06
ACER3-211ENST00000531461 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
ACER3-211ENST00000531461 BAIAP3O94812 1187 aa27.9■■■□□ 2.06
ACER3-211ENST00000531461 PARNO95453 639 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
ACER3-211ENST00000531461 CYP21A2P08686 494 aa27.9■■■□□ 2.06
ACER3-211ENST00000531461 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
ACER3-211ENST00000531461 MYOGP15173 224 aa27.9■■■□□ 2.06
ACER3-211ENST00000531461 TMEM67Q5HYA8 995 aa27.9■■■□□ 2.06
ACER3-211ENST00000531461 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
ACER3-211ENST00000531461 KCNV1Q6PIU1 500 aa27.9■■■□□ 2.06
ACER3-211ENST00000531461 KATNAL1Q9BW62 490 aa27.9■■■□□ 2.06
ACER3-211ENST00000531461 RIOX1Q9H6W3 641 aa27.9■■■□□ 2.06
ACER3-211ENST00000531461 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa27.9■■■□□ 2.06
ACER3-211ENST00000531461 MRVI1Q9Y6F6 885 aa27.9■■■□□ 2.06
ACER3-211ENST00000531461 GRM4Q14833 912 aa27.89■■■□□ 2.06
ACER3-211ENST00000531461 CHST3Q7LGC8 479 aa27.89■■■□□ 2.06
ACER3-211ENST00000531461 RGS20O76081 388 aa27.88■■■□□ 2.05
ACER3-211ENST00000531461 F2P00734 622 aa27.88■■■□□ 2.05
ACER3-211ENST00000531461 IGFBP4P22692 258 aa27.88■■■□□ 2.05
ACER3-211ENST00000531461 CHMLP26374 656 aa27.88■■■□□ 2.05
ACER3-211ENST00000531461 VSIG10LQ86VR7 867 aa27.88■■■□□ 2.05
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ACER3-211ENST00000531461 THEGQ9P2T0 379 aa27.88■■■□□ 2.05
ACER3-211ENST00000531461 HAS3O00219 553 aa27.87■■■□□ 2.05
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ACER3-211ENST00000531461 SLC35G1Q2M3R5 365 aa27.87■■■□□ 2.05
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ACER3-211ENST00000531461 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP27.87■■■□□ 2.05
ACER3-211ENST00000531461 REV3LO60673 3130 aa27.87■■■□□ 2.05
ACER3-211ENST00000531461 ERICH2A1L162 156 aa27.86■■■□□ 2.05
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ACER3-211ENST00000531461 TGFB3P10600 412 aa27.86■■■□□ 2.05
ACER3-211ENST00000531461 SELPP16109 830 aa27.86■■■□□ 2.05
ACER3-211ENST00000531461 TROAPQ12815 778 aa27.86■■■□□ 2.05
ACER3-211ENST00000531461 PGM5Q15124 567 aa27.86■■■□□ 2.05
ACER3-211ENST00000531461 MYSM1Q5VVJ2 828 aa27.86■■■□□ 2.05
ACER3-211ENST00000531461 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
ACER3-211ENST00000531461 PTPRSQ13332 1948 aa27.86■■■□□ 2.05
ACER3-211ENST00000531461 PPFIA4O75335 1185 aa27.85■■■□□ 2.05
ACER3-211ENST00000531461 CA3P07451 260 aa27.85■■■□□ 2.05
ACER3-211ENST00000531461 PSEN2P49810 448 aa27.85■■■□□ 2.05
ACER3-211ENST00000531461 CHMP4BP1P59074 171 aa27.85■■■□□ 2.05
ACER3-211ENST00000531461 GPNMBQ14956 572 aa27.85■■■□□ 2.05
ACER3-211ENST00000531461 SART3Q15020 963 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
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ACER3-211ENST00000531461 C7orf31Q8N865 590 aa27.85■■■□□ 2.05
ACER3-211ENST00000531461 NCOA7Q8NI08 942 aa27.85■■■□□ 2.05
ACER3-211ENST00000531461 HDAC6Q9UBN7 1215 aa27.85■■■□□ 2.05
ACER3-211ENST00000531461 SGSM2O43147 1006 aa27.84■■■□□ 2.05
ACER3-211ENST00000531461 CYTH3O43739 400 aa27.84■■■□□ 2.05
ACER3-211ENST00000531461 CXCL10P02778 98 aa27.84■■■□□ 2.05
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ACER3-211ENST00000531461 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
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ACER3-211ENST00000531461 PIGSQ96S52 555 aa27.84■■■□□ 2.05
ACER3-211ENST00000531461 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
ACER3-211ENST00000531461 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa27.83■■■□□ 2.05
ACER3-211ENST00000531461 KIF28PB7ZC32 967 aa27.83■■■□□ 2.05
ACER3-211ENST00000531461 E7EWF7 191 aa27.83■■■□□ 2.05
ACER3-211ENST00000531461 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
ACER3-211ENST00000531461 POLR2MP0CAP2 368 aa27.83■■■□□ 2.05
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