RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488684.5

POLR2F-211, Transcript of RNA polymerase II subunit F, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene POLR2F, Length 564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2F-211ENST00000488684 CYP21A2P08686 494 aa26.08■■□□□ 1.77
POLR2F-211ENST00000488684 IQCF3P0C7M6 154 aa26.08■■□□□ 1.77
POLR2F-211ENST00000488684 HSD17B4P51659 736 aa26.08■■□□□ 1.77
POLR2F-211ENST00000488684 SENP2Q9HC62 589 aa26.08■■□□□ 1.77
POLR2F-211ENST00000488684 TAF6LQ9Y6J9 622 aa26.08■■□□□ 1.77
POLR2F-211ENST00000488684 TRANK1O15050 2925 aa26.08■■□□□ 1.77
POLR2F-211ENST00000488684 PITPNM1O00562 1244 aa26.07■■□□□ 1.76
POLR2F-211ENST00000488684 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
POLR2F-211ENST00000488684 CHMLP26374 656 aa26.07■■□□□ 1.76
POLR2F-211ENST00000488684 GHRHRQ02643 423 aa26.07■■□□□ 1.76
POLR2F-211ENST00000488684 PPM1EQ8WY54 764 aa26.07■■□□□ 1.76
POLR2F-211ENST00000488684 CTAGE1Q96RT6 745 aa26.07■■□□□ 1.76
POLR2F-211ENST00000488684 REV3LO60673 3130 aa26.07■■□□□ 1.76
POLR2F-211ENST00000488684 ZBTB5O15062 677 aa26.06■■□□□ 1.76
POLR2F-211ENST00000488684 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
POLR2F-211ENST00000488684 RETREG2Q8NC44 543 aa26.06■■□□□ 1.76
POLR2F-211ENST00000488684 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa26.06■■□□□ 1.76
POLR2F-211ENST00000488684 MUC3AQ02505 3323 aa26.05■■□□□ 1.76
POLR2F-211ENST00000488684 RFC2P35250 354 aa26.05■■□□□ 1.76
POLR2F-211ENST00000488684 TRDNQ13061 729 aa26.05■■□□□ 1.76
POLR2F-211ENST00000488684 PTGISQ16647 500 aa26.05■■□□□ 1.76
POLR2F-211ENST00000488684 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP26.05■■□□□ 1.76
POLR2F-211ENST00000488684 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa26.05■■□□□ 1.76
POLR2F-211ENST00000488684 MYH7BA7E2Y1 1941 aa26.05■■□□□ 1.76
POLR2F-211ENST00000488684 RGS20O76081 388 aa26.04■■□□□ 1.76
POLR2F-211ENST00000488684 CASTP20810 708 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
POLR2F-211ENST00000488684 BFSP2Q13515 415 aa26.04■■□□□ 1.76
POLR2F-211ENST00000488684 GRM4Q14833 912 aa26.04■■□□□ 1.76
POLR2F-211ENST00000488684 STOX1Q6ZVD7 989 aa26.04■■□□□ 1.76
POLR2F-211ENST00000488684 SESTD1Q86VW0 696 aa26.04■■□□□ 1.76
POLR2F-211ENST00000488684 RUFY2Q8WXA3 655 aa26.04■■□□□ 1.76
POLR2F-211ENST00000488684 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
POLR2F-211ENST00000488684 PDCD2LQ9BRP1 358 aa26.04■■□□□ 1.76
POLR2F-211ENST00000488684 RIOX1Q9H6W3 641 aa26.04■■□□□ 1.76
POLR2F-211ENST00000488684 NOD1Q9Y239 953 aa26.04■■□□□ 1.76
POLR2F-211ENST00000488684 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
POLR2F-211ENST00000488684 TANC1Q9C0D5 1861 aa26.03■■□□□ 1.76
POLR2F-211ENST00000488684 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
POLR2F-211ENST00000488684 IGFBP4P22692 258 aa26.03■■□□□ 1.76
POLR2F-211ENST00000488684 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
POLR2F-211ENST00000488684 DGKDQ16760 1214 aa26.03■■□□□ 1.76
POLR2F-211ENST00000488684 PPP2R2DQ66LE6 453 aa26.03■■□□□ 1.76
POLR2F-211ENST00000488684 HOMER1Q86YM7 354 aa26.03■■□□□ 1.76
POLR2F-211ENST00000488684 PIGSQ96S52 555 aa26.03■■□□□ 1.76
POLR2F-211ENST00000488684 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
POLR2F-211ENST00000488684 MRVI1Q9Y6F6 885 aa26.03■■□□□ 1.76
POLR2F-211ENST00000488684 E7EWF7 191 aa26.02■■□□□ 1.76
POLR2F-211ENST00000488684 CYTH3O43739 400 aa26.02■■□□□ 1.76
POLR2F-211ENST00000488684 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
