RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 MAP4K1Q92918 833 aa24.38■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa24.38■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 WTAPQ15007 396 aa24.37■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 PDCD2LQ9BRP1 358 aa24.37■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 CASTP20810 708 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 BFSP2Q13515 415 aa24.36■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 DGKDQ16760 1214 aa24.36■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 SLC35G1Q2M3R5 365 aa24.36■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 MTA3Q9BTC8 594 aa24.36■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 MRVI1Q9Y6F6 885 aa24.36■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 TAF6LQ9Y6J9 622 aa24.36■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa24.36■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 SCN5AQ14524 2016 aa24.35■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 CYTH3O43739 400 aa24.35■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 LAMC2Q13753 1193 aa24.35■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 KCNV1Q6PIU1 500 aa24.35■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 PPTC7Q8NI37 304 aa24.35■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 KAT2BQ92831 832 aa24.35■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 MAP3K14Q99558 947 aa24.35■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 CUL9Q8IWT3 2517 aa24.35■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 IQCF3P0C7M6 154 aa24.34■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 PGM5Q15124 567 aa24.34■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 VSIG10LQ86VR7 867 aa24.34■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 HOMER1Q86YM7 354 aa24.34■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 CCDC155Q8N6L0 562 aa24.34■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 RETREG2Q8NC44 543 aa24.34■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 CAGE1Q8TC20 777 aa24.34■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 PIGSQ96S52 555 aa24.34■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 KATNAL1Q9BW62 490 aa24.34■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 SENP2Q9HC62 589 aa24.34■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 NOD1Q9Y239 953 aa24.34■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa24.34■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 CHD7Q9P2D1 2997 aa24.34■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa24.33■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 RGS20O76081 388 aa24.33■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 F2P00734 622 aa24.33■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 ACTN1P12814 892 aa24.33■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 ANTXR2P58335 489 aa24.33■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 RBL2Q08999 1139 aa24.33■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 PTGISQ16647 500 aa24.33■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 CATIPQ7Z7H3 387 aa24.33■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa24.33■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 AFAP1L1Q8TED9 768 aa24.33■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 CTAGE1Q96RT6 745 aa24.33■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 SLC28A3Q9HAS3 691 aa24.33■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
LIMS1-208ENST00000428064 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 POLR2MP0CAP2 368 aa24.32■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 TGFB3P10600 412 aa24.32■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM67Q5HYA8 995 aa24.32■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 CHST3Q7LGC8 479 aa24.32■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa24.32■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa24.32■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 FRMPD4Q14CM0 1322 aa24.32■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 ZBBXA8MT70 800 aa24.31■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 HAS3O00219 553 aa24.31■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 DEFB128Q7Z7B8 93 aa24.31■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP24.31■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa24.31■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa24.31■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 SLC9A7Q96T83 725 aa24.31■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 PRDM12Q9H4Q4 367 aa24.31■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 DDAH1O94760 285 aa24.3■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 PARNO95453 639 aaKnown RBP24.3■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 SMARCA1P28370 1054 aa24.3■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 CCND2P30279 289 aa24.3■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 MYSM1Q5VVJ2 828 aa24.3■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 SPZ1Q9BXG8 430 aa24.3■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 LY9Q9HBG7 655 aa24.3■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 MYH7BA7E2Y1 1941 aa24.29■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 PPFIA4O75335 1185 aa24.29■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 STAM2O75886 525 aa24.29■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 BAIAP3O94812 1187 aa24.29■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 PSEN2P49810 448 aa24.29■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 USP38Q8NB14 1042 aa24.29■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 IL31RAQ8NI17 732 aa24.29■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 RABGGTBP53611 331 aa24.28■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 MFSD10Q14728 455 aa24.28■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF654Q8IZM8 581 aa24.28■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 C7orf31Q8N865 590 aa24.28■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 KIF5BP33176 963 aa24.27■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 CHMP4BP1P59074 171 aa24.27■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 ADGRE1Q14246 886 aa24.27■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 KIAA0753Q2KHM9 967 aa24.27■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 HSDL1Q3SXM5 330 aa24.27■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 PPP2R2DQ66LE6 453 aa24.27■■□□□ 1.48
LIMS1-208ENST00000428064 CASC1Q6TDU7 716 aa24.27■■□□□ 1.48
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