RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
SH3BP5-204ENST00000412806 USP14P54578 494 aa24.22■■□□□ 1.47
SH3BP5-204ENST00000412806 AMPD3Q01432 767 aa24.22■■□□□ 1.47
SH3BP5-204ENST00000412806 STAT3P40763 770 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP5-204ENST00000412806 ASIC1P78348 528 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP5-204ENST00000412806 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
SH3BP5-204ENST00000412806 CYP2W1Q8TAV3 490 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP5-204ENST00000412806 WDR90Q96KV7 1748 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP5-204ENST00000412806 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
SH3BP5-204ENST00000412806 AS3MTQ9HBK9 375 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP5-204ENST00000412806 PICK1Q9NRD5 415 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP5-204ENST00000412806 INTS13Q9NVM9 706 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP5-204ENST00000412806 IMPACTQ9P2X3 320 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP5-204ENST00000412806 RWDD2AQ9UIY3 292 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP5-204ENST00000412806 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa24.21■■□□□ 1.47
SH3BP5-204ENST00000412806 FLOT1O75955 427 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF76P36508 570 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 BACE1P56817 501 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 SPIRE1Q08AE8 756 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 PAK1Q13153 545 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 SEMA3FQ13275 785 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 HYIQ5T013 277 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 LRRC8AQ8IWT6 810 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 NELFBQ8WX92 580 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 KLRG1Q96E93 195 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 MYMKA6NI61 221 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 MSH4O15457 936 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 ADSSL1Q8N142 457 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF280CQ8ND82 737 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 KIAA1524Q8TCG1 905 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa24.2■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 UBXN2AP68543 259 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 PDE4DQ08499 809 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 CDKAL1Q5VV42 579 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 CPXCR1Q8N123 301 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa24.19■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 CLEC4DQ8WXI8 215 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 FAM20AQ96MK3 541 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 EXOC1Q9NV70 894 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 OTOFQ9HC10 1997 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 PTPN21Q16825 1174 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 ZHX2Q9Y6X8 837 aa24.18■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 NFIBO00712 420 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 HSD17B4P51659 736 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 GSDMDP57764 484 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 PRKG1Q13976 671 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 DLK2Q6UY11 383 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 VSTM4Q8IW00 320 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 NT5C3AQ9H0P0 336 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 EHMT1Q9H9B1 1298 aa24.17■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 POTEB3A0JP26 581 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 POTECB2RU33 542 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 MED24O75448 989 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 NCAPH2Q6IBW4 605 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 POTEBQ6S5H4 581 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 KIAA1024Q9UPX6 916 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC26A4O43511 780 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 ALAS1P13196 640 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 HMGCS2P54868 508 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP24.16■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 C9orf131Q5VYM1 1079 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 DYMQ7RTS9 669 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 VAV3Q9UKW4 847 aa24.16■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 PTPRFP10586 1907 aa24.15■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 TRIM49BA6NDI0 452 aa24.15■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 E9PMD0 336 aa24.15■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 USP2O75604 605 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 FCER1AP12319 257 aa24.15■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 STK4Q13043 487 aa24.15■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 MUM1L1Q5H9M0 696 aa24.15■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 UNC13DQ70J99 1090 aa24.15■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 COL20A1Q9P218 1284 aa24.15■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 PMS1P54277 932 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 ARMCX5Q6P1M9 558 aa24.14■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP24.14■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 ATG4CQ96DT6 458 aa24.14■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 WNK4Q96J92 1243 aa24.14■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 C12orf42Q96LP6 360 aa24.14■■□□□ 1.46
SH3BP5-204ENST00000412806 A0A1B0GTH6 734 aa24.14■■□□□ 1.45
SH3BP5-204ENST00000412806 STIM1Q13586 685 aa24.14■■□□□ 1.45
SH3BP5-204ENST00000412806 HAUS3Q68CZ6 603 aa24.14■■□□□ 1.45
SH3BP5-204ENST00000412806 CNNM4Q6P4Q7 775 aa24.14■■□□□ 1.45
SH3BP5-204ENST00000412806 DDX12PQ92771 950 aa24.14■■□□□ 1.45
SH3BP5-204ENST00000412806 HPS3Q969F9 1004 aa24.14■■□□□ 1.45
SH3BP5-204ENST00000412806 LRRC27Q9C0I9 530 aa24.14■■□□□ 1.45
SH3BP5-204ENST00000412806 HOMER2Q9NSB8 354 aa24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms