RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395038.6

SOS1-201, Transcript of SOS Ras/Rac guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene SOS1, Length 4,123 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1-201ENST00000395038 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 TXLNBQ8N3L3 684 aa7□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 SH2D4AQ9H788 454 aa7□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 VIPAS39Q9H9C1 493 aa7□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa7□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 ADRA2BP18089 450 aa7□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 LRRC63Q05C16 580 aa7□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 ZNF543Q08ER8 600 aa7□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 KCNMA1Q12791 1236 aa7□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 MAN2A1Q16706 1144 aa7□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 KIAA1328Q86T90 577 aa7□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 CERS5Q8N5B7 392 aa7□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa7□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 NGLY1Q96IV0 654 aa7□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa7□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 GBP3Q9H0R5 595 aa7□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa7□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 MYO3BQ8WXR4 1341 aa7□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 UBAP1LF5GYI3 381 aa6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 TULP2O00295 520 aa6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 PJA2O43164 708 aa6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 SYF2O95926 243 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 MYBL2P10244 700 aa6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 SHMT1P34896 483 aa6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 HGSNATQ68CP4 663 aa6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 DYMQ7RTS9 669 aa6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 ADGRF4Q8IZF3 695 aa6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 DDX12PQ92771 950 aa6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 KIF13BQ9NQT8 1826 aa6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 BBOX1O75936 387 aa6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 SERPINB2P05120 415 aa6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 DDR1Q08345 913 aa6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 UBE2SQ16763 222 aa6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 FKBP15Q5T1M5 1219 aa6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 SLF2Q8IX21 1173 aa6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 SALL4Q9UJQ4 1053 aa6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 FAN1Q9Y2M0 1017 aa6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 LRRC53A6NM62 1247 aa6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 NOL4O94818 638 aa6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 PRLRP16471 622 aa6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 KIF11P52732 1056 aa6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 ITIH3Q06033 890 aa6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 PSMD2Q13200 908 aa6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 TTBK2Q6IQ55 1244 aa6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 GJA10Q969M2 543 aa6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 CAPZA3Q96KX2 299 aa6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 CRAMP1Q96RY5 1269 aa6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 TSGA10Q9BZW7 698 aa6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 MLXIPQ9HAP2 919 aa6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 HPCAL4Q9UM19 191 aa6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 SNX12Q9UMY4 172 aa6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 MACROD2A1Z1Q3 448 aa6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 PDXDC1Q6P996 788 aa6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 FAM71BQ8TC56 605 aa6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 SNX29Q8TEQ0 813 aa6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 GPCPD1Q9NPB8 672 aa6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 TLR2O60603 784 aa6.98□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 TTLL1O95922 423 aa6.98□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 MARSP56192 900 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 EIF6P56537 245 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 COASYQ13057 564 aa6.98□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 LRRC41Q15345 812 aa6.98□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 TMEM266Q2M3C6 531 aa6.98□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 C2CD5Q86YS7 1000 aa6.98□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 MMGT1Q8N4V1 131 aa6.98□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 CCDC155Q8N6L0 562 aa6.98□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 COG1Q8WTW3 980 aa6.98□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 CCDC42Q96M95 316 aa6.98□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 MBOAT7Q96N66 472 aa6.98□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 VPS18Q9P253 973 aa6.98□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 MYH10P35580 1976 aa6.98□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 RPS6KA5O75582 802 aa6.98□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 IDEP14735 1019 aa6.98□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 KIF5AQ12840 1032 aa6.98□□□□□ -1.29
SOS1-201ENST00000395038 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms