RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462219.5

LINC00879-201, long intergenic non-protein coding RNA 879, humanhuman

TSL 2

Gene LINC00879, Length 695 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00879-201ENST00000462219 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
LINC00879-201ENST00000462219 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
LINC00879-201ENST00000462219 TNFAIP2Q03169 654 aa14.91□□□□□ -0.02
LINC00879-201ENST00000462219 CCDC62Q6P9F0 684 aa14.91□□□□□ -0.02
LINC00879-201ENST00000462219 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
LINC00879-201ENST00000462219 C6orf50Q9HD87 102 aa14.91□□□□□ -0.02
LINC00879-201ENST00000462219 GJB4Q9NTQ9 266 aa14.91□□□□□ -0.02
LINC00879-201ENST00000462219 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
LINC00879-201ENST00000462219 ALPK3Q96L96 1907 aa14.9□□□□□ -0.02
LINC00879-201ENST00000462219 CTAGE5O15320 804 aa14.9□□□□□ -0.02
LINC00879-201ENST00000462219 ARIH2O95376 493 aa14.9□□□□□ -0.02
LINC00879-201ENST00000462219 RARBP10826 455 aa14.9□□□□□ -0.02
LINC00879-201ENST00000462219 NKX3-2P78367 333 aa14.9□□□□□ -0.02
LINC00879-201ENST00000462219 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
LINC00879-201ENST00000462219 ANKLE1Q8NAG6 615 aa14.9□□□□□ -0.02
LINC00879-201ENST00000462219 TMX3Q96JJ7 454 aa14.9□□□□□ -0.02
LINC00879-201ENST00000462219 PGBD1Q96JS3 809 aa14.9□□□□□ -0.02
LINC00879-201ENST00000462219 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
LINC00879-201ENST00000462219 GLT8D2Q9H1C3 349 aa14.9□□□□□ -0.02
LINC00879-201ENST00000462219 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
LINC00879-201ENST00000462219 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
LINC00879-201ENST00000462219 M0R2N6 131 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 PGK1P00558 417 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 FOSP01100 380 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 GNA11P29992 359 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 CCND2P30279 289 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 GJA9P57773 515 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 LRRC41Q15345 812 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 DUSP28Q4G0W2 176 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 PCNX4Q63HM2 1172 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 SEPT14Q6ZU15 432 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 KLHDC9Q8NEP7 349 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 CCDC148Q8NFR7 591 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 SCFD2Q8WU76 684 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 CRYGNQ8WXF5 182 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 PHF20Q9BVI0 1012 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 ANO3Q9BYT9 981 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 WDR11Q9BZH6 1224 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 KCNJ14Q9UNX9 436 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa14.89□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 MYADML2A6NDP7 307 aa14.88□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 SPDYE3A6NKU9 549 aa14.88□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 EDIL3O43854 480 aa14.88□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 COL6A1P12109 1028 aa14.88□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 MCM2P49736 904 aa14.88□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 NLRP5P59047 1200 aa14.88□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 SEMA3FQ13275 785 aa14.88□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 AP3B2Q13367 1082 aa14.88□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 XRRA1Q6P2D8 792 aa14.88□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 DAGLBQ8NCG7 672 aa14.88□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 ARRDC4Q8NCT1 418 aa14.88□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 RASGRP4Q8TDF6 673 aa14.88□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 COPS5Q92905 334 aa14.88□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 ALG1Q9BT22 464 aa14.88□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 RTEL1Q9NZ71 1219 aa14.88□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 PCDHA4Q9UN74 947 aa14.88□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 Q9Y3F1 56 aa14.88□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 DNM1LO00429 736 aa14.87□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 STAM2O75886 525 aa14.87□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 TXNP10599 105 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 ICAM3P32942 547 aa14.87□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 SREBF1P36956 1147 aa14.87□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 LY6KQ17RY6 165 aa14.87□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa14.87□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa14.86□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 ITGB5P18084 799 aa14.86□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 CST5P28325 142 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 SP2Q02086 613 aa14.86□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 TTLL4Q14679 1199 aa14.86□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 MCTP2Q6DN12 878 aa14.86□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 GALNT17Q6IS24 598 aa14.86□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 TLK2Q86UE8 772 aa14.86□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 BLIDQ8IZY5 108 aa14.86□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 BICD2Q8TD16 824 aa14.86□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 WASF1Q92558 559 aa14.86□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 BCAS3Q9H6U6 928 aa14.86□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 CYP3A4P08684 503 aa14.85□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 TGFB3P10600 412 aa14.85□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 ARHGAP4P98171 946 aa14.85□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 BEX3Q00994 111 aa14.85□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 ARHGAP1Q07960 439 aa14.85□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 RNF180Q86T96 592 aa14.85□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 CYP2W1Q8TAV3 490 aa14.85□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 OXER1Q8TDS5 423 aa14.85□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 MRVI1Q9Y6F6 885 aa14.85□□□□□ -0.03
LINC00879-201ENST00000462219 DNAH12Q6ZR08 3092 aa14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms