RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 CPT1AP50416 773 aa9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 RPS6P62753 249 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 ALX1Q15699 326 aa9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 TCTN1Q2MV58 587 aa9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 RNF207Q6ZRF8 634 aa9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 HERC6Q8IVU3 1022 aa9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 IL27Q8NEV9 243 aa9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 ARNTL2Q8WYA1 636 aa9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 CTAGE1Q96RT6 745 aa9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 CPVLQ9H3G5 476 aa9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 XIRP2A4UGR9 3374 aa9.94□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 SALL3Q9BXA9 1300 aa9.94□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 LCHNA4D1U4 455 aa9.94□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 LPXNO60711 386 aa9.94□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 PFKMP08237 780 aa9.94□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 TXNP10599 105 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 TOP1P11387 765 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 EDNRBP24530 442 aa9.94□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 CHMP4BP1P59074 171 aa9.94□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 PDE4DQ08499 809 aa9.94□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 GRB10Q13322 594 aa9.94□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa9.94□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 NFRKBQ6P4R8 1299 aa9.94□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 RETREG2Q8NC44 543 aa9.94□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa9.94□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 FAM227BQ96M60 508 aa9.94□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 UBA5Q9GZZ9 404 aa9.94□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 TOMM22Q9NS69 142 aa9.94□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa9.94□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa9.93□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 GOLGA8HP0CJ92 632 aa9.93□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 PDHBP11177 359 aa9.93□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 ACTN1P12814 892 aa9.93□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 MX1P20591 662 aa9.93□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 RFC2P35250 354 aa9.93□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 HAND2P61296 217 aa9.93□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF543Q08ER8 600 aa9.93□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 HIC1Q14526 733 aa9.93□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 PPP2R5BQ15173 497 aa9.93□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 LY6KQ17RY6 165 aa9.93□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 TYW1BQ6NUM6 668 aa9.93□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 CCDC62Q6P9F0 684 aa9.93□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 AFG1LQ8WV93 481 aa9.93□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 KAT2BQ92831 832 aa9.93□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 TAAR1Q96RJ0 339 aa9.93□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 LRFN3Q9BTN0 628 aa9.93□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 MYH7P12883 1935 aa9.93□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 MYH4Q9Y623 1939 aa9.93□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 TTC28Q96AY4 2481 aa9.92□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 A0A0D9SFI3 127 aa9.92□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 TRIM66O15016 1216 aa9.92□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP9.92□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 KPNA6O60684 536 aa9.92□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 SNHG28P0DPA3 235 aa9.92□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 PLA2G5P39877 138 aa9.92□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 DEFB103AP81534 67 aa9.92□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 PTGISQ16647 500 aa9.92□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 AAK1Q2M2I8 961 aa9.92□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 SEPT14Q6ZU15 432 aa9.92□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 SCFD2Q8WU76 684 aa9.92□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 FAM122AQ96E09 287 aa9.92□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 SLC9A7Q96T83 725 aa9.92□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa9.92□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 CD320Q9NPF0 282 aa9.92□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 HELLSQ9NRZ9 838 aa9.92□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 COL20A1Q9P218 1284 aa9.92□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 KIF28PB7ZC32 967 aa9.91□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 NBNO60934 754 aa9.91□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 WDR5P61964 334 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 ARHGAP1Q07960 439 aa9.91□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 BFSP2Q13515 415 aa9.91□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 USH1GQ495M9 461 aa9.91□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa9.91□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 ANKRD45Q5TZF3 282 aa9.91□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 CHST3Q7LGC8 479 aa9.91□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 TBC1D10CQ8IV04 446 aa9.91□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 RGS22Q8NE09 1264 aa9.91□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 DNERQ8NFT8 737 aa9.91□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 HLA-CQ95604 372 aa9.91□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 EVI5LQ96CN4 794 aa9.91□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 TTC14Q96N46 770 aa9.91□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa9.91□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 COG5Q9UP83 839 aa9.91□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 WDR19Q8NEZ3 1342 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 MYO9BQ13459 2157 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-208ENST00000479480 MMP3P08254 477 aa9.9□□□□□ -0.82
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