RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 MYO1CO00159 1063 aa30.04■■■□□ 2.4
SH3BP2-221ENST00000511747 PDIA5Q14554 519 aa30.04■■■□□ 2.4
SH3BP2-221ENST00000511747 FOXR1Q6PIV2 292 aa30.04■■■□□ 2.4
SH3BP2-221ENST00000511747 AFAP1L1Q8TED9 768 aa30.04■■■□□ 2.4
SH3BP2-221ENST00000511747 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
SH3BP2-221ENST00000511747 PDHBP11177 359 aa30.03■■■□□ 2.4
SH3BP2-221ENST00000511747 NOVP48745 357 aa30.03■■■□□ 2.4
SH3BP2-221ENST00000511747 SRLQ86TD4 932 aa30.03■■■□□ 2.4
SH3BP2-221ENST00000511747 GPIHBP1Q8IV16 184 aa30.03■■■□□ 2.4
SH3BP2-221ENST00000511747 HDAC7Q8WUI4 952 aa30.03■■■□□ 2.4
SH3BP2-221ENST00000511747 RAD54LQ92698 747 aa30.03■■■□□ 2.4
SH3BP2-221ENST00000511747 DDX12PQ92771 950 aa30.03■■■□□ 2.4
SH3BP2-221ENST00000511747 RAB34Q9BZG1 259 aa30.03■■■□□ 2.4
SH3BP2-221ENST00000511747 CD209Q9NNX6 404 aa30.03■■■□□ 2.4
SH3BP2-221ENST00000511747 ITIH3Q06033 890 aa30.03■■■□□ 2.4
SH3BP2-221ENST00000511747 LRRC55Q6ZSA7 311 aa30.03■■■□□ 2.4
SH3BP2-221ENST00000511747 SPATA4Q8NEY3 305 aa30.03■■■□□ 2.4
SH3BP2-221ENST00000511747 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
SH3BP2-221ENST00000511747 AGPSO00116 658 aa30.02■■■□□ 2.4
SH3BP2-221ENST00000511747 LRRC31Q6UY01 552 aa30.02■■■□□ 2.4
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
SH3BP2-221ENST00000511747 GLIS3Q8NEA6 775 aa30.02■■■□□ 2.4
SH3BP2-221ENST00000511747 BAP1Q92560 729 aa30.02■■■□□ 2.4
SH3BP2-221ENST00000511747 OSBPL9Q96SU4 736 aa30.02■■■□□ 2.4
SH3BP2-221ENST00000511747 LRRC1Q9BTT6 524 aa30.02■■■□□ 2.4
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM184BQ9ULE4 1060 aa30.02■■■□□ 2.4
SH3BP2-221ENST00000511747 RHBDL3P58872 404 aa30.01■■■□□ 2.4
SH3BP2-221ENST00000511747 ATP2B2Q01814 1243 aa30.01■■■□□ 2.4
SH3BP2-221ENST00000511747 LRRC41Q15345 812 aa30.01■■■□□ 2.4
SH3BP2-221ENST00000511747 KRT79Q5XKE5 535 aa30.01■■■□□ 2.4
SH3BP2-221ENST00000511747 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.4
SH3BP2-221ENST00000511747 KCNK18Q7Z418 384 aa30.01■■■□□ 2.4
SH3BP2-221ENST00000511747 SNX29Q8TEQ0 813 aa30.01■■■□□ 2.4
SH3BP2-221ENST00000511747 NAV1Q8NEY1 1877 aa30.01■■■□□ 2.4
SH3BP2-221ENST00000511747 hCG_1984214I3L0E3 225 aa30.01■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 PLCG2P16885 1265 aa30.01■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 ADCY7P51828 1080 aa30.01■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 NFRKBQ6P4R8 1299 aa30.01■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 ALS2CR12Q96Q35 445 aa30.01■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 RRP15Q9Y3B9 282 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 COL24A1Q17RW2 1714 aa30.01■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 CXCR5P32302 372 aa30■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 MAGEA1P43355 309 aa30■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 PSMB7Q99436 277 aa30■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 GPSM2P81274 684 aa30■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 EHHADHQ08426 723 aa30■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 CCDC155Q8N6L0 562 aa30■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 SALL4Q9UJQ4 1053 aa30■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 TCP1P17987 556 aaKnown RBP29.99■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 PSMD2Q13200 908 aa29.99■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa29.99■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa29.99■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 RIC8AQ9NPQ8 531 aa29.99■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 TRIM66O15016 1216 aa29.99■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP29.99■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC20A2Q08357 652 aa29.98■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 TANGO6Q9C0B7 1094 aa29.98■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 LRRC27Q9C0I9 530 aa29.98■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 MTMR4Q9NYA4 1195 aa29.98■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 HYOU1Q9Y4L1 999 aa29.98■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 GOLGA6BA6NDN3 693 aa29.98■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 PJA2O43164 708 aa29.98■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 TSG101Q99816 390 aa29.98■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 UFL1O94874 794 aa29.97■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 KCNMA1Q12791 1236 aa29.97■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 ECM1Q16610 540 aa29.97■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 MFSD14BQ5SR56 506 aa29.97■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 C10orf67Q8IYJ2 551 aa29.97■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 MYH10P35580 1976 aa29.97■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 RFC4P35249 363 aa29.97■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 RASSF7Q02833 373 aa29.97■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 PDXDC1Q6P996 788 aa29.97■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 UBAP1LF5GYI3 381 aa29.96■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 IL1R1P14778 569 aa29.96■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 TNNI2P48788 182 aa29.96■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM119Q4V9L6 283 aa29.96■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 CCDC181Q5TID7 509 aa29.96■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 HGSNATQ68CP4 663 aa29.96■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 MYOCDQ8IZQ8 938 aa29.96■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 CNBD1Q8NA66 436 aa29.96■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 EDEM3Q9BZQ6 932 aa29.96■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa29.96■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 SLC7A5Q01650 507 aa29.96■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 ASPRV1Q53RT3 343 aa29.96■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 PROM2Q8N271 834 aa29.96■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 NCK2O43639 380 aa29.95■■■□□ 2.39
SH3BP2-221ENST00000511747 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.3 ms