RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461448.5

SNHG12-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 12, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SNHG12, Length 1,629 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12-201ENST00000461448 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
SNHG12-201ENST00000461448 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
SNHG12-201ENST00000461448 HMGCRP04035 888 aa22.28■■□□□ 1.16
SNHG12-201ENST00000461448 TRIM32Q13049 653 aa22.28■■□□□ 1.16
SNHG12-201ENST00000461448 PKP1Q13835 747 aa22.28■■□□□ 1.16
SNHG12-201ENST00000461448 INF2Q27J81 1249 aa22.28■■□□□ 1.16
SNHG12-201ENST00000461448 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
SNHG12-201ENST00000461448 PCNX4Q63HM2 1172 aa22.28■■□□□ 1.16
SNHG12-201ENST00000461448 FERMT3Q86UX7 667 aa22.28■■□□□ 1.16
SNHG12-201ENST00000461448 CNPY2Q9Y2B0 182 aa22.28■■□□□ 1.16
SNHG12-201ENST00000461448 FAM205CA6NFA0 338 aa22.27■■□□□ 1.16
SNHG12-201ENST00000461448 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa22.27■■□□□ 1.16
SNHG12-201ENST00000461448 SH3TC2Q8TF17 1288 aa22.27■■□□□ 1.16
SNHG12-201ENST00000461448 RTEL1Q9NZ71 1219 aa22.27■■□□□ 1.16
SNHG12-201ENST00000461448 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 IGHA2P01877 340 aa22.26■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 ZNF76P36508 570 aa22.26■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 TRAPPC10P48553 1259 aa22.26■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 RESTQ13127 1097 aa22.26■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.26■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 XRRA1Q6P2D8 792 aa22.26■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 RILPL1Q5EBL4 403 aa22.25■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa22.25■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22.25■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 INHAP05111 366 aa22.24■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 USP11P51784 963 aa22.24■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 ACVR2BQ13705 512 aa22.24■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 CYP3A4P08684 503 aa22.24■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 SEPT14Q6ZU15 432 aa22.24■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 NEK8Q86SG6 692 aa22.24■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 CRYGNQ8WXF5 182 aa22.24■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 VTA1Q9NP79 307 aa22.24■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 STAM2O75886 525 aa22.23■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 ATP2B1P20020 1258 aa22.23■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 LETM2Q2VYF4 491 aa22.23■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 ATL3Q6DD88 541 aa22.23■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 CNGA1P29973 690 aa22.22■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 MYSM1Q5VVJ2 828 aa22.22■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 NLRX1Q86UT6 975 aa22.22■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 MXRA8Q9BRK3 442 aa22.22■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 MCOLN1Q9GZU1 580 aa22.22■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 KATNBL1Q9H079 304 aa22.22■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 PDGFCQ9NRA1 345 aa22.22■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 NRBP1Q9UHY1 535 aa22.22■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa22.22■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 EDIL3O43854 480 aa22.21■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 CYBAP13498 195 aa22.21■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 GNPTABQ3T906 1256 aa22.21■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 CEP55Q53EZ4 464 aa22.21■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 TRPV1Q8NER1 839 aa22.21■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 CYP2W1Q8TAV3 490 aa22.21■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 RGS20O76081 388 aa22.2■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 MYCP01106 439 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 ITGB5P18084 799 aa22.2■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa22.2■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 TAPT1Q6NXT6 567 aa22.2■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 MOXD1Q6UVY6 613 aa22.2■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 WDR11Q9BZH6 1224 aa22.2■■□□□ 1.15
SNHG12-201ENST00000461448 FAM86B1E9PN63 330 aa22.2■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 TDP2O95551 362 aa22.2■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 FAM86B2P0C5J1 330 aa22.2■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 CIITAP33076 1130 aa22.2■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 CCDC144BQ3MJ40 725 aa22.2■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 JADE2Q9NQC1 790 aa22.2■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 CFAP45Q9UL16 551 aa22.2■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 ADCYAP1R1P41586 468 aa22.19■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 PRR16Q569H4 304 aa22.19■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 TTC38Q5R3I4 469 aa22.19■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 PPP4R3AQ6IN85 833 aa22.19■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 PLA2G4DQ86XP0 818 aa22.19■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 SCFD2Q8WU76 684 aa22.19■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 FAM184BQ9ULE4 1060 aa22.19■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 CEP131Q9UPN4 1083 aa22.19■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 MRVI1Q9Y6F6 885 aa22.19■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 MCM3APO60318 1980 aa22.19■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 MEIS1O00470 390 aa22.18■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 MTMR1Q13613 665 aa22.18■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 IQSEC1Q6DN90 963 aa22.18■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 GPRASP2Q96D09 838 aa22.18■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa22.17■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 FIBPO43427 364 aa22.17■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 BMP15O95972 392 aa22.17■■□□□ 1.14
SNHG12-201ENST00000461448 CYP3A7P24462 503 aa22.17■■□□□ 1.14
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