POLR2F-211ENST00000488684 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
POLR2F-211ENST00000488684 GPNMBQ14956 572 aa26.02■■□□□ 1.76
POLR2F-211ENST00000488684 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
POLR2F-211ENST00000488684 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
POLR2F-211ENST00000488684 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP26.02■■□□□ 1.76
POLR2F-211ENST00000488684 ACTN1P12814 892 aa26.01■■□□□ 1.75
POLR2F-211ENST00000488684 TROAPQ12815 778 aa26.01■■□□□ 1.75
POLR2F-211ENST00000488684 LAMC2Q13753 1193 aa26.01■■□□□ 1.75
POLR2F-211ENST00000488684 VSIG10LQ86VR7 867 aa26.01■■□□□ 1.75
POLR2F-211ENST00000488684 IL31RAQ8NI17 732 aa26.01■■□□□ 1.75
POLR2F-211ENST00000488684 HDAC6Q9UBN7 1215 aa26.01■■□□□ 1.75
POLR2F-211ENST00000488684 SGSM2O43147 1006 aa26■■□□□ 1.75
POLR2F-211ENST00000488684 PSEN2P49810 448 aa26■■□□□ 1.75
POLR2F-211ENST00000488684 PGM5Q15124 567 aa26■■□□□ 1.75
POLR2F-211ENST00000488684 TMEM67Q5HYA8 995 aa26■■□□□ 1.75
POLR2F-211ENST00000488684 TJAP1Q5JTD0 557 aa26■■□□□ 1.75
POLR2F-211ENST00000488684 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
POLR2F-211ENST00000488684 PPTC7Q8NI37 304 aa26■■□□□ 1.75
POLR2F-211ENST00000488684 CAGE1Q8TC20 777 aa26■■□□□ 1.75
POLR2F-211ENST00000488684 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
POLR2F-211ENST00000488684 ALG1Q9BT22 464 aa26■■□□□ 1.75
POLR2F-211ENST00000488684 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa26■■□□□ 1.75
POLR2F-211ENST00000488684 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa25.99■■□□□ 1.75
POLR2F-211ENST00000488684 HAS3O00219 553 aa25.99■■□□□ 1.75
POLR2F-211ENST00000488684 CA3P07451 260 aa25.99■■□□□ 1.75
POLR2F-211ENST00000488684 ANTXR2P58335 489 aa25.99■■□□□ 1.75
POLR2F-211ENST00000488684 SP2Q02086 613 aa25.99■■□□□ 1.75
POLR2F-211ENST00000488684 WTAPQ15007 396 aa25.99■■□□□ 1.75
POLR2F-211ENST00000488684 MYSM1Q5VVJ2 828 aa25.99■■□□□ 1.75
POLR2F-211ENST00000488684 SAMD3Q8N6K7 520 aa25.99■■□□□ 1.75
POLR2F-211ENST00000488684 NCOA7Q8NI08 942 aa25.99■■□□□ 1.75
POLR2F-211ENST00000488684 AFAP1L1Q8TED9 768 aa25.99■■□□□ 1.75
POLR2F-211ENST00000488684 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
POLR2F-211ENST00000488684 NCOR1O75376 2440 aa25.98■■□□□ 1.75
POLR2F-211ENST00000488684 ERICH2A1L162 156 aa25.98■■□□□ 1.75
POLR2F-211ENST00000488684 SORBS3O60504 671 aa25.98■■□□□ 1.75
POLR2F-211ENST00000488684 F2P00734 622 aa25.98■■□□□ 1.75
POLR2F-211ENST00000488684 ZNF286BP0CG31 522 aa25.98■■□□□ 1.75
POLR2F-211ENST00000488684 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
POLR2F-211ENST00000488684 MFSD10Q14728 455 aa25.98■■□□□ 1.75
POLR2F-211ENST00000488684 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
POLR2F-211ENST00000488684 C7orf31Q8N865 590 aa25.98■■□□□ 1.75
POLR2F-211ENST00000488684 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa25.98■■□□□ 1.75
POLR2F-211ENST00000488684 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa25.98■■□□□ 1.75
POLR2F-211ENST00000488684 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP25.98■■□□□ 1.75
POLR2F-211ENST00000488684 SLC9A7Q96T83 725 aa25.98■■□□□ 1.75
POLR2F-211ENST00000488684 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
POLR2F-211ENST00000488684 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa25.97■■□□□ 1.75
POLR2F-211ENST00000488684 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
POLR2F-211ENST00000488684 ARHGEF15O94989 841 aa25.97■■□□□ 1.75
POLR2F-211ENST00000488684 POLR2MP0CAP2 368 aa25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms