RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489601.1

SH3BP4-210, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 638 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-210ENST00000489601 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 NOD1Q9Y239 953 aa19.32■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 KLRF2D3W0D1 207 aa19.31■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 NR3C2P08235 984 aa19.31■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 MYOGP15173 224 aa19.31■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 IGFBP4P22692 258 aa19.31■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 HSD17B4P51659 736 aa19.31■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 PTGISQ16647 500 aa19.31■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 PPP2R2DQ66LE6 453 aa19.31■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 SAMD3Q8N6K7 520 aa19.31■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 CAGE1Q8TC20 777 aa19.31■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa19.31■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP19.31■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 KAT2BQ92831 832 aa19.31■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 MAD2L2Q9UI95 211 aa19.31■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP19.3■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 OPLAHO14841 1288 aa19.3■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 CFBP00751 764 aa19.3■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP19.3■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 DGKDQ16760 1214 aa19.3■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 TMEM67Q5HYA8 995 aa19.3■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 CYB5R4Q7L1T6 521 aa19.3■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 CTAGE1Q96RT6 745 aa19.3■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 SLC9A7Q96T83 725 aa19.3■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 NCOR1O75376 2440 aa19.29■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 ZBTB5O15062 677 aa19.29■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP19.29■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 PDE4AP27815 886 aa19.29■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 LAMC2Q13753 1193 aa19.29■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 TTC22Q5TAA0 569 aa19.29■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP19.29■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 CHST3Q7LGC8 479 aa19.29■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 CCDC155Q8N6L0 562 aa19.29■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 AFAP1L1Q8TED9 768 aa19.29■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP19.29■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 THEGQ9P2T0 379 aa19.29■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 PTPRSQ13332 1948 aa19.28■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP19.28■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 CHMP4BP1P59074 171 aa19.28■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 TRDNQ13061 729 aa19.28■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 STOX1Q6ZVD7 989 aa19.28■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 PDCD2LQ9BRP1 358 aa19.28■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 MRVI1Q9Y6F6 885 aa19.28■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 BAIAP3O94812 1187 aa19.27■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 PARNO95453 639 aaKnown RBP19.27■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 CYP21A2P08686 494 aa19.27■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 RBL2Q08999 1139 aa19.27■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 TRAF1Q13077 416 aa19.27■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 KCNV1Q6PIU1 500 aa19.27■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 PPTC7Q8NI37 304 aa19.27■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 RUFY2Q8WXA3 655 aa19.27■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 KATNAL1Q9BW62 490 aa19.27■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 RIOX1Q9H6W3 641 aa19.27■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa19.27■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa19.27■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP19.27■□□□□ 0.68
SH3BP4-210ENST00000489601 HAS3O00219 553 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP4-210ENST00000489601 RGS20O76081 388 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP4-210ENST00000489601 CA3P07451 260 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP4-210ENST00000489601 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
SH3BP4-210ENST00000489601 SELPP16109 830 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP4-210ENST00000489601 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP19.26■□□□□ 0.67
SH3BP4-210ENST00000489601 PSEN2P49810 448 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP4-210ENST00000489601 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
SH3BP4-210ENST00000489601 GRM4Q14833 912 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP4-210ENST00000489601 VSIG10LQ86VR7 867 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP4-210ENST00000489601 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP19.26■□□□□ 0.67
SH3BP4-210ENST00000489601 ASB2Q96Q27 587 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP4-210ENST00000489601 HDAC6Q9UBN7 1215 aa19.26■□□□□ 0.67
SH3BP4-210ENST00000489601 KIF28PB7ZC32 967 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP4-210ENST00000489601 PPFIA4O75335 1185 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP4-210ENST00000489601 F2P00734 622 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP4-210ENST00000489601 TGFB3P10600 412 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP4-210ENST00000489601 CHMLP26374 656 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP4-210ENST00000489601 PTH1RQ03431 593 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP4-210ENST00000489601 GPNMBQ14956 572 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP4-210ENST00000489601 PGM5Q15124 567 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP4-210ENST00000489601 SLC35G1Q2M3R5 365 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP4-210ENST00000489601 MYSM1Q5VVJ2 828 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP4-210ENST00000489601 LRRC8DQ7L1W4 858 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP4-210ENST00000489601 HERC6Q8IVU3 1022 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP4-210ENST00000489601 C7orf31Q8N865 590 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP4-210ENST00000489601 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP19.25■□□□□ 0.67
SH3BP4-210ENST00000489601 TRANK1O15050 2925 aa19.25■□□□□ 0.67
SH3BP4-210ENST00000489601 ERICH2A1L162 156 aa19.24■□□□□ 0.67
SH3BP4-210ENST00000489601 TNFRSF10AO00220 468 aa19.24■□□□□ 0.67
SH3BP4-210ENST00000489601 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
SH3BP4-210ENST00000489601 CXCL10P02778 98 aa19.24■□□□□ 0.67
SH3BP4-210ENST00000489601 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
SH3BP4-210ENST00000489601 MFSD10Q14728 455 aa19.24■□□□□ 0.67
SH3BP4-210ENST00000489601 KIAA0753Q2KHM9 967 aa19.24■□□□□ 0.67
SH3BP4-210ENST00000489601 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP19.24■□□□□ 0.67
SH3BP4-210ENST00000489601 PIGSQ96S52 555 aa19.24■□□□□ 0.67
SH3BP4-210ENST00000489601 ALG1Q9BT22 464 aa19.24■□□□□ 0.67
SH3BP4-210ENST00000489601 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP19.24■□□□□ 0.67
SH3BP4-210ENST00000489601 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP19.23■□□□□ 0.67
SH3BP4-210ENST00000489601 CYTH3O43739 400 aa19.23■□□□□ 0.67
SH3BP4-210ENST00000489601 POLR2MP0CAP2 368 aa19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms