RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511412.1

ALYREF-203, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 3

Gene ALYREF, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-203ENST00000511412 CHMP4BP1P59074 171 aa28.62■■■□□ 2.17
ALYREF-203ENST00000511412 TROAPQ12815 778 aa28.62■■■□□ 2.17
ALYREF-203ENST00000511412 SLC35G1Q2M3R5 365 aa28.62■■■□□ 2.17
ALYREF-203ENST00000511412 TMEM67Q5HYA8 995 aa28.62■■■□□ 2.17
ALYREF-203ENST00000511412 PDCD2LQ9BRP1 358 aa28.62■■■□□ 2.17
ALYREF-203ENST00000511412 MSRAQ9UJ68 235 aa28.62■■■□□ 2.17
ALYREF-203ENST00000511412 NOD1Q9Y239 953 aa28.62■■■□□ 2.17
ALYREF-203ENST00000511412 SCN5AQ14524 2016 aa28.61■■■□□ 2.17
ALYREF-203ENST00000511412 CATIPQ7Z7H3 387 aa28.61■■■□□ 2.17
ALYREF-203ENST00000511412 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
ALYREF-203ENST00000511412 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
ALYREF-203ENST00000511412 PITPNM1O00562 1244 aa28.6■■■□□ 2.17
ALYREF-203ENST00000511412 CASTP20810 708 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
ALYREF-203ENST00000511412 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
ALYREF-203ENST00000511412 ANTXR2P58335 489 aa28.6■■■□□ 2.17
ALYREF-203ENST00000511412 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
ALYREF-203ENST00000511412 ZBBXA8MT70 800 aa28.59■■■□□ 2.17
ALYREF-203ENST00000511412 CYTH3O43739 400 aa28.59■■■□□ 2.17
ALYREF-203ENST00000511412 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP28.59■■■□□ 2.17
ALYREF-203ENST00000511412 RFC2P35250 354 aa28.59■■■□□ 2.17
ALYREF-203ENST00000511412 DGKDQ16760 1214 aa28.59■■■□□ 2.17
ALYREF-203ENST00000511412 DEFB128Q7Z7B8 93 aa28.59■■■□□ 2.17
ALYREF-203ENST00000511412 VWCEQ96DN2 955 aa28.59■■■□□ 2.17
ALYREF-203ENST00000511412 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa28.59■■■□□ 2.17
ALYREF-203ENST00000511412 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa28.58■■■□□ 2.17
ALYREF-203ENST00000511412 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
ALYREF-203ENST00000511412 POLR2MP0CAP2 368 aa28.58■■■□□ 2.17
ALYREF-203ENST00000511412 BFSP2Q13515 415 aa28.58■■■□□ 2.17
ALYREF-203ENST00000511412 PGM5Q15124 567 aa28.58■■■□□ 2.17
ALYREF-203ENST00000511412 RETREG2Q8NC44 543 aa28.58■■■□□ 2.17
ALYREF-203ENST00000511412 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa28.58■■■□□ 2.17
ALYREF-203ENST00000511412 LAMC2Q13753 1193 aa28.57■■■□□ 2.16
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ALYREF-203ENST00000511412 SESTD1Q86VW0 696 aa28.57■■■□□ 2.16
ALYREF-203ENST00000511412 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
ALYREF-203ENST00000511412 PPTC7Q8NI37 304 aa28.57■■■□□ 2.16
ALYREF-203ENST00000511412 KAT2BQ92831 832 aa28.57■■■□□ 2.16
ALYREF-203ENST00000511412 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
ALYREF-203ENST00000511412 A0A0C4DFX4 3053 aa28.56■■■□□ 2.16
ALYREF-203ENST00000511412 MYH7BA7E2Y1 1941 aa28.56■■■□□ 2.16
ALYREF-203ENST00000511412 KCNV1Q6PIU1 500 aa28.56■■■□□ 2.16
ALYREF-203ENST00000511412 CASC1Q6TDU7 716 aa28.56■■■□□ 2.16
ALYREF-203ENST00000511412 CCDC155Q8N6L0 562 aa28.56■■■□□ 2.16
ALYREF-203ENST00000511412 IL31RAQ8NI17 732 aa28.56■■■□□ 2.16
ALYREF-203ENST00000511412 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
ALYREF-203ENST00000511412 KATNAL1Q9BW62 490 aa28.56■■■□□ 2.16
ALYREF-203ENST00000511412 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa28.56■■■□□ 2.16
ALYREF-203ENST00000511412 LY9Q9HBG7 655 aa28.56■■■□□ 2.16
ALYREF-203ENST00000511412 RGS20O76081 388 aa28.55■■■□□ 2.16
ALYREF-203ENST00000511412 DDAH1O94760 285 aa28.55■■■□□ 2.16
ALYREF-203ENST00000511412 IQCF3P0C7M6 154 aa28.55■■■□□ 2.16
ALYREF-203ENST00000511412 ACTN1P12814 892 aa28.55■■■□□ 2.16
ALYREF-203ENST00000511412 CCND2P30279 289 aa28.55■■■□□ 2.16
ALYREF-203ENST00000511412 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
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ALYREF-203ENST00000511412 FCHSD1Q86WN1 690 aa28.55■■■□□ 2.16
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF654Q8IZM8 581 aa28.55■■■□□ 2.16
ALYREF-203ENST00000511412 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
ALYREF-203ENST00000511412 MTA3Q9BTC8 594 aa28.55■■■□□ 2.16
ALYREF-203ENST00000511412 SLC28A3Q9HAS3 691 aa28.55■■■□□ 2.16
ALYREF-203ENST00000511412 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
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ALYREF-203ENST00000511412 MAP3K14Q99558 947 aa28.54■■■□□ 2.16
ALYREF-203ENST00000511412 MYL10Q9BUA6 226 aa28.54■■■□□ 2.16
ALYREF-203ENST00000511412 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
ALYREF-203ENST00000511412 PRDM12Q9H4Q4 367 aa28.54■■■□□ 2.16
ALYREF-203ENST00000511412 PRC1O43663 620 aa28.53■■■□□ 2.16
ALYREF-203ENST00000511412 F2P00734 622 aa28.53■■■□□ 2.16
ALYREF-203ENST00000511412 ZNF286BP0CG31 522 aa28.53■■■□□ 2.16
ALYREF-203ENST00000511412 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
ALYREF-203ENST00000511412 KIF5BP33176 963 aa28.53■■■□□ 2.16
ALYREF-203ENST00000511412 PSEN2P49810 448 aa28.53■■■□□ 2.16
ALYREF-203ENST00000511412 RABGGTBP53611 331 aa28.53■■■□□ 2.16
ALYREF-203ENST00000511412 C7orf31Q8N865 590 aa28.53■■■□□ 2.16
ALYREF-203ENST00000511412 PIBF1Q8WXW3 757 aa28.53■■■□□ 2.16
ALYREF-203ENST00000511412 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa28.53■■■□□ 2.16
ALYREF-203ENST00000511412 SPZ1Q9BXG8 430 aa28.53■■■□□ 2.16
ALYREF-203ENST00000511412 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
ALYREF-203ENST00000511412 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa28.53■■■□□ 2.16
ALYREF-203ENST00000511412 GGPS1O95749 300 aa28.52■■■□□ 2.16
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ALYREF-203ENST00000511412 AFAP1L1Q8TED9 768 aa28.52■■■□□ 2.16
ALYREF-203ENST00000511412 CTAGE1Q96RT6 745 aa28.52■■■□□ 2.16
ALYREF-203ENST00000511412 ALG1Q9BT22 464 aa28.52■■■□□ 2.16
ALYREF-203ENST00000511412 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP28.52■■■□□ 2.16
ALYREF-203ENST00000511412 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa28.52■■■□□ 2.16
ALYREF-203ENST00000511412 FRMPD4Q14CM0 1322 aa28.51■■■□□ 2.15
ALYREF-203ENST00000511412 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
ALYREF-203ENST00000511412 MCM5P33992 734 aa28.51■■■□□ 2.15
ALYREF-203ENST00000511412 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
ALYREF-203ENST00000511412 MYSM1Q5VVJ2 828 aa28.51■■■□□ 2.15
ALYREF-203ENST00000511412 NFXL1Q6ZNB6 911 aa28.51■■■□□ 2.15
ALYREF-203ENST00000511412 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
ALYREF-203ENST00000511412 TMEM87BQ96K49 555 aa28.51■■■□□ 2.15
ALYREF-203ENST00000511412 SPATA33Q96N06 139 aa28.51■■■□□ 2.15
ALYREF-203ENST00000511412 HDAC6Q9UBN7 1215 aa28.51■■■□□ 2.15
ALYREF-203ENST00000511412 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP28.5■■■□□ 2.15
ALYREF-203ENST00000511412 SLC27A2O14975 620 aa28.5■■■□□ 2.15
ALYREF-203ENST00000511412 SORBS3O60504 671 aa28.5■■■□□ 2.15
ALYREF-203ENST00000511412 TGFB3P10600 412 aa28.5■■■□□ 2.15
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