RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439984.7

PCNX1-202, Transcript of pecanex 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PCNX1, Length 6,988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1-202ENST00000439984 ZBED6P86452 979 aa15.94■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 KIFC2Q96AC6 838 aa15.94■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 LRRC1Q9BTT6 524 aa15.94■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 H3BQF6 201 aa15.94■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 DR1Q01658 176 aa15.94■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 C16orf87Q6PH81 154 aa15.94■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 ABCA6Q8N139 1617 aa15.94■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 CLASP1Q7Z460 1538 aa15.94■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 CRYMQ14894 314 aa15.93■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 KRT80Q6KB66 452 aa15.93■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 DCUN1D2Q6PH85 259 aa15.93■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 MYBL1P10243 752 aa15.93■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 WDR44Q5JSH3 913 aa15.93■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 MB21D1Q8N884 522 aa15.93■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 MAML1Q92585 1016 aa15.93■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 OSBPL9Q96SU4 736 aa15.93■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 KAT6BQ8WYB5 2073 aa15.93■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 PRR36Q9H6K5 1346 aa15.93■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 PALMO75781 387 aa15.93■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 FOXR1Q6PIV2 292 aa15.93■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 LZTS1Q9Y250 596 aa15.93■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 KCNQ3O43525 872 aa15.93■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 NSMCE1Q8WV22 266 aa15.93■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 FUT8Q9BYC5 575 aa15.93■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 TMOD2Q9NZR1 351 aa15.93■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 AATKQ6ZMQ8 1374 aa15.93■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 PCYT1AP49585 367 aa15.93■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 NR5A1Q13285 461 aa15.93■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 IQCB1Q15051 598 aa15.93■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 MYCT1Q8N699 235 aa15.93■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 RWDD2AQ9UIY3 292 aa15.93■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 ARAP3Q8WWN8 1544 aa15.93■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 SPAG7O75391 227 aa15.93■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 GNA14O95837 355 aa15.93■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 DRP2Q13474 957 aa15.93■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 RSAD2Q8WXG1 361 aa15.93■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP15.93■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 ZBBXA8MT70 800 aa15.92■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 LSP1P33241 339 aa15.92■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 ADCY2Q08462 1091 aa15.92■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 TTC1Q99614 292 aa15.92■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 ATP7BP35670 1465 aa15.92■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 HARSP12081 509 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 RETREG2Q8NC44 543 aa15.92■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 BPIFA3Q9BQP9 254 aa15.92■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 SPZ1Q9BXG8 430 aa15.92■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 CYP2J2P51589 502 aa15.92■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 KIF2BQ8N4N8 673 aa15.92■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 DNAI2Q9GZS0 605 aa15.92■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 PPARAQ07869 468 aa15.92■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 PBKQ96KB5 322 aa15.92■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 SNX24Q9Y343 169 aa15.92■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 KRT10P13645 584 aa15.92■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 TSPOAP1O95153 1857 aa15.92■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 KRT14P02533 472 aa15.91■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 NECTIN1Q15223 517 aa15.91■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa15.91■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa15.91■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa15.91■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa15.91■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 ATP2A3Q93084 1043 aa15.91■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 PAGE5Q96GU1 130 aa15.91■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 ZNF148Q9UQR1 794 aa15.91■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 ROBO2Q9HCK4 1378 aa15.91■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 F8W031 263 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 EIF6P56537 245 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 LRRC41Q15345 812 aa15.91■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 FAM47AQ5JRC9 791 aa15.91■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 CYB5D1Q6P9G0 228 aa15.91■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 SLF2Q8IX21 1173 aa15.91■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 P2RX5Q93086 422 aa15.91■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 BABAM1Q9NWV8 329 aa15.91■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 ZFP69BQ9UJL9 534 aa15.91■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 DCTN3O75935 186 aa15.91■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 CA4P22748 312 aa15.91■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 CCT6BQ92526 530 aa15.91■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 FAM89AQ96GI7 184 aa15.91■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 SEC16BQ96JE7 1060 aa15.91■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 SMYD3Q9H7B4 428 aa15.91■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa15.91■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 TRIM37O94972 964 aa15.91■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 DTX3LQ8TDB6 740 aa15.91■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 PNKPQ96T60 521 aa15.91■□□□□ 0.14
PCNX1-202ENST00000439984 PDHBP11177 359 aa15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms