RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP14.42□□□□□ -0.1
PRAME-208ENST00000438888 PPP2R2DQ66LE6 453 aa14.42□□□□□ -0.1
PRAME-208ENST00000438888 Q6ZUG5 572 aa14.42□□□□□ -0.1
PRAME-208ENST00000438888 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP14.42□□□□□ -0.1
PRAME-208ENST00000438888 SNX21Q969T3 373 aa14.42□□□□□ -0.1
PRAME-208ENST00000438888 TMEM87BQ96K49 555 aa14.42□□□□□ -0.1
PRAME-208ENST00000438888 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP14.42□□□□□ -0.1
PRAME-208ENST00000438888 UBAC1Q9BSL1 405 aa14.42□□□□□ -0.1
PRAME-208ENST00000438888 MTA3Q9BTC8 594 aa14.42□□□□□ -0.1
PRAME-208ENST00000438888 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa14.42□□□□□ -0.1
PRAME-208ENST00000438888 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP14.41□□□□□ -0.1
PRAME-208ENST00000438888 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP14.41□□□□□ -0.1
PRAME-208ENST00000438888 ARIH2O95376 493 aa14.41□□□□□ -0.1
PRAME-208ENST00000438888 SNHG28P0DPA3 235 aa14.41□□□□□ -0.1
PRAME-208ENST00000438888 TXNP10599 105 aaKnown RBP14.41□□□□□ -0.1
PRAME-208ENST00000438888 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP14.41□□□□□ -0.1
PRAME-208ENST00000438888 MCM2P49736 904 aa14.41□□□□□ -0.1
PRAME-208ENST00000438888 AK2P54819 239 aa14.41□□□□□ -0.1
PRAME-208ENST00000438888 ANKRD1Q15327 319 aa14.41□□□□□ -0.1
PRAME-208ENST00000438888 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP14.41□□□□□ -0.1
PRAME-208ENST00000438888 IQCA1Q86XH1 822 aa14.41□□□□□ -0.1
PRAME-208ENST00000438888 SCFD2Q8WU76 684 aa14.41□□□□□ -0.1
PRAME-208ENST00000438888 VWCEQ96DN2 955 aa14.41□□□□□ -0.1
PRAME-208ENST00000438888 LRRC2Q9BYS8 371 aa14.41□□□□□ -0.1
PRAME-208ENST00000438888 PNMA2Q9UL42 364 aa14.41□□□□□ -0.1
PRAME-208ENST00000438888 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa14.4□□□□□ -0.1
PRAME-208ENST00000438888 ERICH2A1L162 156 aa14.4□□□□□ -0.1
PRAME-208ENST00000438888 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP14.4□□□□□ -0.1
PRAME-208ENST00000438888 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.1
PRAME-208ENST00000438888 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.1
PRAME-208ENST00000438888 EDNRBP24530 442 aa14.4□□□□□ -0.1
PRAME-208ENST00000438888 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.1
PRAME-208ENST00000438888 TMEM67Q5HYA8 995 aa14.4□□□□□ -0.1
PRAME-208ENST00000438888 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP14.4□□□□□ -0.1
PRAME-208ENST00000438888 SEPT14Q6ZU15 432 aa14.4□□□□□ -0.1
PRAME-208ENST00000438888 HSCBQ8IWL3 235 aa14.4□□□□□ -0.1
PRAME-208ENST00000438888 FBXL16Q8N461 479 aa14.4□□□□□ -0.1
PRAME-208ENST00000438888 PNMA1Q8ND90 353 aa14.4□□□□□ -0.1
PRAME-208ENST00000438888 DNERQ8NFT8 737 aa14.4□□□□□ -0.1
PRAME-208ENST00000438888 TBC1D5Q92609 795 aa14.4□□□□□ -0.1
PRAME-208ENST00000438888 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP14.4□□□□□ -0.1
PRAME-208ENST00000438888 KAT14Q9H8E8 782 aa14.4□□□□□ -0.1
PRAME-208ENST00000438888 THEGQ9P2T0 379 aa14.4□□□□□ -0.1
PRAME-208ENST00000438888 NOD1Q9Y239 953 aa14.4□□□□□ -0.1
PRAME-208ENST00000438888 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP14.39□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP14.39□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 BECN1Q14457 450 aa14.39□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 CCDC178Q5BJE1 867 aa14.39□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa14.39□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 BRF1Q92994 677 aa14.39□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 AGXT2Q9BYV1 514 aa14.39□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP14.39□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 CERS4Q9HA82 394 aa14.39□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 VAT1LQ9HCJ6 419 aa14.39□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 MYO9BQ13459 2157 aa14.39□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 B4DLN1 442 aa14.38□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 CA3P07451 260 aa14.38□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP14.38□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 WTAPQ15007 396 aa14.38□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 LY6KQ17RY6 165 aa14.38□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 DGKHQ86XP1 1220 aa14.38□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 ADGRF4Q8IZF3 695 aa14.38□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP14.38□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 RETREG2Q8NC44 543 aa14.38□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 AFG1LQ8WV93 481 aa14.38□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 TAAR1Q96RJ0 339 aa14.38□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 LY9Q9HBG7 655 aa14.38□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 COL20A1Q9P218 1284 aa14.38□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa14.38□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa14.38□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 CHD7Q9P2D1 2997 aa14.38□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 GBF1Q92538 1859 aa14.38□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 A6NJR5 290 aa14.37□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa14.37□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 RFXAPO00287 272 aa14.37□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 PFKMP08237 780 aa14.37□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 MMP3P08254 477 aa14.37□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 ACTN1P12814 892 aa14.37□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 LIFRP42702 1097 aa14.37□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 SEC23AQ15436 765 aa14.37□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 QRICH1Q2TAL8 776 aa14.37□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP14.37□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 NFRKBQ6P4R8 1299 aa14.37□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 NFXL1Q6ZNB6 911 aa14.37□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 TMTC2Q8N394 836 aa14.37□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP14.37□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 ABCB11O95342 1321 aa14.37□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP14.36□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 TNFRSF10AO00220 468 aa14.36□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 KPNA6O60684 536 aa14.36□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 GH1P01241 217 aa14.36□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 IQCF3P0C7M6 154 aa14.36□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 APOBRQ0VD83 1088 aa14.36□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 ASPRV1Q53RT3 343 aa14.36□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 SGMS1Q86VZ5 419 aa14.36□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
PRAME-208ENST00000438888 ASB2Q96Q27 587 aa14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms