RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP20.89■□□□□ 0.936e-7■■□□□ 14.1
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPIRE1Q08AE8 756 aa20.83■□□□□ 0.93
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa20.83■□□□□ 0.93
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 GLIS3Q8NEA6 775 aa20.83■□□□□ 0.93
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACER1Q8TDN7 264 aa20.83■□□□□ 0.93
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NUP58Q9BVL2 599 aa20.83■□□□□ 0.93
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 MRFAP1Q9Y605 127 aa20.83■□□□□ 0.93
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIF13BQ9NQT8 1826 aa20.83■□□□□ 0.92
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIF5CO60282 957 aa20.82■□□□□ 0.92
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP20.82■□□□□ 0.92
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DPEP1P16444 411 aa20.82■□□□□ 0.92
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